Sinh khối tế bào được thu lại theo đơn vị 200 ml dịch nuôi cấy và tiến hành
siêu âm phá tế bào và tinh chế Trx-CTX bằng sắc ký ái lực và sắc ký lọc gel.
Hiệu suất của quá trình lên men, biểu hiện và tinh sạch đạt 12 mg/200 ml dịch
sinh khối tế bào lên men hay tương đương 60 mg/L dịch sinh khối tế bào. Như
vậy khi lên men bằng hệ thống BioFlo, hiệu suất sinh tổng hợp Trx-CTX đã tăng
lên 60 mg/L dịch sinh khối tế bào.
27 trang |
Chia sẻ: tueminh09 | Ngày: 25/01/2022 | Lượt xem: 485 | Lượt tải: 0
Bạn đang xem trước 20 trang tài liệu Tóm tắt Luận án Nghiên cứu biểu hiện và xác định đặc tính của Omega - Conotoxin, để xem tài liệu hoàn chỉnh bạn click vào nút DOWNLOAD ở trên
VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM
VIỆN CÔNG NGHỆ SINH HỌC
BÙI THỊ HUYỀNPHƯƠNG
NGHIÊN CỨU BIỂU HIỆN VÀ XÁC ĐỊNH ĐẶC
TÍNH CỦA OMEGA-CONOTOXIN
Chuyên ngành: Hóa sinh học
Mã số: 62 42 01 16
TÓM TẮT LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC
Hà Nội - 2015
Công trình được hoàn thành tại Viện Công nghệ sinh học
Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam
Người hướng dẫn khoa học:
1. GS. TS Phan Văn Chi
Viện Công nghệ sinh học
2. PGS. TS Nguyễn Bích Nhi
Viện Công nghệ sinh học
Phản biện 1:...
Phản biện 2: ..
Phản biện 3:
Luận án sẽ được bảo vệ trước Hội đồng chấm luận án tiến sỹ cấp
nhà nước tại: Viện Công nghệ sinh học
Vào hồi ngày .. tháng năm 2015
Có thể tìm hiểu luận án tại:
§ Thư viện Quốc gia Việt Nam
§ Viện Công nghệ sinh học
§ Trang web của Bộ GDĐT
1
MỞ ĐẦU
Đau do thần kinh là một rối loạn đặc trưng bởi những tổn thương hệ thần
kinh từ các bệnh mạn tính như ung thư, đái tháo đường, HIV... hoặc do phẫu
thuật, chấn thương.... Theo thống kê mới nhất của Viện Hàn lâm Y học về Đau
của Mỹ (AAPM -American Academy of Pain Medicine), năm 2015 trên thế giới
có khoảng 1,5 tỷ người bị đau mạn tính, trong đó 4,5% là bệnh nhân đau thần
kinh và tỷ lệ mắc bệnh tăng theo tuổi, tính riêng ở Châu Âu số người phải chịu
đựng các cơn đau do thần kinh chiếm khoảng 5% dân số. Trên thực tế, bệnh đau
thần kinh không thể trị dứt điểm mà chỉ có thể cải thiện chất lượng sống cho
bệnh nhân bằng cách sử dụng các loại thuốc giảm đau. Cho đến nay, việc điều trị
giảm đau truyền thống với các thuốc chống viêm không steroid hoặc sử dụng
nhóm opioid có tác dụng mạnh như Morphine vẫn chưa thực sự hiệu quả.
Việc tìm kiếm các phân tử đích mới trong phát triển thuốc giảm đau vẫn đang
là nỗ lực của các nhà khoa học trong nhiều năm qua. Một thế hệ chất giảm đau
mới có nguồn gốc từ nọc các loài ốc cối biển (Conus) đã và đang được đầu tư
nghiên cứu và phát triển mạnh trong thời gian gần đây. Đó là các conotoxin (có
bản chất là peptide) được tách chiết từ bầu độc của ốc cối, có tác động khóa chọn
lọc lên các kênh ion hay các thụ thể trên tế bào thần kinh nên được ứng dụng
trong việc tạo thuốc giảm đau, bảo vệ tế bào thần kinh... Trong đó, omega
conotoxin MVIIA là độc tố tách chiết từ loài ốc cối Conus magus, có tác dụng
khóa chọn lọc kênh Ca2+ type N trên tế bào thần kinh, gây ức chế quá trình
truyền tín hiệu thần kinh qua các khe synapse, có hiệu lực giảm đau tốt hơn
Morphine nhưng không gây nghiện. Đặc biệt omega conotoxin MVIIA với tên
thương mại là Prialt hay Ziconotide đã được Cơ quan Dược phẩm và Thực phẩm
Hoa Kỳ (United States Food and Drug Administration - FDA) cấp phép sử dụng
từ tháng 4 năm 2004 và Cơ quan Dược phẩm Châu Âu (Europe Medicines
Agency - EMA) cấp phép sử dụng từ tháng 2 năm 2005 như một loại thuốc giảm
đau mới. Bên cạnh đó, nhiều đặc tính khác của MVIIA cũng đang được nghiên
cứu và thử nghiệm lâm sàng trong các pha khác nhau như tác dụng bảo vệ tế bào
thần kinh vùng đồi thị trong các mô hình gây đột quị não...
Việc tách chiết trực tiếp các conotoxin có hoạt tính dược lý từ bầu độc của ốc
cối thường có hiệu suất thấp, độ tinh sạch không cao do sự đa dạng về thành
phần protein trong nọc (khoảng 1000 loại) và hàm lượng của mỗi loại lại rất
2
thấp. Cho đến nay, conotoxin thường được tổng hợp bằng con đường hoá. Tuy
nhiên, phương pháp tổng hợp hóa học bị hạn chế bởi cách thức tổng hợp thường
qua nhiều khâu, giá thành sản xuất cao đồng thời việc tạo thành các cầu nối
disulfide gặp khó khăn. Vì vậy conotoxin đang được chú trọng nghiên cứu, tạo ra
bằng công nghệ ADN tái tổ hợp.
Ở Việt Nam, hướng nghiên cứu về conotoxin tự nhiên và tái tổ hợp vẫn còn
hạn chế và mới bắt đầu được triển khai tại Phòng Hóa sinh Protein, Viện Công
nghệ sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam. Chính vì vậy,
chúng tôi thực hiện đề tài “Nghiên cứu biểu hiện và xác định đặc tính của
omega conotoxin” với mục tiêu và nội dung như sau:
Mục tiêu
Tạo ra omega conotoxin tái tổ hợp (ω-CTX, viết tắt là CTX) có khả năng ứng
dụng trong y dược học dưới dạng hoạt chất giảm đau.
Nội dung nghiên cứu
1. Tạo phân tử CTX tái tổ hợp gồm: (i) Thiết kế và tạo dòng gen mã hóa cho
CTX; (ii) Nghiên cứu biểu hiện CTX dạng dung hợp với thioredoxin (Trx-
CTX) ở E. coli; (iii) Tinh sạch Trx-CTX và CTX tái tổ hợp; (iv) Xác định CTX
tái tổ hợp đã được tạo ra bằng phương pháp khối phổ; (v) Xây dựng quy trình
lên men 4 lít/mẻ thu nhận, tinh sạch và bảo quản CTX tái tổ hợp.
2. Thử nghiệm hoạt tính giảm đau của CTX trên chuột nhắt trắng bằng mô hình
hóa chất sử dụng Formalin.
Những đóng góp mới của luận án
1. Đã tạo được dòng và xác định được trình tự gen mã hoá cho CTX với kích
thước 75 bp tương đồng 100% với trình tự nucleotide vùng peptide trưởng
thành của conotoxin từ ốc cối biển Conus magus (ConcoSever, N01765).
