Phương pháp TNDO (typed neglect of differential overlap) là phương
pháp bán thực nghiệm tham số hóa đặc biệt để để tính toán độ dịch chuyển
hóa học của phổ NMR. Sự tham số hoá này đi cao hơn các phương pháp bán
thực nghiệm khác là phân biệt giữa các nguyên tử của cùng một nguyên tố
nhưng lai hóa khác nhau.Ví dụ, các tham số khác nhau được sử dụng để mô tả
một carbon sp2 và carbon sp3. ó hai phiên bản của phương pháp này: TNDO/1
và TNDO/2.
244 trang |
Chia sẻ: tueminh09 | Ngày: 21/01/2022 | Lượt xem: 483 | Lượt tải: 0
Bạn đang xem trước 20 trang tài liệu Luận án Thiết kế, sàng lọc một số dẫn xuất flavonoid, đánh giá hoạt tính gây độc lên dòng tế bào Hela dựa vào các tính toán hóa lượng tử, để xem tài liệu hoàn chỉnh bạn click vào nút DOWNLOAD ở trên
8,7620 6,2039
fla19 2,4974 1,8357 1,2819 1,6241 4,1854 0,3090 15,2098 8,8617 6,3448
fla20 2,6454 1,8520 1,3227 1,5395 4,2699 0,3090 16,2401 9,2850 6,5664
fla21 2,7974 1,9892 1,2846 1,2674 3,7499 0,3328 15,8702 9,1719 6,3269
fla22 2,8890 2,0055 1,3404 1,5560 4,1582 0,3141 16,1708 9,2715 6,4677
fla23 2,9807 2,0940 1,3589 1,4715 4,2427 0,3141 17,2011 9,6949 6,6894
fla24 2,4925 1,8663 1,2344 1,4092 3,6680 0,3277 14,9092 8,7691 6,2003
fla25 2,6892 1,9880 1,3286 1,6979 4,0275 0,3090 16,1708 9,2596 6,5150
fla26 2,7809 2,0723 1,3693 1,6134 4,1120 0,3090 17,2011 9,6830 6,7366
fla27 2,5901 1,9422 1,3123 1,4092 3,6152 0,3277 15,8702 9,1599 6,3741
fla28 2,6785 1,9798 1,3358 1,6979 4,0235 0,3090 16,1708 9,2596 6,5150
fla29 2,7701 2,0642 1,3766 1,6134 4,1080 0,3090 17,2011 9,6830 6,7366
fla30 2,6009 1,8849 1,2957 1,3354 3,7283 0,3277 15,8702 9,1528 6,3777
fla31 2,6893 1,9226 1,3192 1,6241 4,1366 0,3090 16,1708 9,2525 6,5186
fla32 2,7809 2,0069 1,3600 1,5395 4,2211 0,3090 17,2011 9,6759 6,7402
CYNA 3,0496 2,3056 1,6305 2,6687 6,8166 0,2245 16,3214 9,4969 7,3091
LUTE 1,8085 1,2382 0,7968 1,8426 4,0566 0,1792 10,5695 5,9769 4,5164
KEM1 2,1192 1,1889 0,8336 1,7221 3,9473 0,1842 11,5305 6,3716 4,6785
KAEM2 3,9464 2,8367 2,0685 3,4056 6,7122 0,2296 19,9057 11,1273 8,4405
QUER 1,8037 1,2351 0,7568 1,9612 4,7464 0,1690 10,9393 6,1231 4,6504
DAID 2,7521 2,0727 1,4683 2,2014 5,9070 0,2523 15,5817 9,2093 6,9985
160
Phụ lục 10c. Tham số 2D, 3D của các dẫn xuất flavone và isoflavone
HC xvp3 xvp4 xvp5 xvp6 xvp7 xvp8 xvp9 xvp10 xvc3
fla1 3,3882 2,2411 1,5731 0,8571 0,5334 0,3141 0,1764 0,0828 0,5256
fla2 3,3753 2,1865 1,5451 0,8145 0,5032 0,3040 0,1775 0,0900 0,5584
fla3 3,3774 2,1865 1,5252 0,8257 0,5048 0,2996 0,1841 0,0878 0,5584
fla4 3,4493 2,2320 1,5444 0,8206 0,5046 0,3045 0,1788 0,0886 0,5638
fla5 3,4647 2,3944 1,5982 0,8690 0,5454 0,3252 0,1845 0,0888 0,5256
fla6 3,4517 2,3398 1,5702 0,8262 0,5177 0,3116 0,1830 0,0955 0,5584
fla7 3,4538 2,3398 1,5503 0,8375 0,5192 0,3072 0,1892 0,0923 0,5584
fla8 3,5257 2,3854 1,5695 0,8323 0,5190 0,3122 0,1840 0,0934 0,5638
fla9 4,3731 2,9766 2,0192 1,0333 0,6496 0,3836 0,2268 0,1220 0,5299
fla10 4,4435 2,9883 2,0390 1,0714 0,6545 0,3831 0,2280 0,1233 0,5929
fla11 4,6893 3,1295 2,1124 1,1493 0,7177 0,4001 0,2333 0,1286 0,5980
fla12 4,3602 2,9220 1,9856 1,0075 0,6186 0,3619 0,2204 0,1220 0,5627
fla13 4,4306 2,9338 2,0054 1,0456 0,6235 0,3611 0,2226 0,1226 0,6257
fla14 4,6764 3,0749 2,0788 1,1235 0,6867 0,3781 0,2280 0,1285 0,6308
fla15 4,3622 2,9220 1,9657 1,0187 0,6211 0,3584 0,2203 0,1236 0,5627
fla16 4,4327 2,9338 1,9854 1,0568 0,6260 0,3576 0,2225 0,1242 0,6257
fla17 4,6785 3,0749 2,0589 1,1347 0,6892 0,3746 0,2278 0,1301 0,6308
fla18 4,4341 2,9676 1,9849 1,0135 0,6209 0,3630 0,2169 0,1220 0,5681
fla19 4,5046 2,9793 2,0047 1,0517 0,6258 0,3622 0,2191 0,1227 0,6311
fla20 4,7504 3,1204 2,0782 1,1296 0,6890 0,3792 0,2244 0,1286 0,6361
fla21 4,4539 3,0793 2,0941 1,0739 0,6782 0,4043 0,2408 0,1280 0,5299
fla22 4,5243 3,0910 2,1138 1,1123 0,6803 0,4083 0,2411 0,1293 0,5929
fla23 4,7701 3,2321 2,1873 1,1902 0,7435 0,4251 0,2526 0,1346 0,5980
fla24 4,3602 2,9220 1,9856 1,0075 0,6186 0,3619 0,2204 0,1220 0,5627
fla25 4,5114 3,0364 2,0803 1,0863 0,6517 0,3828 0,2332 0,1280 0,6257
fla26 4,7572 3,1775 2,1537 1,1642 0,7149 0,3997 0,2447 0,1339 0,6308
fla27 4,4430 3,0247 2,0406 1,0592 0,6521 0,3756 0,2313 0,1282 0,5627
fla28 4,5134 3,0364 2,0603 1,0975 0,6543 0,3793 0,2327 0,1288 0,6257
fla29 4,7592 3,1776 2,1338 1,1754 0,7174 0,3962 0,2443 0,1347 0,6308
fla30 4,5149 3,0702 2,0598 1,0540 0,6519 0,3802 0,2279 0,1268 0,5681
fla31 4,5853 3,0819 2,0796 1,0924 0,6541 0,3839 0,2293 0,1275 0,6311
fla32 4,8311 3,2231 2,1531 1,1703 0,7172 0,4008 0,2409 0,1333 0,6361
CYNA 5,1440 3,4293 2,2712 1,2881 0,7165 0,4256 0,2635 0,1528 0,9943
LUTE 3,0546 2,0729 1,3590 0,7590 0,4060 0,2333 0,1339 0,0658 0,5908
KEM1 3,2513 2,2565 1,5076 0,8475 0,4610 0,2753 0,1388 0,0688 0,5715
KAEM2 5,6381 4,0553 2,8046 1,5742 0,9481 0,5703 0,3428 0,1953 1,1730
QUER 3,1730 2,1355 1,4097 0,7736 0,4248 0,2324 0,1299 0,0627 0,6309
DAID 5,0251 3,3211 2,2474 1,2284 0,6947 0,4105 0,2528 0,1458 0,8902
161
Phụ lục 10d. Tham số 2D, 3D của các dẫn xuất flavone và isoflavone
HC xvpc4 ABSQ ABSQon Dipole MaxHp MaxNeg MaxQp Ovality
fla1 0,9734 3,8385 1,4790 6,1796 0,2193 -0,3921 0,2193 1,5982
fla2 0,9603 3,7043 1,5376 8,0858 0,2193 -0,4050 0,2193 1,7309
fla3 0,9613 3,7278 1,5375 5,9397 0,2193 -0,4050 0,2193 1,6777
fla4 1,0363 3,7314 1,5445 5,6574 0,2193 -0,4043 0,2193 1,7187
fla5 0,9672 3,8088 1,4642 5,2716 0,0717 -0,3921 0,1955 1,6329
fla6 0,9541 3,6745 1,5227 7,1274 0,1094 -0,4050 0,1603 1,7660
fla7 0,9551 3,6981 1,5226 4,4376 0,1094 -0,4050 0,1602 1,7245
fla8 1,0301 3,7016 1,5296 4,3371 0,1023 -0,4043 0,1675 1,7569
fla9 1,1895 4,3686 1,4729 5,4187 0,2194 -0,3921 0,2194 1,6482
fla10 1,2622 4,5444 1,4717 7,2526 0,2194 -0,3921 0,2194 1,6533
fla11 1,3361 4,7856 1,8530 8,0366 0,2194 -0,3921 0,2194 1,7029
fla12 1,1763 4,2340 1,5314 6,0955 0,2194 -0,4050 0,2194 1,7439
fla13 1,2491 4,4099 1,5303 8,0687 0,2194 -0,4050 0,2194 1,7545
fla14 1,3229 4,6508 1,9119 8,3968 0,2194 -0,4050 0,2194 1,7948
fla15 1,1774 4,2576 1,5313 3,1659 0,2194 -0,4050 0,2194 1,7422
fla16 1,2501 4,4335 1,5302 3,9789 0,2194 -0,4050 0,2194 1,7375
fla17 1,3240 4,6744 1,9118 4,8887 0,2194 -0,4050 0,2194 1,7706
fla18 1,2524 4,2611 1,5383 3,2984 0,2194 -0,4043 0,2194 1,7182
fla19 1,3251 4,4370 1,5372 4,5294 0,2194 -0,4043 0,2194 1,7313
fla20 1,3990 4,6779 1,9188 5,3592 0,2194 -0,4043 0,2194 1,7957
fla21 1,1864 4,3389 1,4580 4,1934 0,0717 -0,3921 0,1955 1,6917
fla22 1,2591 4,5147 1,4569 6,2547 0,0717 -0,3921 0,1955 1,7002
fla23 1,3330 4,7559 1,8381 5,9079 0,0727 -0,3921 0,1955 1,6970
fla24 1,1763 4,2340 1,5314 6,0955 0,2194 -0,4050 0,2194 1,7439
fla25 1,2460 4,3802 1,5155 7,6373 0,1094 -0,4050 0,1603 1,7953
fla26 1,3199 4,6210 1,8971 7,9833 0,1094 -0,4050 0,1603 1,8383
fla27 1,1743 4,2279 1,5165 3,0914 0,1094 -0,4050 0,1602 1,7364
fla28 1,2470 4,4038 1,5154 4,5067 0,1094 -0,4050 0,1602 1,7388
fla29 1,3209 4,6446 1,8970 5,0137 0,1094 -0,4050 0,1602 1,8159
fla30 1,2493 4,2314 1,5234 2,5971 0,1023 -0,4043 0,1675 1,7774
fla31 1,3220 4,4073 1,5223 4,6180 0,1023 -0,4043 0,1675 1,7866
fla32 1,3959 4,6482 1,9039 5,0940 0,1023 -0,4043 0,1675 1,8398
CYNA 1,9313 8,2271 4,0815 3,1683 0,2101 -0,4034 0,2101 1,8285
LUTE 1,0655 4,5338 2,2335 1,3426 0,1755 -0,4034 0,1755 1,5373
KEM1 1,1015 4,5913 2,1548 4,3692 0,1776 -0,3933 0,2102 1,5684
KAEM2 2,0875 8,2078 4,1640 12,5381 0,2100 -0,4045 0,2440 1,8540
QUER 1,1726 5,1736 2,5479 5,9484 0,1973 -0,3890 0,2086 1,5559
DAID 1,8112 6,9913 3,3528 1,1196 0,2101 -0,4042 0,2101 1,7843
162
Phụ lục 10e. Tham số 2D, 3D của các dẫn xuất flavone và isoflavone
HC Polarizability SpcPolarizability Surface Volume xvch6 SdsCH SaaCH
fla1 5,8050 0,0205 333,3331 283,2407 0,0726 0,0000 16,2847
fla2 5,8050 0,0193 376,0768 301,1595 0,0709 1,4741 14,4994
fla3 5,8050 0,0204 350,5764 284,0417 0,0709 1,4869 14,4439
fla4 5,8050 0,0195 370,6593 297,7988 0,0709 1,4625 14,4005
fla5 6,5790 0,0221 351,5565 297,0492 0,0726 0,0000 16,5186
fla6 6,5790 0,0206 398,7162 318,9987 0,0709 1,4991 14,7067
fla7 6,5790 0,0218 375,2085 301,7779 0,0709 1,5075 14,6621
fla8 6,5790 0,0209 393,3637 315,0381 0,0709 1,4875 14,6078
fla9 6,5790 0,0208 369,4536 315,5677 0,1047 0,0000 25,4665
fla10 6,4880 0,0203 373,5784 319,3890 0,1004 0,0000 21,4513
fla11 7,3530 0,0223 392,7971 329,4254 0,1004 0,0000 23,2599
fla12 6,5790 0,0215 382,5937 305,5504 0,1029 1,4782 23,7859
fla13 6,4880 0,0209 388,9135 310,3409 0,0986 1,4450 19,8044
fla14 7,3530 0,0223 414,4890 329,9914 0,0986 1,4716 21,5743
fla15 6,5790 0,0195 408,6353 337,7878 0,1029 1,4902 23,7547
fla16 6,4880 0,0196 401,6805 330,5313 0,0986 1,4616 19,7569
fla17 7,3530 0,0234 396,2264 314,7684 0,0986 1,4845 21,5373
fla18 6,5790 0,0214 378,1292 306,9938 0,1029 1,4666 23,7053
fla19 6,4880 0,0208 385,0502 311,8765 0,0986 1,4334 19,7211
fla20 7,3530 0,0223 414,3353 329,5624 0,0986 1,4601 21,4910
fla21 7,3530 0,0211 405,2733 348,6615 0,1047 0,0000 26,0903
fla22 7,2620 0,0206 410,7555 353,1085 0,1004 0,0000 22,0241
fla23 8,1270 0,0246 392,5103 330,7671 0,1004 0,0000 23,8327
fla24 6,5790 0,0215 382,5937 305,5504 0,1029 1,4782 23,7859
fla25 7,2620 0,0220 414,1577 329,4795 0,0986 1,4700 20,3506
fla26 8,1270 0,0233 440,1802 348,4047 0,0986 1,4966 22,1205
fla27 7,3530 0,0240 381,7659 306,5485 0,1029 1,5109 24,3628
fla28 7,2620 0,0212 411,7310 342,6333 0,0986 1,4822 20,3139
fla29 8,1270 0,0244 421,6354 332,6838 0,0986 1,5052 22,0943
fla30 7,3530 0,0225 407,4250 326,3386 0,1029 1,4916 24,3025
fla31 7,2620 0,0219 413,4352 331,0153 0,0986 1,4584 20,2673
fla32 8,1270 0,0233 440,4050 348,2668 0,0986 1,4851 22,0372
CYNA 7,7400 0,0211 453,6429 367,4498 0,0858 1,1032 6,1253
LUTE 3,8700 0,0186 261,0753 208,1012 0,0596 1,1577 6,2125
KEM1 4,6440 0,0202 284,5858 229,8373 0,0614 0,0000 8,2974
KAEM2 9,2880 0,0224 498,6732 414,7864 0,0876 0,0000 7,5773
QUER 3,8700 0,0179 271,2661 216,4776 0,0576 0,0000 5,6409
DAID 7,7400 0,0243 402,8370 318,9727 0,0928 1,3003 10,5331
163
Phụ lục 10f. Tham số 2D, 3D của các dẫn xuất flavone và isoflavone
HC SdssC SaasC SdO k0 k1 k2 k3 ka1
fla1 0,5750 1,6814 12,7361 30,1156 17,8112 8,3927 4,1588 15,3016
fla2 0,8330 2,3045 12,3401 30,1156 17,8112 8,3927 4,5455 15,3016
fla3 0,8497 2,3120 12,2436 30,1156 17,8112 8,3927 4,5455 15,3016
fla4 0,8871 2,2976 12,5996 30,1156 17,8112 8,3927 4,3457 15,3016
fla5 0,9862 1,7789 12,8369 31,9209 18,7811 9,0873 4,6012 16,2646
fla6 1,1359 2,4450 12,4064 31,9209 18,7811 9,0873 5,0193 16,2646
fla7 1,1511 2,4555 12,2990 31,9209 18,7811 9,0873 5,0193 16,2646
fla8 1,1847 2,4381 12,6550 31,9209 18,7811 9,0873 4,8034 16,2646
fla9 0,4675 2,3437 13,0726 38,1122 21,2404 10,3469 5,0238 18,0053
fla10 0,1135 1,5631 13,0677 40,0013 22,2031 10,5434 5,2578 18,8922
fla11 0,3684 2,9209 13,1396 41,9054 23,1680 11,2277 5,5068 19,8774
fla12 0,7661 3,0072 12,5616 38,1122 21,2404 10,3469 5,3890 18,0053
fla13 0,5319 2,1990 12,5580 40,0013 22,2031 10,5434 5,6266 18,8922
fla14 0,7009 3,5928 12,6101 41,9054 23,1680 11,2277 5,8800 19,8774
fla15 0,7832 3,0189 12,4286 38,1122 21,2404 10,3469 5,3890 18,0053
fla16 0,5503 2,2093 12,4255 40,0013 22,2031 10,5434 5,6266 18,8922
fla17 0,7184 3,6058 12,4706 41,9054 23,1680 11,2277 5,8800 19,8774
fla18 0,8222 3,0068 12,7846 38,1122 21,2404 10,3469 5,2016 18,0053
fla19 0,5941 2,2017 12,7815 40,0013 22,2031 10,5434 5,4375 18,8922
fla20 0,7587 3,5954 12,8267 41,9054 23,1680 11,2277 5,6888 19,8774
fla21 0,8787 2,5840 13,1734 40,0013 22,2031 11,0395 5,4375 18,9590
fla22 0,5247 1,8493 13,1685 41,9054 23,1680 11,2277 5,6888 19,8487
fla23 0,7796 3,2070 13,2404 43,8240 24,1349 11,9234 5,9259 20,8367