2. Đã thiết kế và biểu hiện được CTX dưới dạng dung hợp với Trx ở E. coli; đã
tinh sạch được CTX tái tổ hợp dạng Trx-CTX với hiệu suất 60 mg/L, hiệu
suất thu hồi từ dịch chiết tế bào đạt 12% và độ sạch là 96,6%; đã tinh sạch
được peptide CTX từ Trx-CTX với hiệu suất thu hồi đạt 9% và độ sạch là
97,5%; đã xác định được peptide CTX có khối lượng phân tử là 2,769 kDa
bằng phương pháp khối phổ.
3
3. Trên mô hình gây đau thực nghiệm bằng Formalin ở chuột nhắt trắng, CTX
tái tổ hợp được khẳng định có hoạt tính giảm đau tương đương với Lidocain
nhưng với liều lượng nhỏ hơn 142 lần.
Cấu trúc của luận án
Luận án gồm 102 trang được chia thành các phần: Mở đầu 3 trang; Chương
1: Tổng quan tài liệu 22 trang; Chương 2: Vật liệu và phương pháp 18 trang;
Chương 3: Kết quả 30 trang; Chương 4: Thảo luận 9 trang; Kết luận và kiến
nghị: 1 trang; Các công trình công bố của tác giả 2 trang; Tài liệu tham khảo 17
trang; Tóm tắt luận án bằng tiếng anh 6 trang; Phụ lục 5 trang. Luận án có 20
bảng số liệu, 35 hình và 150 tài liệu tham khảo bằng tiếng Việt và tiếng Anh.
NỘI DUNG LUẬN ÁN
CHƯƠNG 1. TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU
1.1. Độc tố thần kinh (neurotoxin)
Độc tố thần kinh (hay còn gọi là neurotoxin) là các chất độc có khả năng làm
tổn thương và phá huỷ các mô cũng như tế bào thần kinh. Độc tố thần kinh ức
chế sự kiểm soát nồng độ ion của tế bào thần kinh qua màng tế bào hoặc ức chế
sự trao đổi thông tin giữa các tế bào thần kinh qua synapse.
1.2. Conotoxin
1.2.1. Cấu trúc và phân loại
Conotoxin là độc tố thần kinh nằm ở phần bầu độc của các loài ốc cối biển
(Conus), có bản chất là các peptide/protein gồm 8-35 amino acid và giàu các cầu
nối disulfide để cố định hình dạng phân tử làm tăng khả năng bám của conotoxin
với đích đặc hiệu. Conotoxin được chia thành 5 loại gồm α-, δ-, κ-, µ- và ω-
conotoxin dựa vào sự sắp xếp của các gốc cysteine trong phân tử với đích tác
dụng chủ yếu là các kênh ion như Ca2+, Na+, K+ hay các thụ thể như
acetylcholine, NMDA
1.2.2. Tác dụng dược lý của conotoxin
Conotoxin đang được coi như các thuốc dẫn đầu trong điều trị giảm đau thần
kinh và các bệnh lý thần kinh, có tác dụng đặc hiệu trên các tổn thương thần kinh
như bệnh Alzheimer, Parkinson và chứng đa xơ cứng (multiple sclerosis). Bên
4
cạnh đó các conotoxin còn có triển vọng trong các nghiên cứu về các hội chứng
rối loạn co giật, đột quị, nhồi máu cơ tim, bảo vệ hệ tim mạch... Trong phần tổng
quan tài liệu chúng tôi chủ yếu đề cập đến tác dụng giảm đau và bảo vệ thần kinh
của conotoxin liên quan đến nội dung nghiên cứu.
1.3. Omega conotoxin MVIIA (CTX)
1.3.1. Cấu trúc của CTX
CTX được tách chiết từ bầu độc của ốc cối biển Conus magus, phân tử gồm
25 amino acid, trong đó có 6 gốc cysteine tạo thành ba cầu nối disulfide giữa các
vị trí 1-16, 8-20 và 15-25.
1.3.2. Tác dụng dược lý của CTX
CTX khóa chọn lọc các kênh Ca2+ type N, phân bố chủ yếu ở trong các tế
bào thần kinh tiền synapse. Khi CTX được truyền trực tiếp vào tuỷ sống, nó sẽ
liên kết với quai P trong tiểu phần đơn vị α1 ức chế mở kênh Ca2+, ngăn cản
dòng Ca2+ nhập bào đi vào trong tế bào thần kinh tiền synapse kéo theo ức chế
sự giải phóng các chất dẫn truyền thần kinh (neurotransmitters) trong cúc synape.
Từ đó tín hiệu thần kinh không được truyền qua khe synape, các dẫn truyền thần
kinh liên tục giữa các neuron thần kinh kế cận bị gián đoạn. Dựa trên cơ sở này
mà CTX có ứng dụng làm chất giảm đau và bảo vệ tế bào thần kinh trong mô
hình gây đột quị.
CHƯƠNG 2. VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.1. Vật liệu và hóa chất
Các chủng vi sinh: Chủng E. coli DH5α (Invitrogen, Mỹ), chủng E. coli BL21
(DE3) (Novagen, Mỹ).
Plasmid: Vector tác dòng pBT được cải biến từ vector pUC18 (do phòng Công
nghệ Tế bào Thực vật, Viện Công nghệ sinh học cung cấp) và vector biểu hiện
pET32c(+) (Novagen, Mỹ).
Động vật thí nghiệm: Chuột nhắt trắng dòng Swiss do Viện Vệ sinh Dịch tễ
Trung ương và Học viện Quân Y, Bộ Quốc phòng cung cấp.
Các hóa chất và thiết bị máy móc: Invitrogen, Novagen, Merck, New England
Biolab. Qiagen, Sigma.
5
2.2. Phương pháp nghiên cứu
Luận án sử dụng ba nhóm phương pháp nghiên cứu chính
2.2.1. Nhóm phương pháp tạo dòng, biểu hiện, tinh sạch và xác định CTX tái
tổ hợp
• Nhân gen mã hoá cho CTX bằng kỹ thuật PCR
• Tách dòng gen mã hoá cho CTX vào vector tách dòng và vector biểu hiện
• Xác định trình tự gen mã hoá cho CTX
• Biểu hiện và tối ưu hoá các điều kiện biểu hiện CTX ở E. coli
• Tinh sạch Trx-CTX tái tổ hợp bằng sắc ký ái lực Ni-NTA và sắc ký lọc
gel Sephacryl S100
• Tinh sạch peptide CTX bằng enterokinase và cột siêu lọc VIVASPIN 500
• Xác định khối lượng phân tử CTX bằng khối phổ
2.2.2. Nhóm phương pháp xác định đặc tính của CTX tái tổ hợp
• Thử nghiệm hoạt tính giảm đau của peptide CTX trên mô hình chuột
thực nghiệm bằng phương pháp Formalin
2.2.3. Nhóm phương pháp xử lý số liệu bằng tin sinh học
• Blast, DNAclub, BioEdit, ConcoSever, ImageJ, Alalyst QS, thống kê
sinh học
CHƯƠNG 3. KẾT QUẢ
3.1. THIẾT KẾ TẠO GEN MÃ HOÁ CHO CTX
Từ kết quả khảo sát hệ protein nọc của các loài ốc cối thu thập được ở vùng
biển Nha Trang, Việt Nam, hơn 40 loại conotoxin đã nhận dạng được bằng hệ
thống khối phổ LC-MS/MS. Một số conotoxin có tiềm năng ứng dụng trong y
dược như omega conotoxin MVIIA cũng được tìm thấy từ nguồn ốc cối của Việt
Nam (Lê Thị Bích Thảo et al., 2011). Kết hợp với các thông tin về trình tự
peptide và nucleotide của omega conotoxin MVIIA được tìm kiếm trên
ConoServer (Hình 3.2). Chúng tôi tiến hành nghiên cứu thiết kế, biểu hiện và thử
nghiệm hoạt tính giảm đau của omega conotoxin MVIIA tái tổ hợp (CTX tái tổ
6
hợp). Sơ đồ nghiên cứu trên Hình 3.1. Do kích thước gen mã hóa cho CTX khá
nhỏ, gồm 75 nucleotide mã hóa cho 25 amino acid nên gen ctx được tổng hợp
trực tiếp bằng 2 mồi bổ sung với nhau ctx1 với ctx 2 và ctx3 với ctx4 theo
nguyên tắc bổ sung A-T, G-C. Trong đó mỗi mồi dài khoảng từ 45 - 55 bp, ctx1
chứa điểm cắt của enzyme giới hạn NcoI và ctx4 chứa điểm cắt của EcoRI để
thuận lợi cho mục đích biểu hiện trong hệ vector pET32c+.