fla24 0,7661 3,0072 12,5616 38,1122 21,2404 10,3469 5,3890 18,0053
fla25 0,8347 2,5283 12,6243 41,9054 23,1680 11,2277 6,0810 19,8487
fla26 1,0037 3,9221 12,6764 43,8240 24,1349 11,9234 6,3209 20,8367
fla27 1,0847 3,3053 12,4840 40,0013 22,2031 11,0395 5,8258 18,9590
fla28 0,8517 2,5415 12,4809 41,9054 23,1680 11,2277 6,0810 19,8487
fla29 1,0198 3,9380 12,5260 43,8240 24,1349 11,9234 6,3209 20,8367
fla30 1,1198 3,2902 12,8400 40,0013 22,2031 11,0395 5,6266 18,9590
fla31 0,8917 2,5309 12,8369 41,9054 23,1680 11,2277 5,8800 19,8487
fla32 1,0563 3,9247 12,8821 43,8240 24,1349 11,9234 6,1186 20,8367
CYNA -0,5621 -1,3488 12,5338 48,1648 25,1037 10,3180 5,1775 22,6371
LUTE -0,3573 -0,9230 12,0433 27,7666 15,8790 6,2457 3,2000 13,6247
KEM1 -0,4782 -0,0737 12,4767 28,3292 16,8438 6,8571 3,2986 14,5816
KAEM2 -3,0291 -1,2350 36,8317 56,8193 29,9700 12,6688 6,8402 26,8807
QUER -1,9188 -1,9610 12,1429 29,5333 16,8438 6,4815 3,1653 14,5432
DAID 0,0476 1,3775 12,8115 43,1095 23,1680 9,8681 4,8595 20,7887
164
Phụ lục 10g. Tham số 2D, 3D của các dẫn xuất flavone và isoflavone
HC ka2 ka3 Hother Hmax Gmax Hmin
fla1 6,6616 3,1183 14,2173 2,6945 12,7361 0,7651
fla2 6,6616 3,4269 14,4907 2,6663 12,3401 0,7261
fla3 6,6616 3,4269 14,5027 2,6681 12,2436 0,7284
fla4 6,6616 3,2671 14,5290 2,6655 12,5996 0,7251
fla5 7,3138 3,5128 15,0379 1,4629 12,8369 0,7731
fla6 7,3138 3,8520 15,2898 1,6012 12,4064 0,7341
fla7 7,3138 3,8520 15,3037 1,6105 12,2990 0,7364
fla8 7,3138 3,6766 15,3275 1,6349 12,6550 0,7331
fla9 8,1029 3,7080 20,4449 2,7803 13,0726 1,2384
fla10 8,2804 3,9037 19,9245 2,8069 13,1594 1,2698
fla11 8,9391 4,1515 20,5388 2,8015 13,1396 0,7720
fla12 8,1029 3,9952 20,6396 2,7521 12,5616 1,2105
fla13 8,2804 4,1952 20,1308 2,7787 13,0557 1,2284
fla14 8,9391 4,4502 20,7357 2,7733 12,6101 0,7618
fla15 8,1029 3,9952 20,6628 2,7539 12,4286 1,2148
fla16 8,2804 4,1952 20,1554 2,7805 13,0715 1,2351
fla17 8,9391 4,4502 20,7607 2,7751 12,4706 0,7625
fla18 8,1029 3,8476 20,6756 2,7514 12,7846 1,2091
fla19 8,2804 4,0455 20,1673 2,7779 13,0530 1,2298
fla20 8,9391 4,2970 20,7719 2,7726 12,8267 0,7614
fla21 8,7502 4,0720 21,3403 1,4906 13,1734 0,8496
fla22 8,9197 4,2855 20,8378 1,5168 13,2725 0,8706
fla23 9,5928 4,5240 21,4499 1,5001 13,2404 0,7740
fla24 8,1029 3,9952 20,6396 2,7521 12,5616 1,2105
fla25 8,9197 4,5997 21,0226 1,6507 13,1688 0,8495
fla26 9,5928 4,8437 21,6253 1,6473 12,6764 0,7638
fla27 8,7502 4,3815 21,5386 1,6554 12,4840 0,8299
fla28 8,9197 4,5997 21,0490 1,6724 13,1846 0,8509
fla29 9,5928 4,8437 21,6521 1,6691 12,5260 0,7645
fla30 8,7502 4,2225 21,5489 1,6576 12,8400 0,8279
fla31 8,9197 4,4384 21,0585 1,6676 13,1661 0,8489
fla32 9,5928 4,6797 21,6609 1,6657 12,8821 0,7634
CYNA 8,7667 4,2537 17,7797 2,8630 12,5338 1,0768
LUTE 4,8846 2,3765 9,3564 2,7601 12,0433 1,4778
KEM1 5,4501 2,4890 9,9728 2,7856 12,4767 0,9032
KAEM2 10,6711 5,5727 19,9921 2,8841 13,5259 0,8773
QUER 5,1089 2,3710 7,8932 2,8701 12,1429 1,5111
DAID 8,3415 3,9613 20,0342 2,7582 12,8115 1,0526
165
Phụ lục 10h. Tham số 2D, 3D của các dẫn xuất flavone và isoflavone
Name Gmin Hmaxpos fw phia knotp knotpv LogP
fla1 -0,2533 2,6945 309,3214 4,4319 -2,0772 -0,4477 3,5667
fla2 -0,1360 2,6663 309,3214 4,4319 -1,8046 -0,4018 3,5771
fla3 -0,1067 2,6681 309,3214 4,4319 -1,8006 -0,4028 3,5789
fla4 -0,0860 2,6655 309,3214 4,4319 -1,9875 -0,4725 3,5527
fla5 -0,2075 1,4629 323,3483 4,9565 -1,9927 -0,4416 3,3597
fla6 -0,1085 1,6012 323,3483 4,9565 -1,7201 -0,3957 3,6291
fla7 -0,0845 1,6105 323,3483 4,9565 -1,7161 -0,3967 3,6037
fla8 -0,0638 1,6349 323,3483 4,9565 -1,9030 -0,4663 3,6386
fla9 -0,2722 2,7803 371,3923 5,2105 -2,5314 -0,6595 4,6313
fla10 -0,4088 2,8069 389,3828 5,3943 -2,6510 -0,6693 4,4724
fla11 -0,2891 2,8015 401,4185 5,9229 -2,8201 -0,7381 4,6684
fla12 -0,1485 2,7521 371,3923 5,2105 -2,2588 -0,6136 4,6181
fla13 -0,3860 2,7787 389,3828 5,3943 -2,3783 -0,6234 4,6932
fla14 -0,1604 2,7733 401,4185 5,9229 -2,5475 -0,6922 4,6413
fla15 -0,1171 2,7539 371,3923 5,2105 -2,2548 -0,6146 4,5401
fla16 -0,3836 2,7805 389,3828 5,3943 -2,3744 -0,6244 4,6469
fla17 -0,1273 2,7751 401,4185 5,9229 -2,5435 -0,6932 4,5471
fla18 -0,0964 2,7514 371,3923 5,2105 -2,4417 -0,6843 4,5021
fla19 -0,3830 2,7779 389,3828 5,3943 -2,5613 -0,6941 4,6616
fla20 -0,1066 2,7726 401,4185 5,9229 -2,7304 -0,7629 4,5404
fla21 -0,2264 1,4906 385,4192 5,7205 -2,4826 -0,6565 3,7509
fla22 -0,3630 1,5168 403,4096 5,9015 -2,6021 -0,6662 3,6648
fla23 -0,2433 1,5001 415,4454 6,4478 -2,7712 -0,7350 3,7660
fla24 -0,1485 2,7521 371,3923 5,2105 -2,2588 -0,6136 4,6181
fla25 -0,3402 1,6507 403,4096 5,9015 -2,3295 -0,6203 4,0615
fla26 -0,1329 1,6473 415,4454 6,4478 -2,4986 -0,6891 4,2235
fla27 -0,0948 1,6554 385,4192 5,7205 -2,2060 -0,6116 4,1496
fla28 -0,3378 1,6724 403,4096 5,9015 -2,3256 -0,6213 4,0111
fla29 -0,1051 1,6691 415,4454 6,4478 -2,4947 -0,6901 4,1865
fla30 -0,0741 1,6576 385,4192 5,7205 -2,3929 -0,6812 4,1772
fla31 -0,3372 1,6676 403,4096 5,9015 -2,5125 -0,6910 4,0687
fla32 -0,0844 1,6657 415,4454 6,4478 -2,6816 -0,7598 4,2308
CYNA -1,6769 2,8630 448,3832 6,2016 -4,1478 -0,9370 0,7696
LUTE -0,4895 2,7601 286,2408 3,1691 -2,2140 -0,4747 2,7887
KEM1 -0,5516 2,7856 300,2677 3,6123 -2,2252 -0,5300 3,4560
KAEM2 -1,5866 2,8841 516,4584 7,7526 -3,3066 -0,9145 1,4743
QUER -0,8877 2,8701 302,2402 3,3773 -2,7852 -0,5417 2,6359
DAID -1,5628 2,7582 416,3844 5,7803 -3,7055 -0,9210 1,0960
166
Phụ lục 11. Định Danh thực vật chiết xuất
167
168
169
170
171
Phụ lục 12. Thử hoạt tính khánh ung thư cổ tử cung (HeLa)
172
173
Phụ lục 13. phổ 1H-NMR CSL1
Phụ lục 14. phổ DEPT CSL1
174
Phụ lục 15. Phổ 13C-NMR CSL1
175
Phụ lục 16. Phổ HMBC CSL1
176
Phụ lục 17. Phổ HSQC CSL1
177
Phụ lục 18. Phổ 1H-NMR GML1