Hình 3.1. Sơ đồ nghiên cứu
Hình 3.2. Kết quả tìm kiếm trình tự gen mã hoá cho CTX trên ConoServer
(Nguồn: www.conoserver.org)
7
Quá trình tạo dòng gen mã hóa peptide CTX được thực hiện như sau: Trước
khi thực hiện phản ứng PCR, các đoạn mồi được phosphoryl hóa bởi T4 PNK.
Hỗn hợp 1 (ctx1, ctx2) và hỗn hợp 2 (ctx3, ctx4) được trộn đều với nhau, sau đó
được biến tính ở 95oC trong 3 phút trước khi giảm dần xuống 45oC ở nhiệt độ
phòng, tạo điều kiện thuận lợi cho các đoạn mồi bắt cặp bổ sung với nhau. Phản
ứng nối hai đoạn DNA sợi đôi mới được hình thành được thực hiện bởi enzyme
T4 ligase ở 14oC để tạo phân tử ctx (Hình 3.3).
Hình 3.3. Sơ đồ mô tả chuỗi phản ứng tạo gen mã hóa cho peptide CTX và trình tự các cặp
mồi đã thiết kế
3.2. TẠO DÒNG GEN MÃ HÓA CHO CTX
3.2.1. Kết quả nhân gen mã hóa cho CTX bằng kỹ thuật PCR
Sản phẩm của phản ứng nối ghép được pha loãng 200 lần và sử dụng làm
khuôn cho phản ứng PCR với cặp mồi ctx1 và ctx4. Gen mã hóa cho protein
CTX được nhân lên bằng kỹ thuật PCR có kích thước 75 bp. Cặp mồi để nhân
đoạn gen này được thiết kế và tổng hợp gồm: Mồi xuôi với trình tự nhận biết của
enzyme giới hạn NcoI mang mã khởi đầu dịch mã ở E. coli nối với đoạn trình tự
nucleotide của một nửa gen ctx. Mồi ngược là trình tự nucleotide nửa gen ctx còn
lại nối tiếp với trình tự nhận biết của enzyme giới hạn EcoRI mang mã kết thúc.
8
Hình 3.4. Kết quả nhân gen mã hóa cho
CTX
M: Thang DNA chuẩn 100 bp
Đường chạy (ĐC) số 1: Sản phẩm gen mã
hóa cho CTX
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR trên gel agarose 1,7% được thể
hiện trên Hình 3.4 cho thấy, đường chạy số 1 cho một băng DNA duy nhất có
kích thước khoảng 100 bp phù hợp với tính toán lý thuyết (gồm đoạn gen và
mồi). Sản phẩm PCR sau đó được sử dụng trực tiếp để đưa vào vector tách dòng
pBT đã mở vòng. Tổ hợp gen mới (plasmid tái tổ hợp) được tạo thành được biến
nạp vào tế bào tách dòng DH5α để chọn ra dòng plasmid có khả năng mang gen mã
hoá cho CTX (CTXpBT).
3.2.2. Tách dòng gen mã hóa cho CTX
DNA plamid được tách chiết từ các khuẩn lạc đã chọn tiếp tục được kiểm tra
song song bằng hai phương pháp gồm cắt kiểm tra plasmid tái tổ hợp bằng
enzyme giới hạn BamHI và PCR trực tiếp từ khuẩn lạc bằng cặp mồi ctx1 và
ctx4 để chọn ra dòng mang gen ctx. Sản phẩm thu được từ 2 phương pháp này
được kiểm tra bằng điện di trên gel agarose 1,7% (Hình 3.5 và 3.6).
Kết quả trên Hình 3.5 cho thấy tại các đường chạy 4, 5, 6 và 8, mẫu DNA
plasmid sau khi xử lý bằng enzyme giới hạn BamHI đã xuất hiện 2 băng: băng
thứ nhất có kích thước khoảng 2700 bp chính là vector pBT nguyên gốc đã được
mở vòng thành dạng mạch thẳng; băng thứ hai có kích thước tương đương với
kích thước của sản phẩm PCR so với thang DNA chuẩn, khoảng 100 bp. Trong
khi đó tại đường chạy số 2, 3 và 7 chỉ có một băng duy nhất tương ứng với
vector pBT ở đường chạy số 1. Như vậy các dòng 4, 5, 6 và 8 là các plasmid tái
tổ hợp có khả năng mang gen mã hóa cho CTX
9
Hình 3.5. Kết quả kiểm tra sản phẩm cắt plasmid
tái tổ hợp bởi BamHI
M: thang DNA chuẩn 100 bp; ĐC 1: vector pBT
nguyên thể; ĐC 2, 3 và 7: các plasmid không có tổ
hợp gen mới chèn vào; ĐC 4, 5, 6 và 8: các
plasmid có khả năng mang gen mới chèn vào
Hình 3.6. Kết quả điện di sản phẩm PCR
chọn lọc khuẩn lạc trên gel agarose 1,7%
M: thang DNA chuẩn; ĐC 1 - 4: sản phẩm PCR
từ các dòng tế bào chọn kiểm tra; ĐC 5: Sản
phẩm PCR mục 3.1.1
Kết quả kiểm tra song song bốn dòng plasmid này bằng phương pháp PCR
trực tiếp từ khuẩn lạc sử dụng cặp mồi đặc hiệu (ctx1 và ctx4) với đối chứng
dương là sản phẩm PCR trong Hình 3.4 được thể hiện trên Hình 3.6 cũng cho kết
quả tương tự, thu được một băng DNA duy nhất có kích thước khoảng 100 bp so
với thang DNA chuẩn. Như vậy 4 dòng tế bào 4, 5, 6 và 8 trong Hình 3.5 có khả
năng chứa gen mã hóa cho CTX.
3.2.3. Kết quả xác định trình tự gen mã hóa cho CTX
Hai trong bốn dòng tế bào có khả năng mang gen mã hóa cho CTX được tiến
hành kiểm tra xác định trình tự gen trên Hệ thống ABI PRISM 3100 Avant Genetic
Analyzer. Mồi M13F và M13R được sử dụng để đọc kiểm tra từ 2 đầu của đoạn
gen. Mỗi dòng plasmid được tiến hành đọc 3 lần để đảm bảo độ chính xác theo
nguyên tắc thống kê. Kết quả xác định trình tự của cả 2 dòng plasmid là giống hệt
nhau sau khi xử lý bằng các phần mềm tin sinh Clutal X và BioEdit (Hình 3.8).
Kết quả trên Hình 3.8 đã cho thấy gen được tạo dòng có kích thước 75 bp, có
độ tương đồng 100% so với trình tự nucleotide vùng peptide trưởng thành của
ctx được tìm thấy trên ConoServer với số đăng ký N01765. Đồng thời đoạn
nucleotide này mã hóa cho 25 amino acid cũng có độ tương đồng 100% với trình
tự của peptide CTX với số đăng ký trên. Các kết quả trên khẳng định gen mã hóa
cho CTX đã được dòng hóa vào vector pBT.
10
CTX1
CTX3
N01756 CKGKGAKCSRLMYDCCTGSCRSGKC
CTX CKGKGAKCSRLMYDCCTGSCRSGKC
* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *
Hình 3.8. Phổ trình tự nucleotide đoạn gen ctx mã hóa cho ω-conotoxin MVIIA và so sánh trình tự
amino acid của CTX với trình N01765 trên ConoSever
3.3. BIỂU HIỆN CTX TÁI TỔ HỢP
3.3.1. Thiết kế vector biểu hiện CTXpET32c
Gen mã hóa cho CTX sau khi đã được tách dòng vào vector pBT và xác định
đúng trình tự thiết kế được chuyển vào vector pET32c (+) để biểu hiện. Vector
tách dòng CTXpBT và vector pET32c cùng đồng thời được xử lý với hai enzyme
giới hạn là NcoI và EcoRI để tạo đầu dính tương hợp giữa đoạn gen cần chèn và
vector (Hình 3.9).
Hình 3.9. (A) Điện di sản phẩm cắt
bởi NcoI và EcoRI. (B) Điện di sản
phẩm sau khi thôi gel
M: thang DNA chuẩn; ĐC 1: pET32c+
đã mở vòng; ĐC 2: Sản phẩm PCR;
ĐC 3: CTXpBT sau khi xử lý bởi NcoI
và EcoRI; ĐC 4: ctx sau khi thôi gel;
ĐC 5: pET32c+ mở vòng sau khi thôi
gel.
11
Kết quả trên Hình 3.9 A là sản phẩm sau khi xử lý bằng 2 enzyme giới hạn
NcoI và EcoRI cho thấy, đường chạy (ĐC) số 1 có một băng DNA duy nhất có
kích thước 5,9 Kb, đây là vector pET32c+ đã mở vòng. ĐC số 3 xuất hiện 2
băng: băng trên có kích thước 2,7 Kb là vector pBT bị cắt văng ra và băng thấp
hơn có kích thước khoảng 100 bp tương đương với sản phẩm PCR ở đường chạy
số 2 là gen mã hóa cho CTX.
Sử dụng kít QIAGEN để tách vector pET32c+ và gen đích như đã mô tả ở
phần phương pháp. Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm thôi gel (Hình 3.9 B) cho
thấy, các băng DNA thôi ra đạt độ tinh sạch cần thiết để thực hiện các thí nghiệm
tiếp theo. Gen mã hóa cho CTX và vector pET32c+ được nối ghép với nhau nhờ
enzyme T4 DNA ligase. Sản phẩm gắn kết được biến nạp vào chủng E. coli
DH5α để chọn dòng những vector pET32c (+) có chứa gen ctx. Vector tái tổ hợp
này được ký hiệu là CTXpET32c và sau đó được biến nạp vào chủng E. coli
BL21(DE3) để biểu hiện.
3.3.2. Biểu hiện CTX tái tổ hợp
Tế bào E. coli BL21(DE3) chứa tổ hợp gen mới CTXpET32c được nuôi cấy
trên môi trường LB đặc sau đó được chuyển sang môi trường LB lỏng đều được
bổ sung kháng sinh ampicillin đến nồng độ cuối cùng 100 µg/ml. Dịch tế bào sau
khi cấy chuyển với tỷ lệ 1%, nuôi lắc ở 37oC đến khi OD600 đạt từ 0,6 - 0,8 thì
được cảm ứng bởi IPTG đến nồng độ cuối cùng 0,5 mM. Sinh khối tế bào được
thu ở các thời điểm 0h (trước khi cảm ứng) và 3h (sau khi cảm ứng) để tiến hành
điện di kiểm tra sự biểu hiện của protein dung hợp mới.
Hình 3.10. Biểu hiện protein dung hợp
Trx-CTX trên gel polyacrylamide 12,6%
M: thang protein chuẩn SM0431; ĐC 0h:
protein tổng số tại thời điểm 0 giờ (trước khi cảm
ứng); ĐC 3h: protein tổng số tại thời điểm 3 giờ
(sau cảm ứng).
12
Protein tổng số được biểu hiện từ các dòng tế bào cảm ứng và đối chứng
không cảm ứng của cùng một dòng tế bào được kiểm tra điện di bằng SDS-
PAGE 12,6% (Hình 3.10).
Kết quả trên Hình 3.10 cho thấy, ở đường chạy 3h là protein tổng số tại thời
điểm 3 giờ sau khi cảm ứng bởi IPTG, xuất hiện một băng protein mới so với
đường chạy 0h là protein tổng số tại thời điểm 0 giờ (trước khi cảm ứng), có kích
thước khoảng 20,5 kDa so với thang protein chuẩn. Thực chất CTX chỉ có kích
thước khoảng 3 kDa, nhưng khi được biểu hiện trong vector pET32c+ sẽ tạo ra
protein dung hợp với thioredoxin (Trx) và một nhóm 6 gốc Histidine trong vector
pET32c+, do vậy băng protein mới xuất hiện có kích thước phù hợp với tính toán
lý thuyết (bao gồm 109 amino acid của Trx và đuôi His.Tag).
3.3.3. Khảo sát các điều kiện biểu hiện CTX tái tổ hợp ở E. coli
Sau khi protein tái tổ hợp được biểu hiện, việc tối ưu hoá điều kiện biểu hiện
và khả năng tan của protein tái tổ hợp đóng vai trò then chốt và quyết định cho
quá trình tinh sạch cũng như kiểm tra hoạt tính của protein này. Các điều kiện
biểu hiện được thiết lập theo thời gian, nồng độ IPTG, độ pH của môi trường và
thời gian thu mẫu là các thông số quan trọng phục vụ quá trình lên men.
3.3.3.1. Khảo sát mức độ biểu hiện và độ tan của CTX tái tổ hợp theo nhiệt độ
Dòng thế bào E. coli BL31(DE3) chứa plasmid CTXpET32c đã được nghiên
cứu biểu hiện ở 4 nhiệt độ khác nhau là 22, 28, 30 và 37oC để so sánh độ tan
cũng như mức độ biểu hiện của CTX tái tổ hợp. Sau 1 giờ cảm ứng bởi IPTG,
sinh khối tế bào được thu lại. Siêu âm phá màng tế bào trong đệm thích hợp (50
mM Tris HCl pH 7; 0,01% Triton X100 và 0,0001% Lysozyme) rồi sau đó ly
tâm chia thành 2 pha: pha cặn và pha tan. Các mẫu của 2 pha được điện di kiểm
tra trên gel SDS-PAGE 12,6% (Hình 3.11).
Kết quả nhận được cho thấy, ở cả 4 điều kiện nhiệt độ đã khảo sát, protein tái
tổ hợp hầu hết xuất hiện ở pha tan (đường chạy T) với 1 băng đậm, rõ nét có kích
thước khoảng 20,5 kDa so với thang protein chuẩn mà không thấy hoặc xuất hiện
với hàm lượng nhỏ so với pha cặn (Đường chạy C) và dòng tế bào không được
cảm ứng bởi IPTG (ĐC 1).Kết quả định lượng sự biểu hiện của protein dung hợp
ở 4 nhiệt độ đã khảo sát bằng phần mềm ImageJ cho thấy mức độ biểu hiện của
13
protein dung hợp ở 22oC là thấp nhất, ở 28oC tăng 1,8 lần, ở 30oC tăng 2,3 lần và
ở 37oC tăng 4,5 lần so với mức độ biểu hiện của protein này ở 22oC (Bảng 1, phụ
lục). Tại 37oC, protein dung hợp Trx-CTX được biểu hiện nhiều nhất vì đây là
nhiệt độ tối ưu cho vi khuẩn hoạt động. Do đó khi lên men sản xuất lượng lớn có
thể tạo ra hiệu suất biểu hiện cao hơn nhờ điều kiện sinh trưởng tối ưu của chủng
tái tổ hợp này là 370C.