178
Phụ lục 19. Phổ 13C-NMR GML1
179
Phụ lục 20. Phổ DEPT GML1
180
Phụ lục 21. Phổ HMBC GML1
181
Phụ lục 22. Phổ HSQC GML1
182
Phụ lục 24. Phổ 1H-NMR AIL1
183
Phụ lục 25. Phổ 13C-NMR AIL1
184
Phụ lục 26. Phổ DEPT AIL1
185
Phụ lục 27. Phổ HSQC AIL1
186
Phụ lục 28. Phổ HMBC của AIL1
187
Phụ lục 29. 1H-NMR của POL1
188
Phụ lục 30. Phổ 13C-NMR của POL1
189
Phụ lục. 31 Phổ DEPT của POL1
190
Phụ lục 32. Phổ HMBC của POL1
191
Phụ lục 33. Phổ HSQC của POL1
192
Phụ lục 34. Phổ 1H-NMR ZZL1
193
Phụ lục 35. Phổ 13C-NMR ZZL1
194
Phụ lục 36. Phổ DEPT ZZL1
195
Phụ lục 37. Phổ HMBC ZZL1
196
Phụ lục 38. Phổ HSQC ZZL1
197
Phụ lục 39. Phổ 1H-NMR ZZL2
198
Phụ lục 40. Phổ 13C-NMR ZZL2
199
Phụ lục 41. Phổ DEPT ZZL2
200
Phụ lục 42. Phổ HMBC ZZL2
201
Phụ lục 43. Phổ HSQC ZZL2
202
Phụ lục 44. Dữ liệu cấu trúc tinh thể GML1
Tham số Dư liệu
Công thức phân tử C21H15O11
Khối lượng phân tủ 443,33
ToK 100
Hệ tinh thể monoclinic
Nhóm không gian P21
a/Å 14,6876(11)
b/Å 4,3568(3)
c/Å 17,3072(11)
α/° 90
β/° 111,658(3)
γ/° 90
Thể tích/Å3 1029,32(13)
Z 2
Tỉ khối tính toán ρcalcg/cm3 1,43
Hệ số hấp thu μ/mm-1 0,118
F(000) 458
Kích thước tinh thể/mm3 0,1 × 0,05 × 0,05
Bức xạ MoKα (λ = 0,71073)
Phạm vi thu thập dữ liệu 2Θ /° 5,968 to 64,054
Chỉ số index -21 ≤ h ≤ 20, -6 ≤ k ≤ 6, -25 ≤ l ≤ 25
Số phản xạ đo được 25478
Số phản xạ độc lập 6681 [Rint = 0,0399, Rsigma = 0,0506]
Dữ liệu/giới hạn/tham số 6681/1/300
Hệ số phù hợp mô hình F2 1,022
Độ sai lệch [I>=2σ (I)] R1 = 0,0454, wR2 = 0,0962
Độ sai lệch tổng cộng R R1 = 0,0675, wR2 = 0,1049
Mật độ đỉnh/lỗ / e Å-3 0,48/-0,39
Tham số Flack -0,1(3)
203
Phụ lục 45. Tọa độ các nguyên tử (Å2×103) trong phân tử GML1
Nguyên
tố
x y z U(eq)
C1 6784,2(15) 6651(5) 4394,3(12) 13,4(4)
C2 7530,0(16) 4966(6) 4954,6(13) 19,8(5)
C3 7502,7(16) 4507(6) 5741,4(13) 19,4(5)
O4 8270,0(13) 2864(6) 6278,7(10) 35,5(5)
C5 8308,2(18) 2414(7) 7066,4(14) 29,9(6)
C6 7627,0(16) 3319(6) 7363,0(12) 17,7(5)
C7 6751,4(15) 4914(5) 6808,4(12) 13,2(4)
O8 6054,2(11) 5635(4) 7008,3(9) 16,4(3)
C9 6759,7(15) 5634(5) 5983,0(12) 13,9(4)
C10 6022,1(15) 7390(5) 5395,8(12) 14,3(4)
C11 6030,7(15) 7906(5) 4611,7(12) 14,4(4)
O12 6717,3(11) 7286(4) 3596,4(8) 14,3(3)
C13 7271,2(14) 5460(5) 3257,5(11) 11,4(4)
C14 6882,9(14) 6152(5) 2325,0(11) 11,5(4)
O15 5909,6(10) 5077(4) 1923,3(9) 13,6(3)
C16 7526,6(14) 4733(5) 1899,5(11) 11,3(4)
O17 7287,6(11) 6027(4) 1088,6(8) 15,8(3)
C18 8611,7(14) 5320(5) 2388,4(11) 12,1(4)
O19 9242,9(11) 3547(4) 2110,4(9) 18,8(3)
C20 8858,6(15) 4532(5) 3305,1(12) 11,5(4)
C21 9916,8(14) 5270(5) 3806,3(11) 14,2(4)
O22 10205,1(12) 4548(4) 4667,5(9) 19,7(3)
O23 8259(1) 6383(4) 3617,4(8) 12,0(3)
C24 7796,5(15) 2632(5) 8247,6(12) 14,3(4)
C25 8660,9(16) 3583(6) 8876,5(13) 19,2(5)
C26 8867,4(16) 2729(6) 9696,9(13) 17,5(4)
C27 8215,1(16) 897(5) 9892,4(12) 13,3(4)
O28 8470,0(11) 22(4) 10709,1(8) 17,6(3)
C29 7336,4(15) -16(5) 9277,2(12) 14,7(4)
C30 7135,3(16) 853(5) 8459,1(12) 14,7(4)
O30 4774,0(11) 9985(4) 1799,3(9) 14,6(3)
O29 5530,0(12) 4463(4) -102,8(9) 17,7(3)
204
Phụ lục 46. Các thông số đẳng hướng (Å2×103) trong phân tử GML1
Nguyên tố U11 U22 U33 U23 U13 U12
C1 14,5(10) 17,3(10) 9,5(9) 0,0(8) 5,6(8) -1,7(8)
C2 15,2(10) 34,4(13) 12,4(9) 5,4(10) 8,1(8) 9,1(10)
C3 15,7(10) 30,9(13) 11,4(9) 6,3(9) 4,8(8) 8,2(9)
O4 26,3(9) 69,6(15) 15,9(8) 18,9(9) 14,2(7) 29,2(10)
C5 24,6(12) 54,5(18) 12(1) 14,2(11) 8,3(9) 19,8(13)
C6 16,3(10) 25,7(12) 11,3(9) 4,1(9) 5,5(8) 3,7(9)
C7 15,3(9) 15,3(10) 10,0(8) -1,4(8) 5,9(7) -2,0(8)
O8 14,6(7) 24,6(9) 12,1(7) 1,7(6) 7,7(6) 2,9(6)
C9 13,4(9) 19,4(11) 10,2(8) 0,2(8) 5,8(8) -1,5(8)
C10 12,7(10) 18,5(10) 12,7(9) -0,2(8) 5,9(8) 0,8(8)
C11 14(1) 16,8(11) 13,0(9) 1,9(8) 5,7(8) 3,2(8)
O12 16,9(7) 18,9(8) 8,9(6) 2,2(6) 6,8(6) 3,7(6)
C13 12,1(9) 14,3(10) 9,3(8) 0,9(7) 5,7(7) -0,5(8)
C14 11,4(9) 12,9(9) 9,7(8) 1,0(7) 3,2(8) -1,4(8)
O15 9,9(7) 15,1(7) 14,1(6) -1,1(6) 2,4(5) -1,4(6)
C16 12,5(9) 13,4(9) 7,5(8) 0,6(7) 3,1(7) -1,1(8)
O17 14,3(7) 24,5(8) 7,2(6) 2,5(6) 2,2(5) -4,8(6)
C18 12,1(9) 15,4(10) 8,8(8) -0,5(7) 4,0(7) -1,1(8)
O19 15,0(7) 29,0(9) 12,2(7) -7,1(7) 4,8(6) 0,8(7)
C20 13,3(9) 11,3(9) 10,1(8) 0,2(7) 4,8(7) 1,1(8)
C21 12,7(10) 18,8(11) 9,6(8) 0,7(8) 2,3(7) -0,7(9)
O22 20,0(8) 24,1(9) 11,1(7) 4,2(6) 1,1(6) 0,6(7)
O23 11,2(7) 15,3(7) 9,9(6) -1,2(6) 4,3(6) -0,2(6)
C24 13,8(10) 19,4(11) 10,5(8) 2,7(8) 5,5(8) 5,4(9)
C25 16,3(11) 26,1(12) 16(1) 6,0(9) 6,7(9) -0,6(9)
C26 15,4(10) 21,3(11) 13,5(9) 1,1(9) 2,6(8) -2,7(9)
C27 17,7(10) 13,2(10) 9,5(8) 0,2(7) 5,5(8) 1,6(8)
O28 22,5(8) 20,2(8) 9,4(6) 1,8(6) 4,9(6) -5,4(7)
C29 15,8(10) 16,6(10) 13,1(9) 0,1(8) 6,9(8) -0,8(9)
C30 14,7(10) 16,8(11) 11,4(9) -1,5(8) 3,4(8) 0,8(8)
O30 14,1(7) 16,4(7) 15,7(7) -1,6(6) 8,4(6) -2,2(6)
205
O29 20,2(8) 21,0(8) 11,7(7) -0,7(6) 5,5(6) -3,3(6)
206
Phụ lục 47. Độ dài liên kết trong phân tử GML1
Nguyên tố Độ dài /Å Nguyên tố
Độ dài /Å
C1 C2 1,377(3) C14 O15 1,419(2)
C1 C11 1,405(3) C14 C16 1,527(3)
C1 O12 1,376(2) C16 O17 1,431(2)
C2 C3 1,391(3) C16 C18 1,525(3)
C3 O4 1,369(3) C18 O19 1,420(3)
C3 C9 1,394(3) C18 C20 1,530(3)
O4 C5 1,358(3) C20 C21 1,509(3)
C5 C6 1,341(3) C20 O23 1,439(2)
C6 C7 1,465(3) C21 O22 1,426(2)
C6 C24 1,488(3) C24 C25 1,396(3)
C7 O8 1,237(3) C24 C30 1,393(3)
C7 C9 1,467(3) C25 C26 1,389(3)
C9 C10 1,407(3) C26 C27 1,381(3)
C10 C11 1,380(3) C27 O28 1,376(2)
O12 C13 1,411(2) C27 C29 1,394(3)
C13 C14 1,530(3) C29 C30 1,388(3)
207
Phụ lục 48. Góc liên kết trong phân tử GML1
Góc Góc /˚ Góc Góc/˚
C2 C1 C11 121,31(18) O15 C14 C13 111,58(16)
O12 C1 C2 123,91(18) O15 C14 C16 108,74(16)
O12 C1 C11 114,78(18) C16 C14 C13 111,88(16)
C1 C2 C3 117,59(19) O17 C16 C14 109,99(16)
C2 C3 C9 123,5(2) O17 C16 C18 107,82(15)
O4 C3 C2 115,22(19) C18 C16 C14 111,76(16)
O4 C3 C9 121,31(18) C16 C18 C20 109,69(15)