Hình 3.11. Mức độ biểu hiện và
độ tan của protein dung hợp
Trx-CTX ở nhiệt độ khác nhau
M: Thang protein chuẩn SM0431
(Fermentas); ĐC 1: Protein tổng
số biểu hiện không được cảm
ứng bởi IPTG; ĐC C: Protein pha;
ĐC T: Protein pha tan.
Như vậy có thể nhận thấy phần lớn protein tái tổ hợp (Trx-CTX) được biểu
hiện ở pha tan và không phụ thuộc vào các nhiệt độ đã nghiên cứu.
3.3.3.2. Khảo sát mức độ biểu hiện của CTX tái tổ hợp theo nồng độ chất cảm
ứng IPTG
Kết quả khảo sát (Hình 3.12) cho thấy, mức độ biểu hiện của Trx-CTX thay
đổi theo các nồng độ chất cảm ứng IPTG. Bắt đầu cảm ứng với nồng độ 0,2 mM
IPTG thì xuất hiện băng protein mới so với chế độ nuôi không cảm ứng (ĐC số
9). Kết quả định lượng sự biểu hiện của protein dung hợp cho thấy tại nồng độ
0,5mM IPTG, Trx-CTX được biểu hiện nhiều nhất và gấp khoảng 4 lần so với
mức độ biểu hiện của protein này khi cảm ứng bởi 0,2 mM IPTG. Mức độ biểu
hiện của Trx-CTX ở nồng độ IPTG là 0,7 mM gấp 3 lần so với mức độ biểu hiện
của protein này ở 0,2mM. Mức độ biểu hiện của Trx-CTX thay đổi không đáng kể
ở nồng độ cảm ứng 0,9 mM IPTG và 1,2 mM IPTG sau đó giảm dần theo nồng độ
chất cảm ứng (Bảng 2, Phụ lục). Điều này có thể giải thích do IPTG dư thừa đã ức
chế sự sinh tổng hợp protein dung hợp. Như vậy chủng E. coli BL21(DE3) mang
plasmid CTXpET32c biểu hiện tối ưu tại 0,5 mM IPTG.
14
Hình 3.12. Mức độ biểu hiện
của Trx-CTX theo nồng độ
chất cảm ứng IPTG
M: Thang protein chuẩn
SM0431 (Fermentas); ĐC 1-
8: Protein tổng số của vi
khuẩn sau 2h cảm ứng biểu
hiện bằng IPTG ở các nồng
độ khác nhau; ĐC 9: Protein
tổng số của vi khuẩn không
được cảm ứng bởi IPTG.
3.3.3.3. Khảo sát mức độ biểu hiện của Trx-CTX theo pH môi trường nuôi cấy
Mức độ biểu hiện của Trx-CTX khác nhau ở các điều kiện pH (từ 6 – 8) đã
nghiên cứu (Hình 3.13). Tại pH bằng 7,0, mức độ biểu hiện của Trx-CTX là cao
nhất so với các pH môi trường là 6; 6,5; 7,5 và 8. Nhìn chung, chủng E. coli tái
tổ hợp sinh trưởng cũng như sinh tổng hợp Trx-CTX tốt trong dải pH từ 6-8 song
tốt nhất ở pH 7,0 (Bảng 3, phụ lục).
Hình 3.13. Mức độ biểu hiện
của Trx-CTX theo pH môi
trường nuôi cấy
M: Thang protein chuẩn
SM0431 (Fermentas); ĐC 1:
Protein tổng số của vi khuẩn
không được cảm ứng bởi IPTG.
ĐC 2-8: Protein tổng số của vi
khuẩn sau 3h cảm ứng biểu
hiện bằng 0,5 mM IPTG ở các
môi trường pH khác nhau.
3.3.3.4. Khảo sát thời gian thu mẫu
Tiến hành khảo sát thời gian thu mẫu của chủng E. coli mang plasmid
CTXpET32c khi được biểu hiện ở 37oC ở quy mô nuôi trong bình tam giác 500
ml. Sau 3 giờ cấy chuyển mật độ tế bào OD600nm đạt 0,7 là thời điểm thích hợp
15
tiến hành cảm ứng với IPTG. Sau 11 giờ cảm ứng, mật độ tế bào cao nhất sau đó
giảm dần (Hình 3.14).
Hình 3.14. Mối tương quan giữa
thời gian nuôi cấy và giá trị
OD600nm dịch lên men chủng vi
khuẩn E. coli BL21 (DE3) biểu
hiện Trx-CTX trong bình tam
giác 500 ml
Mức độ biểu hiện của protein dung hợp tại các thời điểm thu mẫu được kiểm
tra bằng điện di SDS-PAGE (Hình 3.15).
Hình 3.15. Mức độ biểu
hiện của Trx-CTX theo thời
gian thu mẫu trên SDS-
PAGE
M: Thang protein chuẩn
SM0431 (Fermentas); ĐC
1h-13h: Protein tổng số của
vi khuẩn tại các thời điểm 1
giờ -13 giờ sau khi cảm ứng.
Kết quả thể hiện trên Hình 3.15 cho thấy, mức độ biểu hiện của protein dung
hợp Trx-CTX tăng dần theo thời gian thu mẫu đến từ 2 giờ đến 11giờ sau khi
cảm ứng, đến thời điểm 13 giờ (hay 16 giờ tính từ khi nuôi cấy), mức độ biểu
hiện prtoein tái tổ hợp giảm hẳn. Như vậy, thời điểm thu mẫu tốt nhất là sau 11
giờ cảm ứng hay sau 14 giờ nuôi cấy trong bình tam giác.
16
Từ các kết quả khảo sát cho thấy, CTX tái tổ hợp được biểu hiện tốt ở 37oC,
pH 7,0, nồng độ chất cảm ứng IPTG là 0,5 mM và sinh khối tế bào đạt giá trị cực
đại sau 14 giờ khi nuôi cấy trong bình tam giác, đồng thời độ tan của protein tái
tổ hợp không phụ thuộc vào các nhiệt độ đã khảo sát.
3.4. TINH SẠCH CTX TÁI TỔ HỢP
3.4.1. Tinh chế protein dung hợp Trx-CTX bằng sắc ký ái lực Ni-NTA và sắc
ký lọc gel Sephacryl S100
Gen ctx được biểu hiện trong hệ vector pET32c sẽ dung hợp cùng đoạn DNA
mã hóa cho 109 amino acid của Trx, tăng tính tan của protein được biểu hiện và
trình tự mã hóa cho His.Tag tạo điều kiện thuận lợi cho bước tinh sạch tiếp theo.
Hình 3.16. SDS-PAGE
của các phân đoạn
protein thu được sau
sắc ký ái lực Ni-NTA
M: Thang protein
chuẩn (SM 0431-
Fermentas); ĐC T: Pha
tan đưa lên cột sắc ký
ái lực; ĐC F1-F6: Các
phân đoạn sắc ký ái
lực thu được.
Các phân đoạn thu được sau sắc ký ái lực được gom lại và thẩm tích loại
muối sau đó cho qua cột sắc ký lọc gel Sephacryl S-100. Nồng độ protein của các
phân đoạn này được định lượng bằng phương pháp Bradford (Bảng 10, Phụ lục).
Phân đoạn protein tinh sạch từ sắc ký ái lực và sắc ký lọc gel được điện di trên
gel SDS-PAGE 12,6 % để kiểm tra độ sạch của protein tái tổ hợp thu được bằng
phần mềm định lượng ImageJ (Hình 3.17).
17
Hình 3.17. Điện di
protein kiểm tra các
phân đoạn tinh chế Trx-
CTX bằng sắc ký ái lực
Ni-NTA và sắc ký lọc gel
S-100 trên gel
polyacrylamide 12,6%
M: thang protein chuẩn.