C5 O4 C3 118,43(18) O19 C18 C16 113,57(16)
C6 C5 O4 125,6(2) O19 C18 C20 107,14(16)
C5 C6 C7 119,15(18) C21 C20 C18 110,37(16)
C5 C6 C24 118,0(2) O23 C20 C18 108,66(15)
C7 C6 C24 122,85(18) O23 C20 C21 107,94(16)
C6 C7 C9 114,74(18) O22 C21 C20 113,55(16)
O8 C7 C6 123,68(17) C13 O23 C20 110,30(15)
O8 C7 C9 121,57(19) C25 C24 C6 120,08(19)
C3 C9 C7 120,37(19) C30 C24 C6 120,94(19)
C3 C9 C10 117,01(18) C30 C24 C25 118,82(19)
C10 C9 C7 122,60(19) C26 C25 C24 120,7(2)
C11 C10 C9 120,98(19) C27 C26 C25 119,7(2)
C10 C11 C1 119,61(19) C26 C27 C29 120,53(18)
C1 O12 C13 117,73(16) O28 C27 C26 117,48(18)
O12 C13 C14 106,25(16) O28 C27 C29 121,99(19)
O23 C13 O12 108,23(16) C30 C29 C27 119,33(19)
O23 C13 C14 109,40(15) C29 C30 C24 120,88(19)
208
Phụ lục 49. Góc xoắn trong phân tử GML1
A B C D Góc/˚ A B C D Góc/˚
C1 C2 C3 O4 -178,9(2) O12 C1 C11 C10 179,5(2)
C1 C2 C3 C9 0,7(4) O12 C13 C14 O15 -67,3(2)
C1 O12 C13 C14 167,23(17) O12 C13 C14 C16 170,61(16)
C1 O12 C13 O23 -75,4(2) O12 C13 O23 C20 178,62(14)
C2 C1 C11 C10 -1,4(3) C13 C14 C16 O17 -165,89(16)
C2 C1 O12 C13 18,1(3) C13 C14 C16 C18 -46,2(2)
C2 C3 O4 C5 177,9(3) C14 C13 O23 C20 -66,02(19)
C2 C3 C9 C7 176,6(2) C14 C16 C18 O19 168,12(16)
C2 C3 C9 C10 -1,8(4) C14 C16 C18 C20 48,3(2)
C3 O4 C5 C6 3,5(5) O15 C14 C16 O17 70,4(2)
C3 C9 C10 C11 1,3(3) O15 C14 C16 C18 -169,87(17)
O4 C3 C9 C7 -3,9(4) C16 C18 C20 C21 -176,79(17)
O4 C3 C9 C10 177,7(2) C16 C18 C20 O23 -58,6(2)
O4 C5 C6 C7 0,6(5) O17 C16 C18 O19 -70,9(2)
O4 C5 C6 C24 -179,8(3) O17 C16 C18 C20 169,27(17)
C5 C6 C7 O8 174,6(3) C18 C20 C21 O22 -179,07(17)
C5 C6 C7 C9 -5,8(3) C18 C20 O23 C13 69,13(19)
C5 C6 C24 C25 54,6(4) O19 C18 C20 C21 59,5(2)
C5 C6 C24 C30 -120,7(3) O19 C18 C20 O23 177,68(16)
C6 C7 C9 C3 7,4(3) C21 C20 O23 C13 -171,17(16)
209
Phụ lục 50. Tọa độ nguyên tố Hydrogen (Å×104) và các tham số đẳng hướng
(Å2×103) của phân tử GML1
Atom x y z U(eq)
H2 8045 4146 4809 24
H5 8865 1370 7439 36
H10 5511 8234 5541 17
H11 5530 9102 4221 17
H13 7199 3232 3361 14
H14 6882 8429 2251 14
H15 5515 6527 1874 20
H16 7409 2468 1846 14
H17 6747 5325 769 24
H18 8752 7545 2343 14
H19 8929 2893 1628 28
H20 8730 2306 3364 14
H21A 10338 4115 3574 17
H21B 10028 7485 3749 17
H22 9903 2977 4723 30
H25 9113 4827 8742 23
H26 9455 3401 10122 21
H28 8055 -1231 10749 26
H29 6880 -1220 9416 18
H30 6539 225 8038 18
H30A 5171 11545 1936 22
H30B 4426 9952 2111 22
H29A 5210 2904 -15 27
H29B 5510 4402 -611 27
210
Phụ lục 51. Dữ liệu cấu trúc tinh thể của ZZL1
Tham số Pna21
Công thức phân tử C16H12O6
Khối lượng phân tử 300,26
ToK 100
Hệ tinh thể orthorhombic
Nhóm không gian Pna21
a/Å 7,0060(4)
b/Å 25,9070(14)
c/Å 7,2062(4)
α/° 90
β/° 90
γ/° 90
Thể tích/Å3 1307,96(13)
Z 4
Tỉ khối tính toán ρcalcg/cm3 1,525
Hệ số hấp thu μ/mm-1 0,118
F(000) 624
Kích thước tinh thể /mm3 0,1 × 0,08 × 0,04
Bức xạ MoKα (λ = 0,71073)
Phạm vi thu thập dữ liệu 2Θ /° 5,868 to 61,67
Chỉ số index -10 ≤ h ≤ 10, -37 ≤ k ≤ 37, -10 ≤ l ≤ 10
Số phản xạ đo được 44181
Số phản xạ độc lập 4114 [Rint = 0,0465, Rsigma = 0,0199]
Dữ liệu/giới hạn/tham số 4114/1/203
Hệ số phù hợp mô hình F2 1,092
Độ sai lệch [I>=2σ (I)] R1 = 0,0387, wR2 = 0,0959
Độ sai lệch tổng cộng R R1 = 0,0427, wR2 = 0,0987
Mật độ đỉnh/lỗ / e Å-3 0,44/-0,24
Tham số Flack 0,0(2)
211
Phụ lục 52. Tọa độ các nguyên tử trong phân tử ZZL1
Nguyên
tố
x y z U(eq)
C1 7729(2) 3675,6(6) 4775(2) 10,9(3)
C2 8443(2) 3485,4(6) 6392(2) 11,1(3)
O3 9062,3(18) 3807,2(5) 7788,2(17) 13,7(2)
C4 7590(3) 3901,3(7) 9151(3) 20,0(4)
C5 8572(2) 2936,4(6) 6728(2) 10,7(3)
O6 9224,5(18) 2758,0(5) 8233,1(18) 14,2(2)
C7 7914(2) 2611,6(6) 5243(2) 10,7(3)
C8 7974(2) 2063,4(6) 5363(2) 11,1(3)
O9 8594(2) 1833,0(5) 6930,0(18) 16,2(3)
C10 7379(2) 1763,2(6) 3882(3) 12,5(3)
C11 6715(2) 2000,8(6) 2255(2) 12,0(3)
O12 6171(2) 1683,8(5) 869,4(19) 16,4(3)
C13 6619(2) 2537,4(6) 2097(2) 11,7(3)
C14 7222(2) 2829,9(6) 3600(2) 10,4(3)
O15 7127,6(18) 3355,0(4) 3393,7(18) 12,4(2)
C16 7513(2) 4222,1(6) 4268(2) 12,9(3)
C17 5993(2) 4377,7(6) 3133(3) 14,7(3)
C18 5805(3) 4890,1(7) 2589(3) 16,8(3)
C19 7136(3) 5253,5(7) 3183(3) 18,3(3)
O20 6892(2) 5746,0(5) 2576(3) 25,7(3)
C21 8635(3) 5105,0(7) 4328(3) 22,0(4)
C22 8829(3) 4592,3(7) 4862(3) 19,1(3)
212
Phụ lục 53. Các thông số đẳng hướng (Å2×103) trong phân tử k ZZL1
Nguyên
tố
U11 U22 U33 U23 U13 U12
C1 10,9(7) 10,0(6) 11,9(7) 0,4(5) 1,0(6) -1,1(5)
C2 13,1(7) 9,5(6) 10,9(6) -0,1(5) 0,8(6) -1,1(5)
O3 16,4(6) 13,1(5) 11,7(5) -1,8(4) -0,2(4) -2,0(4)
C4 23,0(9) 21,7(8) 15,3(8) -3,5(7) 3,6(7) 0,3(7)
C5 10,3(7) 11,0(6) 10,7(7) 1,3(5) 0,9(5) -0,2(5)
O6 18,3(6) 13,3(5) 11,0(5) 3,1(4) -2,2(5) -0,1(4)
C7 11,4(7) 10,0(6) 10,8(6) 0,6(5) -0,6(5) -0,2(5)
C8 11,1(7) 10,4(6) 11,7(7) 2,1(5) 0,5(5) 1,0(5)
O9 23,3(7) 11,5(5) 13,7(6) 3,3(4) -3,4(5) 0,7(4)
C10 11,6(7) 11,5(6) 14,5(7) -0,2(5) 1,2(6) 0,0(5)
C11 10,1(7) 12,8(7) 13,0(7) -1,8(5) 0,9(6) -1,1(5)
O12 21,4(6) 12,7(5) 15,2(6) -2,8(4) -5,7(5) 0,1(5)
C13 12,8(7) 11,8(6) 10,5(6) 0,2(5) -0,9(5) 0,4(5)
C14 11,0(7) 9,5(6) 10,5(7) 0,6(5) 0,4(5) -0,1(5)
O15 16,2(6) 9,5(5) 11,5(5) 0,8(4) -2,0(4) -0,3(4)
C16 16,5(8) 9,4(6) 12,8(7) 1,4(5) 2,0(6) -0,4(5)
C17 17,2(8) 12,1(7) 14,9(7) 1,0(6) -0,7(6) 0,4(6)
C18 20,0(8) 12,3(7) 18,1(7) 2,6(6) 0,4(7) 3,1(6)
C19 22,9(8) 10,8(6) 21,2(8) 4,3(6) 5,0(7) 1,2(6)
O20 30,9(8) 10,2(6) 36,1(8) 7,4(5) 2,2(7) -1,0(5)
C21 24,7(9) 14,6(8) 26,8(9) 5,4(7) -2,6(7) -7,8(7)
C22 18,6(8) 14,9(7) 23,7(9) 5,3(7) -4,3(7) -4,6(6)
213
Phụ lục 54. Độ dài liên kết trong phân tử ZZL1
Liên kết Góc/Å Liên kết Góc/Å
C1 C2 1,360(2) C10 C11 1,404(2)
C1 O15 1,3631(19) C11 O12 1,348(2)
C1 C16 1,470(2) C11 C13 1,396(2)
C2 O3 1,3766(19) C13 C14 1,388(2)
C2 C5 1,446(2) C14 O15 1,3701(17)
O3 C4 1,445(2) C16 C17 1,402(2)
C5 O6 1,264(2) C16 C22 1,397(2)
C5 C7 1,437(2) C17 C18 1,390(2)