Kết quả thể hiện trên Hình 3.17 cho thấy pha tan (ký hiệu là Tan) chứa phần
lớn protein tái tổ hợp so vớ pha cặn (ký hiệu là Cặn) sau ly tâm. Kết quả này phù
hợp với kết quả khảo sát mức độ tan của protein tái tổ hợp Trx-CTX ở Mục
3.3.3.1. Phân đoạn sau khi tinh sạch bằng sắc ký ái lực Ni-NTA vẫn còn 1 số
băng phụ, trong khi đó phân đoạn protein sau khi đi qua cột Sephacryl S-100 chỉ
có một băng protein duy nhất chứng tỏ qua 2 lần sắc ký protein tái tổ hợp đã đạt
được độ tinh sạch cần thiết để thực hiện các nghiên cứu tiếp theo. Nồng độ
protein của phân đoạn thu được qua cột sắc ký lọc gel được xác định bằng
phương pháp Bradford là 5 mg/ml (Bảng 10, Phụ lục). Kết hợp với kết quả định
lượng bằng phần mềm ImageJ, chúng tôi xác định được độ sạch của Trx-CTX
qua 2 lần sắc ký là 96,6 % (Bảng 3.3)
Như vậy, hiệu suất của quá trình lên men biểu hiện và tinh sạch Trx-CTX
trong bình tam giác đạt 9 mg/200 ml dịch tế bào nuôi cấy, tương đương với 45
mg/L dịch tế bào nuôi cấy.
3.4.2. Lên men thu sinh khối E. coli BL21 (DE3) mang plasmid CTXpET32c
ở qui mô 4 lít/ mẻ
Các thử nghiệm xác định đặc tính của Trx-CTX đòi hỏi một lượng protein tái tổ
hợp lớn, do đó chúng tôi đã tiến hành nghiên cứu lên men thu protein này ở quy mô
4lít/mẻ sử dụng hệ thống lên men BioFlo 110 Fermentor (Mỹ) (Hình 3.18).
18
Hình 3.18. Mối tương quan giữa thời gian nuôi cấy và giá trị OD600nm dịch lên men chủng vi
khuẩn E. coli BL21(DE3) biểu hiện Trx-CTX
Đường màu xanh: Đường cong sinh trưởng của tế bào lên men ở bình tam giác 500 ml;
Đường màu đỏ: Đường cong sinh trưởng của tế bào lên men ở qui mô 4 lít/mẻ.
Kết quả trên Hình 3.18 cho thấy, đường màu đỏ là đường cong sinh trưởng
của chủng tế bào E. coli BL21 (DE3) biểu hiện trong bình lên men 4 lít. Tại thời
điểm 2,7 giờ sau khi cấy chuyển mật độ tế bào OD600nm đạt 0,795 thì tiến hành
cảm ứng với IPTG đến nồng độ cuối cùng 0,5 mM. Sau 10 giờ nuôi cấy mật độ
tế bào đạt lớn nhất là 5,0 sau đó giảm dần. Đây là thời gian thích hợp để dừng
quá trình lên men. Trong khi đó mật độ tế bào nuôi trong bình tam giác đạt giá trị
cực đại sau 14 giờ nuôi cấy là 4,7. Điều này có thể lý giải là do khi được nuôi
cấy trong hệ thống lên men với các ưu việt như pH môi trường và nồng độ oxy
hòa tan được điều chỉnh ổn định nên tốc độ sinh trưởng của vi khuẩn trong bình
lên men nhanh hơn ở bình tam giác.
Sinh khối tế bào được thu lại theo đơn vị 200 ml dịch nuôi cấy và tiến hành
siêu âm phá tế bào và tinh chế Trx-CTX bằng sắc ký ái lực và sắc ký lọc gel.
Hiệu suất của quá trình lên men, biểu hiện và tinh sạch đạt 12 mg/200 ml dịch
sinh khối tế bào lên men hay tương đương 60 mg/L dịch sinh khối tế bào. Như
vậy khi lên men bằng hệ thống BioFlo, hiệu suất sinh tổng hợp Trx-CTX đã tăng
lên 60 mg/L dịch sinh khối tế bào.
3.4.3. Tinh sạch peptide CTX
Gen mã hóa cho CTX được thiết kế trong vector pET32c+ dưới dạng sơ đồ
hóa trong Hình 3.19. Enterokinase cắt sau gốc Lys của trình tự 5 amino acid Asp
19
– Asp – Asp - Asp - Lys đảm bảo phần peptide thu được không chứa thêm một
amino acid nào của đoạn dung hợp.
Hình 3.19. Sơ đồ thiết kế gen mã hóa CTX trong vector pET32c+
Phản ứng cắt protein dung hợp Trx-CTX bằng Enterokinase được thực hiện ở
25oC trong khoảng 16 giờ để loại bỏ phần dung hợp đi kèm. Hỗn hợp peptide thu
được được kiểm tra bằng điện di SDS-PAGE (Hình 3.20).
Hình 3.20. SDS-PAGE hỗn hợp peptide sau khi
cắt bởi Enterokinase
M: thang protein chuẩn; ĐC 1: Hỗn hợp peptide
thu được sau khi xử lý với Enterokinase.
Kết quả thể hiện trên Hình 3.20 cho thấy, hỗn hợp peptide thu được sau khi
thuỷ phân bởi Enterokinse cho 3 băng protein với kích thước khác nhau. Băng
thấp nhất có kích thước nhỏ hơn 14,4 kDa so với thang protein chuẩn, đây có khả
năng chính là peptide CTX đã được loại bỏ Trx. Băng thứ 2 nằm có kích thước
nằm giữa khoảng 14,4 và 18,4 kDa, đây có thể là đoạn protein dung hợp Trx của
vector pET32c và băng trên cùng có kích thước khoảng 20,5 kDa là protein dung
hợp Trx-CTX không bị cắt hoàn toàn. Hỗn hợp peptide thu được tiếp tục được
tinh sạch bằng cột siêu lọc VIVASPIN 500 (VIVASCIENCE - chỉ cho những
20
phân tử có kích thước nhỏ hơn 5 kDa đi qua) để thu lại peptide CTX. Dịch qua
cột được xác định nồng độ bằng phương pháp Bradford, từ 10 mg Trx-CTX thu
lại được 0,9 mg peptide CTX (theo lý thuyết khi hiệu suất phản ứng cắt đạt 100%
thì phải thu được 1,315 mg vì khối lượng CTX chiếm khoảng 1/7,6 phân tử Trx-
CTX). Như vậy hiệu suất của phản ứng này đạt 76% do phản ứng cắt bởi
Enterokinase đã thực hiện không hoàn toàn.
Peptide CTX thu được được kiểm tra bằng điện di SDS-PAGE 12,6 % (Hình
3.21) và xác định nồng độ bằng phương pháp Bradford (Bảng 11, Phụ lục).
Hình 3.21. Điện di peptide CTX được
tinh chế sau khi loại bỏ đuôi Trx và
His.Tag bằng cột siêu lọc VIVASPIN
500 (VIVASCIENCE)
M: thang protein chuẩn; ĐC 1: Peptide
CTX sau khi loại bỏ đuôi His.Tag và Trx
bằng cột siêu lọc VIVASPIN 500
(VIVASCIENCE).
Kết quả cho thấy chỉ thu được một băng protein duy nhất, có kích thước < 14
kDa. Sử dụng phần mềm định lượng ImageJ để xác định hàm lượng băng peptide
CTX. Kết hợp 2 phương pháp này cho thấy CTX tái tổ hợp được tinh chế có độ
sạch 97,5% (Bảng 3.3). Như vậy, quá trình tinh sạch bằng cột Vivaspin đã đạt độ
sạch cao, đảm bảo chất lượng cho các thí nghiệm tiếp theo.