C7 C8 1,423(2) C18 C19 1,393(3)
C7 C14 1,399(2) C19 O20 1,360(2)
C8 O9 1,3489(19) C19 C21 1,390(3)
C8 C10 1,385(2) C21 C22 1,389(2)
214
Phụ lục 55. Góc liên kết trong phân tử ZZL1
Nguyên tố Góc/˚ Nguyên tố Góc/˚
C2 C1 O15 121,24(14) O12 C11 C13 122,20(15)
C2 C1 C16 126,82(15) C13 C11 C10 121,37(15)
O15 C1 C16 111,93(14) C14 C13 C11 117,74(15)
C1 C2 O3 121,51(14) C13 C14 C7 123,04(14)
C1 C2 C5 121,51(14) O15 C14 C7 120,67(13)
O3 C2 C5 116,98(14) O15 C14 C13 116,28(14)
C2 O3 C4 111,96(13) C1 O15 C14 120,71(13)
O6 C5 C2 121,72(14) C17 C16 C1 119,98(15)
O6 C5 C7 122,74(13) C22 C16 C1 121,14(15)
C7 C5 C2 115,54(14) C22 C16 C17 118,86(15)
C8 C7 C5 121,94(14) C18 C17 C16 120,71(16)
C14 C7 C5 120,32(13) C17 C18 C19 119,69(17)
C14 C7 C8 117,73(14) O20 C19 C18 116,81(17)
O9 C8 C7 120,14(14) O20 C19 C21 123,10(17)
O9 C8 C10 119,56(14) C21 C19 C18 120,09(16)
C10 C8 C7 120,30(14) C22 C21 C19 120,20(17)
C8 C10 C11 119,82(14) C21 C22 C16 120,44(17)
O12 C11 C10 116,43(14)
215
Phụ lục 56. Góc xoắn trong phân tử ZZL1
A B C D Angle/˚ A B C D Angle/˚
C1 C2 O3 C4 94,58(19) C8 C10 C11 C13 -0,7(3)
C1 C2 C5 O6 -179,57(16) O9 C8 C10 C11 179,36(15)
C1 C2 C5 C7 0,5(2) C10 C11 C13 C14 0,6(2)
C1 C16 C17 C18 -177,82(16) C11 C13 C14 C7 0,1(2)
C1 C16 C22 C21 178,18(18) C11 C13 C14 O15 179,36(14)
C2 C1 O15 C14 0,2(2) O12 C11 C13 C14 -179,69(16)
C2 C1 C16 C17 -147,34(18) C13 C14 O15 C1 -178,46(14)
C2 C1 C16 C22 34,2(3) C14 C7 C8 O9 -178,69(15)
C2 C5 C7 C8 179,25(15) C14 C7 C8 C10 0,7(2)
C2 C5 C7 C14 0,5(2) O15 C1 C2 O3 179,63(14)
O3 C2 C5 O6 -0,1(2) O15 C1 C2 C5 -0,9(2)
O3 C2 C5 C7 -179,99(14) O15 C1 C16 C17 33,2(2)
C5 C2 O3 C4 -84,94(18) O15 C1 C16 C22 -145,26(17)
C5 C7 C8 O9 2,5(2) C16 C1 C2 O3 0,2(3)
C5 C7 C8 C10 -178,10(16) C16 C1 C2 C5 179,69(15)
C5 C7 C14 C13 178,05(16) C16 C1 O15 C14 179,73(14)
C5 C7 C14 O15 -1,2(2) C16 C17 C18 C19 -0,2(3)
O6 C5 C7 C8 -0,7(3) C17 C16 C22 C21 -0,3(3)
O6 C5 C7 C14 -179,43(15) C17 C18 C19 O20 178,86(17)
C7 C8 C10 C11 0,0(2) C17 C18 C19 C21 -0,6(3)
C7 C14 O15 C1 0,8(2) C18 C19 C21 C22 1,0(3)
C8 C7 C14 C13 -0,7(2) C19 C21 C22 C16 -0,5(3)
C8 C7 C14 O15 -179,95(15) O20 C19 C21 C22 -178,44(19)
C8 C10 C11 O12 179,61(15) C22 C16 C17 C18 0,7(3)
216
Phụ lục 57. Tọa độ nguyên tố Hydrogen (Å×104) và các tham số đẳng hướng
(Å2×103) trong Pna21 của hợp chất ZZL1
Nguyên tố x y z U(eq)
H4A 6661 4147 8650 30
H4B 8166 4044 10279 30
H4C 6944 3576 9449 30
H9 8902 2059 7709 24
H10 7421 1397 3967 15
H12 5665 1858 18 25
H13 6157 2697 998 14
H17 5082 4130 2731 18
H18 4773 4992 1815 20
H20 7770 5933 2997 39
H21 9530 5355 4746 26
H22 9863 4493 5636 23
217
Phụ lục 58. Tính toán các tham số cấu trúc phân tử
1) ABSQ: Tổng điện tích của nguyên tử trong phân tử
i
i
ABSQ Q
Trong đó Qi là điện tích của nguyên tử i.
2) ABSQon: Là tổng giá trị tuyệt đối điện tích nito (n) và oxy (o) trong phân tử.
ABSQon i i
i
Qn Qo
3) Dipole: là giá trị moment lưỡng cực của phân tử. Giá trị dipole (μ) được tính dựa
trên cấu trúc 3D và điện tích nguyên tử bằng phương pháp Gasteiger-Marsili thực
hiện trong QSARIS. Đơn vị của nó là (1 D = 3.336 E-30 coulomb-meter).
3) Chỉ số hình học alpha Ka3 (Kappa Alpha 3 hay 3); Ka2 (Kappa Alpha 2 hay
(2))
Trường hợp theo số nguyên tử và đường:
1kα = [(A+ α)(A+ α – 1)2]/(1Pi + α)2 với m = 1
2kα = [(A+ α – 1)(A+ α – 2)2]/(2Pi + α)2 với m = 2
3kα = (A + α –1)(A + α – 3)2 / (3Pi + α)2 với m = 3 khi A lẻ
3kα = (A + α –3)(A + α – 2)2 / (3Pi + α)2 với m = 3 khi A chẵn
Trong đó: A là số lượng các nguyên tử trong phân tử được mô tả; là bán kính
cộng hóa trị nguyên tử của các nguyên tử trong hợp chất vòng khác carbon; Pi: số
lượng đường bậc m trong phân tử i; m là bậc đường.
Bán kính cộng hóa trị nguyên tử là bán kính được sắp xếp dạng bảng của mỗi
nguyên tử và được sử dụng để tính giá trị cho chỉ số chỉ số hình học K. Bán kính
cộng hóa trị nguyên tử được định nghĩa như sau:
3sp 1i CR R
Với α là tổng Ri và RCsp3; Ri và RCsp3 bán kính nguyên tử thứ i và bán kính Csp3.
218
5) logP là logarithm (cơ số 10) của hệ số phân tán P của octanol - nước [14].
6) MaxNeg là điện tích âm lớn nhất của các các nguyên tử trong một phân tử.
7) MaxQp là điện tích dương lớn nhất của các các nguyên tử trong một phân tử.
8) MolWeight: là phân tử khối của phân tử
9) Polar: là độ phân cực của phân tử, được tính dựa trên phương pháp của Miller,
công thức 1.12.
A
A
( )ahp
Trong đó αA là độ phân cực trung bình nguyên tử cho nguyên tử A. Phương
pháp này sử dụng 400 hợp chất chứa H, C, N, O, S, F, Cl, B, I, và P để xác định sai
số của αA với sai số 2,2-2,8% giữa phép phân cực phân tử thực nghiệm và tính toán.
Đơn vị là Å3 (1Å = 10-10 m).
10) Sp.Pol: là độ phân cực cụ thể của một phân tử: Sp.Pol = Polar/Volume
11) Volume: Thể tích của một phân tử. Thể tích phân tử của một phân tử được tính
bằng phương pháp lưới (grid) của Boder. Nó là một kỹ thuật tích hợp sử dụng một
khối lưới trung tâm trên mỗi nguyên tử có cạnh là đường kính của nguyên tử.
3
t
4
( / )
3
i iV r n n
Trong đó n là số điểm lưới trong nguyên tử và không tính tính các nguyên tử
khác; nt là tổng số điểm lưới trong một nguyên tử và ri là bán kính van der Waals
của nguyên tử thứ i.
Thể tích của nguyên tử V:
i
i
V V đơn vị là Å3(1Å = 10-10 m)
12) WienI (W): Chỉ số W là một tham số topo theo công thức của H. Wiener [36].
Các chỉ số W được dựa trên khung của phân tử (không có hydrogen). W được định
nghĩa là tổng của khoảng cách giữa hai nguyên tử cacbon trong phân tử, liên quan
đến các liên kết cacbon và cacbon. Phương pháp tính toán như sau: Nhân số nguyên
tử cacbon vào một mặt của bất kỳ liên kết nào bằng các bên ở phía bên kia; W =
tổng của các giá trị này cho tất cả các liên kết. Chỉ số Wiener của một phân tử
219
thường cao hơn đối với các phân tử lớn hơn và cho biết độ phân nhánh của phân tử.
Đặc biệt, W thường lớn cho các phân tử mở phân nhánh và nhỏ cho những phân tử
ít phân nhánh hơn. W tương quan với tham số hình dạng ovality và volume phân tử
và trong một số trường hợp, nó có thể được sử dụng thay cho một hoặc cả hai mô tả
phân tử này. W là một tham số đơn.
13) X1: chỉ số liên kết thứ nhất được tính trên tất cả các liên kết đơn (cạnh) của các
nguyên tử trong phân tử không có hydro. Nó là một trong các tham số mô tả hữu ích
nhất đối với các mô hình QSAR/QSPR. X1 là tổng tất cả các liên kết từ nguyên tử i
đến nguyên tử j được tín theo công thức sau:
0.51 ( )i jX
δi = ϭ - h: là tổng các liên kết xung quanh nguyên tử i; ϭ là số electron của nguyên
tử i trong orbital ϭ. h là số hydro liên kết với nguyên tử i.
14) X1 là 1 χ trong tính toán của Kier & Hall.
15) X3: là chỉ số liên kết thứ 3.
16) Ovality: là chỉ số hình học oval của phân tử.
2/32
0 VDW
1
4 3
4
4
SA SA SA
Ovality
SA R V
Với O là là tham số mô tả kích thước dựa trên tính chất đối với một thể tích cố định,
hình cầu với bề mặt nhỏ nhất; SA là bề mặt phân tử; SA0 là bề mặt phân tử cực tiểu;
VVDW là thể tích an der Waals; R là bán kính nguyên tử.
17) Sdssc: là số chỉ số E-State của nhóm (=C<) trong phân tử .
18) SdO: là số chỉ số E-State của nhóm (=O) trong phân tử .
19) SaaCH là số chỉ số E-State (chỉ số trạng thái điện tử) của nhóm ( CH )
trong phân tử.
20) SsOH là số chỉ số E-State của nhóm OH trong phân tử.
21) xp6 là chỉ số chi đường 6 (6P).
22) k2 hay Kappa 2 (2k) là chỉ số hình học kappa truyền thống (traditional Kappa
Shape Indices).
220
Trường hợp theo số đường:
mk= C (mPmaxmPmin)/(mPi)2
Trong đó:
Pmax: số lượng đường bậc m trong một phân tử tham chiếu không có nhánh
với cùng một số nguyên tử như phân tử được mô tả.
Pmin: số lượng đường bậc m trong một phân tử tham chiếu có đặc tính cấu trúc
vô cực và cùng một số nguyên tử như phân tử được mô tả.
Pi: số lượng đường bậc m trong phân tử thực tế i được mô tả.
m là bậc đường
C = 2 (m = 1,2); C = 4 (m = 3)
Trường hợp theo số nguyên tử và đường:
1k = A(A-1)2/(1Pi)2 với m = 1
2k = A(A-1)(A-2)2/(2Pi)2 với m = 2
3k = A(A-1)(A-3)2/(3Pi)2 với m = 3 khi A lẻ
3k = A(A-3)(A-2)2/(3Pi)2 với m = 3 khi A chẵn
Trong đó:
A là số đỉnh (các nguyên tử hoặc nhóm hydrua) trong khung phân tử
Pi: số lượng đường bậc m trong phân tử thực tế i được mô tả
m là bậc đường
23) knotp: sự khác nhau giữa chi nhóm 3 và chi đường/nhóm 4.
27) xp8: chỉ số chi đường 8 (8P) bậc thấp.
28) Knotpv: Sự khác nhau giữa chi nhóm hóa trị 3 và chi đường/nhóm hóa trị 4.
29) Phia: Kappa linh hoạt (. Các đại lượng Kappa Alpha 1 và Kappa Alpha 2
được kết hợp với một số nguyên tử (bình thường) để tạo thành chỉ số Kappa linh
hoạt (Kappa Flexibility), (phia) . Chỉ số Kappa linh hoạt phia được định nghĩa
như sau:
= (1k)(2k)/A
221
Trong đó: 1k là giá trị của kappa alpha 1; 2k là giá trị của kappa alpha 2; A là số
đỉnh (các nguyên tử hoặc nhóm hydrua) trong khung phân tử
Nvx là số đỉnh của khung (số nguyên tử không phải hydro, số các nhóm hydrua; ví
dụ. - CH3, - OH,).
222
Phụ lục 59. Các phương pháp bán thực nghiệm
1) CNDO
Phương pháp CNDO (complete neglect of differential overlap) phương pháp
NDO (neglect of differential overlap) đơn giản nhất. Phương pháp này mô hình hóa
các giá trị orbitals chỉ sử dụng một bộ cơ sở tối thiểu của các loại orbitals Slater.
Phương pháp CNDO đã chứng minh kết quả hữu ích trên một số hydrocacbon.
CNDO đôi khi vẫn được sử dụng để tạo ra dự đoán đầu tiên về tính toán ab initio
trên các hydrocarbon.Thực tế tất cả các phép tính CNDO thực sự được thực hiện
bằng cách sử dụng phương pháp CNDO/2, đó là một tham số được cải thiện hơn
phương pháp CNDO/1 ban đầu. Có một phương pháp CNDO/S được tham số để
tính toán tính chất điện tử quang phổ. Phương pháp CNDO/S mang lại dự đoán cải
thiện các dự đoán trạng thái kích thích năng lượng, nhưng khó khăn trong dự đoán
tính chất hình học phân tử. Cũng có những phần mở rộng của phương pháp
CNDO/2 bao gồm các yếu tố có orbitals d. Những kỹ thuật này không sử dụng phổ
biến rộng rãi do tính giới hạn chính xác của kết quả.
2) INDO
Phương pháp INDO (intermediate neglect of diferential overlap) được sử
dụng cho các hợp chất hữu cơ. Ngày nay, nó đã bị thay thế bởi các phương pháp
chính xác hơn. INDO đôi khi vẫn được sử dụng như một phép tính ban đầu trong
các tính toán ab initio.
3) MNDO
Phương pháp MNDO (modified neglect of diatomic overlap) đã được sử
dụng nhiều trong các hợp chất hữu cơ. Nó đã được đưa vào một số chương trình
bán thực nghiệm phổ biến cũng như chương trình MNDO. Ngày nay, nó vẫn được
sử dụng, nhưng các phương pháp AM1 và PM3 chính xác và phổ biến hơn.
Có một số trường hợp mà phương phá MNDO đưa ra kết quả không chính
xác. Tính toán năng lượng kích thích điện tử thấp. Hàng rào năng lượng kích hoạt
thường có xu hướng cao.
223
Không phải luôn luôn tính được năng lượng tối thiểu bằng phương pháp
MNDO. Hàng rào đối với sự quay liên kết thường được tính là quá nhỏ. Các hợp
chất lớn và các hệ phân tử được tính toán không ổn định. Vòng bốn được dự đoán là
bền. Nhóm hàm bão hòa oxy trên vòng được dự đoán ngoài không gian. Liên kết
peroxide thì nhỏ hơn 0,17 Ao. Liên kết C-O-C lớn hơn 9o. Độ dài liên kết giữa các
electron âm thì quá ngắn. Liên kết hydrogem thì quá mạnh và dài.
Phương pháp biến thể của MNDO là MNDO/d. Đây là hàm tương đương bao
gồm các orbital d. Phương pháp này cải thiện tiên đoán hình học của các phân tử
tăng dần. Phương pháp này đôi khi được sử dụng để mô hình hóa các hệ thống kim
loại chuyển tiếp. Phương pháp MNDO cũng bao gồm các tương quan điện tử với
phương pháp MNDO.
4) AM1
Phương pháp AM1 (Austin Model 1) phổ biến trong mô hình hóa các hợp
chất hữu cơ. AM1 thường dùng trong tính toán nhiệt tạo thành ΔHf chính xác hơn
phương pháp MNDO. Tùy thuộc vào cấu trúc phân tử và thông tin cấu trúc tính
toán, một trong hai AM1 hoặc PM3 thường cho kết quả chính xác nhất định.
Có một số ưu điểm và nhược điểm về kết quả thu được từ những phương
pháp này. AM1 đã cải thiện tính toán năng lượng kích hoạt so với phương pháp
MNDO. Phương pháp AM1 có kết quả tính toán đối với nhôm tốt hơn PM3 và tính
toán kém chính xác đối với nitơ, phốt pho hay tính toán nhiệt tạo thành của các
phân tử với có điện tích lớn. Ngoài ra, AM1 thường ứng dụng tính toán cho liên kết
O-Si-O, dự đoán năng lượng nhóm alkyl. Nhìn chung, AM1dự đoán năng lượng và
hình học tốt hơn MNDO, nhưng không bằng như PM3.
5) PM3
Phương pháp PM3 (Parameterization method 3) sử dụng phương trình gần
giống như phương pháp AM1 với bộ tham số được cải thiện. Đây là phương pháp
phổ biến đối với hệ thống hữu cơ. PM3 chính xác hơn AM1 đối với tính các góc độ
liên kết hydro, nhưng AM1 chính xác hơn đối với tính năng lượng liên kết hydro.
224
Các phương pháp PM3 và AM1 cũng phổ biến hơn các phương pháp bán thực
nghiệm khác do có sẵn các thuật toán tính toán năng lượng solvat hóa.
Ngoài ra còn có một số điểm mạnh và hạn chế của PM3. Nói chung, tính
toán nhiệt tạo thành chính xác hơn so với MNDO hoặc AM1. Các phân tử siêu hóa
trị (Hypervalent) cũng được dự đoán chính xác hơn. PM3 có khuynh hướng tiên
đoán rằng rào xoay xung quanh liên kết CaN trong các peptide quá thấp. Liên kết
giữa Si và các nguyên tử halogenua quá ngắn. PM3 cũng có xu hướng dự đoán
trạng thái điện tử không chính xác đối với các hợp chất gecmani. Dự đoán điện tích
nito không chính xác. Khoảng cách không liên kết thì quá ngắn. Liên kết hydro thì
quá ngắn khoảng 0,1 Ao, nhưng định hướng thường chính xác. Nhìn chung, PM3 dự
đoán năng lượng và độ dài liên kết chính xác hơn AM1 hoặc MNDO.