Hàm lượng protein trong pha tan sau siêu âm tế phá bào từ 1 lít dịch lên men
được xác định bằng phương pháp Bradford là 500 mg. Như vậy quá trình tinh
sạch CTX tái tổ hợp được trình bày trong Bảng 3.1 và Bảng 3.2.
Bảng 3.1. Hiệu suất thu hồi sau khi tinh sạch Trx-CTX tái tổ hợp từ 1 lít dịch sinh khối tế bào lên men chủng E. coli
BL21 DE3 chứa plasmid CTXpET32c
Bước tinh sạch
Nồng độ protein
(mg/ml) Thể tích (ml)
Tổng protein
(mg)
Hiệu suất thu
hồi (%)
Dịch phá tế bào bằng siêu âm 5,0 100 500 100
Sắc ký ái lực Ni-NTA 3,75 20 75 15
Sắc ký lọc gel Sephacryl S-100 5,0 12 60 12
21
Bảng 3.2. Hiệu suất thu hồi sau khi tinh sạch CTX từ Trx-CTX
Bước tinh sạch
Nồng độ protein (mg/ml)
Thể tích (ml)
Tổng peptide
(mg)
Hiệu suất thu
hồi (%)
Dịch chứa Trx-CTX và được thuỷ
phân với enterolkinase
1,00
10 10
100
Tinh sạch qua cột Vivaspin 500
0,09
10 0,9
9
Từ 1 lít dịch sinh khối tế bào lên men, 60 mg Trx-CTX được tinh sạch với
hiệu suất thu hồi 12% và độ sạch là 96,6% (Bảng 3.3). Protein dung hợp thu
được tiếp tục được xử lý với enterokinase để loại bỏ trình tự Trx và tinh sạch
CTX bằng cột siêu lọc Vivaspin. Từ 10 mg Trx-CTX thu được 0,9 mg peptide
CTX với hiệu suất thu hồi là 9% (Bảng 3.2) và độ sạch là 97,5% (Bảng 3.3).
Các bước tinh
sạch
Nồng độ(µg/ml)
(Xác định bằng Bradford)
Nồng độ(µg/ml)
(Xác định bằng ImageJ)
Độ sạch (%) Các bước tinh sạch
Sắc ký ái lực tinh
sạch Trx-CTX 3750 3370,0 90,0
Sắc ký ái lực tinh
sạch Trx-CTX
Sắc ký lọc gel S-
100 tinh sạch Trx-
CTX
5000 4832,0 96,6
Sắc ký lọc gel S-
100 tinh sạch
Trx-CTX
Tinh sạch CTX
bằng cột Vivaspin 90 87,5 97,5
Tinh sạch CTX
bằng cột Vivaspin
3.5. XÁC ĐỊNH KHỐI LƯỢNG PHÂN TỬ CTX BẰNG PHƯƠNG PHÁP
KHỐI PHỔ MALDI -TOF
Sau khi được tinh sạch, băng peptide được thu lại và xử lí theo phương pháp
đã được mô tả Mục 2.2.1.16 để tiến hành phân tích phổ khối. Nhờ năng lượng
của tia laser, các phân tử matrix phân ly ra thành các proton (H+), làm ion hoá
các phân tử CTX. Dưới tác dụng của điện trường, ion CTX-H+ được xác định
bằng thời gian bay (Time of flight, TOF) và kết quả thu được bằng cách sử dụng
phần mềm Analyst QS V1.1 (Hình 3.22).
Kết quả xác định phổ khối MALDI-TOF (Hình 3.24) cho thấy xuất hiện một
đỉnh có cường độ mạnh nhất với giá trị m/z bằng 2769 amu, tương ứng với ion
phân tử CTX-H+, các đỉnh còn lại là phổ của các phân tử dung môi. Như vậy
khối lượng phân tử của CTX sẽ bằng 2769 Da. Kết quả này phù hợp với tính
toán lý thuyết về khối lượng peptide tái tổ hợp đã thiết kế đồng thời phù hợp với
khối lượng peptide này trên cơ sở dữ liệu Expasy (
22
bin/peptide_mass/peptide-mass.pl). Conotoxin tái tổ hợp đã được biểu hiện ổn
định ở dạng dung hợp với Trx trong E. coli, peptide CTX sau khi được tinh chế
bằng các phương pháp sắc ký, kiểm tra độ sạch, khối lượng phân tử một cách
tương đối bằng SDS-PAGE và ImageJ đã được nhận dạng chính xác bằng
phương pháp khối phổ.
Hình 3.22. Phổ MALDI -TOF của peptide CTX tái tổ hợp tinh sạch
3.6. HOẠT TÍNH GIẢM ĐAU CỦA CTX TÁI TỔ HỢP TRÊN MÔ HÌNH
CHUỘT THỰC NGHIỆM BẰNG TÁC NHÂN GÂY ĐAU FORMALIN
CTX dạng tự nhiên được tách chiết từ bầu độc của ốc cối Conus magus đã
được chứng minh có hoạt tính giảm đau tốt (Endean et al., 1974). Hoạt tính giảm
đau của CTX tái tổ hợp được tiến hành thử nghiệm trên chuột thực nghiệm bằng
mô hình Formalin theo Zhang và cs (Zhang et al., 2007) với đối chứng dương là
Lidocain (chất giảm đau đang được bán trên thị trường). Sau khi khảo sát liều
cận trên và liều cận dưới của CTX, liều thử nghiệm được lựa chọn là 3,5 µg/g thể
trọng chuột. Liều tiêm Lidocain được lựa chọn là 600 µg/g thể trọng chuột theo
khuyến cáo của nhà sản xuất có tác dụng giảm đau trong 1 giờ. Kết quả thử
nghiệm được thể hiện trên Hình 3.25.
Hình 3.25 cho thấy, chỉ trong các khoảng thời gian sau 5 phút và 20-25 phút
sau khi tiêm, chuột nhắt được tiêm CTX tái tổ hợp có thời gian liếm chân cao
hơn một chút so với chuột được tiêm Lidocain còn trong suốt thời gian còn lại
thời gian liếm chân của chuột tiêm CTX tái tổ hợp ít hơn hẳn so với chuột tiêm
nước muối sinh lý và Lidocain.
800 1000 1200 1400 1600 1800 2000 2200 2400 2600 2800 m/z
23
Hình 3.25. Hoạt tính giảm đau của CTX tái tổ hợp trên mô hình Formalin
Cả hai lô chuột tiêm CTX tái tổ hợp và tiêm Lidocain đều có thời gian chuột
liếm chân ít hơn chuột của lô tiêm nước muối sinh lý với p<0.001, nhưng sự
khác nhau giữa lô tiêm CTX tái tổ hợp và lô tiêm Lidocain lại không có ý nghĩa
thống kê. Điều đó, chứng tỏ CTX tái tổ hợp có tác dụng giảm đau rất tốt và
tương đương Lidocain. Điều đặc biệt đáng lưu ý ở đây là lượng thuốc CTX tiêm
cho một con chuột (3,5 µg) chỉ bằng khoảng 1/142 lần lượng thuốc tiêm
Lidocain (600 µg) mà đã đạt được tác dụng giảm đau tương đương. Các lô chuột
thí nghiệm tiếp tục được nuôi và theo dõi sau 2 tuần. Kết quả quan sát cho thấy
chuột ở tất cả các lô đều khoẻ mạnh, đi lại, sinh hoạt và ăn uống bình thường.
Như vậy liều peptide CTX sử dụng để thử nghiệm có đáp ứng tốt và không gây
độc cho chuột thí nghiệm.