6) TNDO
Phương pháp TNDO (typed neglect of differential overlap) là phương
pháp bán thực nghiệm tham số hóa đặc biệt để để tính toán độ dịch chuyển
hóa học của phổ NMR. Sự tham số hoá này đi cao hơn các phương pháp bán
thực nghiệm khác là phân biệt giữa các nguyên tử của cùng một nguyên tố
nhưng lai hóa khác nhau.Ví dụ, các tham số khác nhau được sử dụng để mô tả
một carbon sp2 và carbon sp3. ó hai phiên bản của phương pháp này: TNDO/1
và TNDO/2.
225
Phụ lục 60. Ma trận dữ liệu trong nghiên cứu QSAR
Phân tử
Hoạt
tính
Tính chất /
Tham số/
Phân mảnh 1
Tính chất /
Tham số/
Phân mảnh 2
Tính chất /
Tham số/
Phân mảnh 3
Tính chất /
Tham số/
Phân mảnh n
Phân tử i Yi X1i X2i X3i Xni
Phân tử ii Yii X1ii X2ii X3ii Xnii
Phân tử iii Yiii X1iii X2iii X3iii Xniii
Phân tử n Yn X1n X2n X3n Xnn
226
Phụ lục 61. Các loại thông tin bao gồm trong các phương pháp mô phỏng silico
Dữ liệu được mô phỏng
Tác dụng dược lý
Tác dụng gây độc
Tính chất hóa lý
Các tính chất dược động học, sinh học khả dụng
Môi trường
Hóa học
Tính chất hóa lý
Thuộc tính cấu trúc 2-D và 3-D
Hiện diện, vắng mặt và đếm các nguyên tử, mảnh, tiểu cấu trúc
Hoá học lượng tử và tính toán
Mô phỏng
Thiết kế các nhóm dẫn xuất có cấu trúc tương tự
Thống kê
3D/4D QSAR
Các lĩnh vực khác
Chất lượng và độ tin cậy của dữ liệu
Mô hình hóa và mô hình dự báo
Phạm vi áp dụng
Chất lượng mô hình và độ tin cậy của dự báo
227
Phụ lục 62. Tóm tắt các phương pháp tiếp cận mô hình chính cho sự xây dựng các
QSAR và trong kỹ thuật silico
Phương pháp (Q)SAR
Phân tích Hansch
Free-Wilson
Các mảnh cấu trúc và nhận diện cấu trúc
Sự hình thành và phân loại của nhóm
Phân tích hồi quy tuyến tính
Bình phương cực tiểu riêng phần
Nhận dạng mẫu
Các phương pháp Robust
Dược phẩm
Mô hình 3-D
CoMFA
228
Phụ lục 63. Phương pháp phổ cộng hưởng từ hạt nhân
Phổ 1H-NMR
Phổ 1H-NMR cho biết có bao nhiêu loại proton trong phân tử, đồng thời cho phép
xác định số proton của từng loại. Trong phổ 1H-NMR, phần diện tích vẽ ra bởi mũi
cộng hưởng, tỷ lệ thuận với số lượng proton gây ra tín hiệu cộng hưởng của mũi đó,
được gọi là cường độ tích phân của mũi cộng hưởng. Một tín hiệu cộng hưởng, do
ảnh hưởng của các proton bên cạnh có thể bị chẻ thành nhiều mũi, khi giải phổ cần
tính tổng diện tích các mũi.
Cách giải phổ 1H-NMR
Yêu cầu về mẫu đo phổ 1H-NMR đảm bảo khô, độ tinh khiết trên 95%, chất lỏng
cần kiểm tra độ tinh khiết bằng sắc ký lỏng hiệu năng cao (HPLC) hoặc kiểm tra
bằng SKLM với các hệ dung môi khác nhau cho hiện vết tròn, duy nhất ở Rf = 0,7-
0,8; 0,5-0,6; 0,2-0,3 đối với hệ dung môi giải ly từ phân cực mạnh, phân cực trung
bình, phân cực yếu tương ứng.
Đo phổ 1H-NMR: với máy 200 MHz cần khoảng 5 mg mẫu, nếu máy hoạt động ở
tần số 500 MHz thì lượng mẫu yêu cầu sẽ giảm. Sau khi đo có thể thu hồi mẫu.
Một số dữ liệu cần lưu ý khi giải phổ:
- Đối với proton của cacbon thơm (C=C) có mũi cộng hưởng tại = 7,0 - 8,5 ppm.
- Đỗi với proton của cacbon mạch thẳng (C=C) có mũi cộng hưởng tại = 4,5 - 6,0
ppm, tuy nhiên khoảng = 4,5 - 6,0 cũng có thể do proton gắn vào 2 hay nhiều
nguyên tử có độ âm điện như oxy, halogen.
- Đối với H của nhóm ankin đầu mạch có = 2,5 ppm.
- Đối với H của cacbon bên cạnh nhóm cacbony có = 2,1 – 2,5 ppm.
- Đối với H của cacbon liên kết với oxy, halogen có = 3 – 4 ppm. Nếu proton càng
xa nguyên tử có độ âm điện cao thì = 1 – 3 ppm
- Đối với H của cacbon nhóm vinyl có = 5 – 6 ppm.
- Đối với H thuộc nhóm andehit có = 9 – 10 ppm.
- Đối với H thuộc nhóm axit có >10 ppm.
229
Phổ 13C-NMR
Mẫu khảo sát khi đo phổ 13C-NMR cần hòa tan trong dung môi đã được deuterium
hóa (0,6 ml) và có thêm chất nội chuẩn TMS (tetrametilsilan) (1µL). Có nhiều loại
dung môi để hòa tan các hợp chất đo phổ 13C-NMR.
Lượng mẫu sử dụng đối với máy 200MHz khoảng 30 mg, máy có tần số 500 MHz
cần khoảng 5-10 mg, mẫu sau khi đo có thể thu hồi.
Các tín hiệu trong phổ 13C-NMR trong khoảng thang đo rất rộng từ 0 - 240 ppm.
Cách giải phổ 13C-NMR:
Phổ 13C-NMR kết hợp với phổ NMR-DEPT 135 và NMR-DEPT 90:
- Phổ 13C-NMR cho biết tổng số cacbon trong phân tử.
- Phổ NMR-DEPT 135 và NMR-DEPT 90 cho biết tổng số Csp3, Csp2.
Sau đây là độ dịch chuyển hóa học của 13C tính bằng ppm (so từ TMS):
+ Đối với C liên kết trực tiếp với nguyên tử có độ âm điện lớn: R-CH3 có = 8 – 30
ppm; R-CH2-R có = 15 – 55 ppm; CHR3, CR4 có có = 20 – 60 ppm
+ Đối với Csp3 liên kết với O có = 40 – 80 ppm; Csp3 liên kết với Cl có = 35 –
80 ppm; Csp3 liên kết với Br = 25 – 65 ppm; Csp3 liên kết với N có = 30 – 65
ppm.
+ Đối với Csp2 và Csp: nhóm C≡C có = 65 – 90 ppm; C≡N có = 110 – 140 ppm;
>C=CC=C< thơm có = 110 – 175 ppm.
+ Đối với C của nhóm aldehit hoặc xeton, axit có = 155 – 220 ppm.
Phổ hai chiều
Phổ HSQC (Heteronuclear Single Quantum Correlation) cho biết tương quan giữa
các tín hiệu proton với tín hiệu của cacbon qua 1 liên kết. Phổ
HMBC(Heteronuclear Multiple Quantum Correlation) cho biết tương quan giữa các
tin hiệu proton với tín hiệu của cacbon qua 2 hay 3 liên kết. Từ các tín hiệu của
cacbon 13C trên trục tung kẻ các đường song song với trục hoành trong toàn phổ đồ,
từ tín hiệu 1H trên trục hoành kẻ các đường song song với trục tung. Tại các vị trí
230
giao nhau của hai đường kẻ trên có tín hiệu giao, nghĩa là proton này liên kết trực
tiếp với cacbon kia.
231
Phụ lục 64. Phương pháp nhiễu xạ tia X đơn tinh thể
Phương pháp lâu đời nhất và chính xác nhất của tinh thể học tia X là nhiễu
xạ tia X đơn tinh thể, trong đó chùm tia X bị bản hồi từ các mặt phẳng có khoảng
cách đều nhau của một đơn tinh thể, tạo ra một mẫu nhiễu xạ gồm các điểm gọi là
nhiễu xạ. Mỗi nhiễu xạ tương ứng với một tập các mặt phẳng có khoảng cách đều
nhau bên trong tinh thể. Mật độ các electron bên trong tinh thể được xác định từ vị
trí và độ sáng của các nhiễu xạ khác nhau quan sát được khi tinh thể từ từ xoay
quanh chùm tia X; mật độ này, cùng với dữ liệu bổ sung (về thành phần hóa học),
cho phép ta xác định vị trí của các nguyên tử bên trong tinh thể. Nó có thể xác định
lực liên kết hóa học trung bình giữa các nguyên tử và góc giữa chúng trong khoảng
vài ngàn Ångström và vài chục độ.
Kĩ thuật nhiễu xạ tia X đơn tinh thể có 3 bước chính.
Bước 1: là thu thập một tinh thể tốt. Tinh thể phải đủ lớn (thường là lớn hơn
100 micron ở mọi chiều), không có tạp chất và có cấu trúc ổn định, không bị nứt nẻ.
Bước 2: đặt tinh thể vào trong đường đi của chùm tia X cực mạnh, thường có
bước sóng đơn (monochromatic X-rays), để tạo ra các mẫu nhiễu sắc. Tinh thể từ từ
xoay và dữ liệu được thu thập lại. Mỗi ảnh chứa hàng chục ngàn điểm nhiễu xạ với
các cường độ khác nhau.
Bước 3: dùng kĩ thuật tính toán và dữ liệu hóa học bổ sung để đưa ra mô
hình về sự sắp xếp các nguyên tử bên trong tinh thể.