4. THẢO LUẬN
Như vậy, trong nghiên này, gen mã hóa cho CTX được thiết kế từ 2 cặp mồi bổ
sung với nhau sau đó được dòng hóa vào vector tác dòng pBT, giảm bớt một bước thí
nghiệm phức tạp và tốn kém so với cách tiếp cận đi từ tách chiết mRNA đến tổng hợp
cDNA. Việc lựa chọn biểu hiện ctx trong hệ vector pET 32c+ với nhiều ưu việt như
trình tự His.Tag giúp dễ dàng tinh sạch được protein dung hợp Trx-CTX; Thioredoxin
giúp cho việc tạo cầu disulfide của protein tái tổ hợp do vậy không cần phải biểu hiện
protein ở các sinh vật bậc cao. Vị trí cắt của enterokinase được thiết kế trước trình tự
gen ctx giúp chúng tôi loại bỏ được trình tự protein mang. Các kết quả trên đã cho thấy
được Trx-CTX được biểu hiện tốt, ổn định trong tế bào E. coli và đạt độ tinh sạch cao
nhờ sử dụng phương pháp sắc ký ái lực với Ni-NTA và sắc ký lọc gel Sephacyl S-100
với hiệu suất 60 mg/L, hiệu suất thu hồi từ dịch chiết tế bào thô đạt 12% và độ sạch là
24
96,6%. Hiệu suất tinh chế Trx-CTX của chúng tôi mặc dù thấp hơn hiệu suất khi tinh
chế conotoxin tái tổ hợp GeXIVAWT ở dạng dung hợp với PelB-HisTag của Gao và
cộng sự (2013) (Gao et al., 2013), tuy nhiên lại có thể loại bỏ được phần peptide dung
hợp. Kết quả xử lý bởi enterokinase và cột VIVASPIN500 cho thấy CTX thu nhận
được đạt độ sạch cần thiết (97,5%) sau khi loại bỏ được phần dung hợp đi kèm. Kết quả
nhận dạng bằng hệ thống khối phổ cũng đã khẳng định peptide tái tổ hợp CTX được
tạo ra có kích thước 2769 Da hoàn toàn phù hợp với tính toán lý thuyết. Nghiên cứu thử
nghiệm hoạt tính giảm đau của CTX tái tổ hợp trên chuột thực nghiệm sử dụng tác
nhân gây đau Formalin cho thấy peptide CTX tinh sạch có hoạt tính giảm đau tương
đương với Lidocain nhưng lượng sử dụng chỉ bằng 1/142. Như vậy, chúng tôi đã tạo ra
được CTX tái tổ hợp có khả năng ứng dụng trong y dược dưới dạng hoạt chất giảm đau
và có thể được sản xuất trên quy mô lớn để phục vụ các nghiên cứu tiếp theo.
KẾT LUẬN
Trên cơ sở các kết quả đã nhận được, chúng tôi rút ra 3 kết luận sau:
1. Đã tạo được dòng và xác định được trình tự gen mã hoá cho omega-conotoxin
với kích thước 75 bp tương đồng 100% với trình tự nucleotide vùng peptide
trưởng thành của conotoxin từ ốc cối Conus magus (ConcoSever, số đăng ký
N01765).
2. Đã thiết kế và biểu hiện được omega-conotoxin tái tổ hợp ở E. coli. Đã tinh sạch
được conotoxin tái tổ hợp: (i) dạng protein dung hợp với thioredoxin với hiệu
suất 60 mg/L, hiệu suất thu hồi từ dịch chiết tế bào đạt 12% và độ sạch là 96,6%;
(ii) dạng peptide từ protein dung hợp với hiệu suất thu hồi đạt 9% và độ sạch là
97,5%. Omega-conotoxin tái tổ hợp đã được xác định có khối lượng phân tử là
2,769 kDa bằng phương pháp khối phổ.
3. Trên mô hình gây đau thực nghiệm bằng Formalin ở chuột nhắt trắng, omega-
conotoxin tái tổ hợp đã được xác định có hoạt tính giảm đau tương đương với
Lidocain nhưng với liều lượng nhỏ hơn 142 lần.
KIẾN NGHỊ
Hoàn thiện qui trình tạo omega-conotoxin tái tổ hợp và nghiên cứu khả năng
ứng dụng trong điều trị giảm đau
DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN
1. Lê Thị Bích Thảo, Bùi Thị Huyền, Đoàn Việt Bình, Nguyễn Thị Kim Dung,
Nguyễn Thị Minh Phương, Đỗ Hữu Chí, Bùi Quang Nghị, Nguyễn Bích Nhi, Phan
Văn Chi (2015) Nghiên cứu conotoxin từ nọc ốc cối biển (giống Conus) ứng dụng
trong y dược. Hội nghi Khoa học 2015. Trường Đại học Khoa học và Công nghệ
(USTH), Hà Nội, 07 tháng 10 năm 2015, 46-47.
2. Bùi Thị Huyền, Phạm Đức Đan, Đỗ Hữu Chí, Lê Thị Bích Thảo, Nguyễn Bích Nhi,
Phan Văn Chi (2013) Nghiên cứu tạo dòng và biểu hiện µO- conotoxin MrVIB. Báo
cáo khoa học. Hội nghị Khoa học Công nghệ sinh học toàn quốc 2013. Trung tâm
hội nghị Quốc gia, Hà Nội, 27 tháng 9 năm 2013, 341-345.
3. Bùi Thị Huyền, Đoàn Việt Bình, Nguyễn Thị Kim Dung, Lê Thị Bích Thảo,
Nguyễn Bích Nhi, Phan Văn Chi (2012) Nghiên cứu tác dụng bảo vệ tế bào thần
kinh của ω- conotoxin MVIIA tái tổ hợp ở dạng protein dung hợp với thioredoxin.
Tạp chí sinh học 34(4): 515-520.
4. Đoàn Việt Bình, Bùi Thị Huyền, Nguyễn Thị Kim Dung, Lê Thị Bích Thảo,
Nguyễn Bích Nhi, Phan Văn Chi (2012) Nghiên cứu độc tính cấp và tác dụng giảm
đau của ω-conotoxin MVIIA ở dạng protein dung hợp với thioredoxin. Tạp chí sinh
học 34(2): 241-245.
5. Le Thi Bich Thao, Bui Thi Huyen, Bui Quang Nghi, Doan Viet Binh, Nguyen Bich
Nhi and Phan Van Chi (2011) Study on the conopeptides from Cone snails collected
from Nha Trang. Proceedings of the Workshop Coastal Marinr Biodiversity and
Bioresources of Vietnam and Adjacent areas to the South China Sea, Nha Trang,
Vietnam, November 24-25, 2011, pp.114-118.
6. Bùi Thị Huyền, Lê Thị Bích Thảo, Nguyễn Bích Nhi, Phan Văn Chi (2010) Biểu
hiện và tinh chế ω-conotoxin MVIIA ở E. coli. Tạp chí sinh học 32 (2): 89-93.
7. Bùi Thị Huyền, Nguyễn Bích Nhi, Phan Văn Chi (2008). Tạo dòng và xác định trình
tự gen mã hóa ω-conotoxin MVIIA (CTX- MVIIA). Tạp chí Công nghệ Sinh học
6(4A): 663-669.
8. Tran The Thanh, Bui Thi Huyen, Tran Minh Nguyet, Le Thi Bich Thao, Pham Dinh
Minh, Chau-Chung Han, Nguyen Thi Ty, Nguyen Bich Nhi, Bui Quang Nghi, Phan
Van Chi (2008) Identification of conotoxins in the venom of C.litteratus collected
from Nhatrang seacoat. 8th IST Asia-Pacific Meeting on Animal, Plant & Microbial
Toxins, Hanoi & Halong bay –Vietnam, 2nd to 6th December 2008; p 156.
Các file đính kèm theo tài liệu này:
- tom_tat_luan_an_nghien_cuu_bieu_hien_va_xac_dinh_dac_tinh_cu.pdf