Cơ chế của phản ứng Bingel - Hirsch giữa ion âm dimethyl
bromomalonate và fullerene được nghiên cứu chi tiết bằng phương pháp
bán thực nghiệm PM6 kết hợp với phương pháp DFT. Kết quả cho thấy
rằng con đường phản ứng đi qua trạng thái chuyển tiếp TS(6,6)-1 để hình
thành sản phẩm (6,6)-C60C(COOCH3)2 là chiếm ưu thế nhất theo quan
điểm của nhiệt động học. Ngoài ra, giản đồ năng lượng của phản ứng
đóng vòng xảy ra ở liên kết (6,6) giữa các dẫn xuất malonate có nguồn
gốc từ chalcone, flavone và flavanone với fullerene cũng được thiết lập.
Kết quả nghiên cứu lý thuyết về quá trình hình thành sản phẩm fullereneflavonoid ở liên kết (6,6) là phù hợp với kết quả thực nghiệm.
28 trang |
Chia sẻ: tueminh09 | Ngày: 26/01/2022 | Lượt xem: 612 | Lượt tải: 0
Bạn đang xem trước 20 trang tài liệu Tóm tắt Luận án Nghiên cứu cấu trúc, khả năng chống oxy hóa của một số polyphenol và dẫn xuất trên nền fullerene (c60) bằng phương pháp hóa tính toán, để xem tài liệu hoàn chỉnh bạn click vào nút DOWNLOAD ở trên
O
A C
B
2'
3'
4'
5'
6'2
3
4
5
6
7
8
O
Naringenin: 5,7,4' - OH
1
1'
1
Hình 3.4. Các hợp chất flavonoid
dùng để khảo sát mô hình ONIOM
6
thuộc lớp cao và có không có nguyên tử nào trong lớp thấp. Trong
trường hợp này, phương pháp B3LYP/6-311++G(2df,2p)// PM6 được
áp dụng cho tất cả các dạng phân tử trung hòa và dạng gốc tự do.
Độ lệch tuyệt đối của giá trị BDE(O−H) khi sử dụng mô hình 1A
so với dữ liệu tính ở mức lý thuyết B3LYP/6-311++G(2df,2p)//PM6
là khoảng 1,0 kcal/mol (số liệu trong ngoặc đơn của Bảng 3.4).
Bảng 3.4. BDE(O−H) của các hợp chất flavonoid trong Hình 3.4 (kcal/mol)
Hợp chất
Vị trí
O−H
Giá trị BDE(O−H) tính bằng phương pháp
ONIOM(ROB3LYP/6-311++G(2df,2p):PM6)
BDE(O−H)
Mô
hình
Pha khí
Mô
hình
Pha khí
2’-hydroxyl
chacone
2’−OH 1A 85,6(+0,2) 5B 81,8(−3,6)
85,4a; 83,1 [130]
3A 81,4(−4,0) 5C 77,1(−8,3)
3B 82,7(−2,7) 5D 78,2(−7,2)
5A 81,0(−4,4) 7A 86,6(+1,2)
3’-hydroxyl
chacone
3’−OH 1A 87,9(−0,9) 5B 83,5(−5,3)
88,8a; 86,2 [130]
3A 85,0(−3,8) 5C 80,5(−8,3)
3B 83,8(−5,0) 5D 83,0 (−5,8)
5A 84,3(−4,5) 7A 88,9(+0,1)
4’-hydroxyl
chacone
4’−OH 1A 85,9(−1,0) 5B 81,7(−3,2)
84,9a; 81,9 [130];
83,9 [52]; 81,1 [132]
3A 83,2(−1,7) 5C 78,7(−6,2)
3B 81,9(−3,0) 5D 77,5(−7,4)
5A 82,4(−2,5) 7A 87,2(+2,3)
Apigenin 4’−OH 1A 89,4(+2,2) 5B 85,1(−2,1)
87,2a; 88,8 [65];
82,2 [62, 120] ;
84,37 [104]
3A 86,6(−0,6) 5C 82,0(−5,2)
3B 85,4(−1,8) 5D 80,77(−6,3)
5A 85,9(−1,3) 7A 90,4(−3,2)
Kaempferol 4’−OH 1A 85,0(+1,3) 5B 81,6(−2,1)
83,7a; 86,5 [65];
80,94 [60]; 80,78 [120]
3A 81,2(−2,5) 5C 76,7(−7,0)
3B 82,3(−1,4) 5D 77,9(−5,8)
5A 80,9(−2,8) 7A 86,4(+2,7)
Quercetin 3’−OH 1A 80,5(+0,4) 5B 75,5(−4,6) 80,1a ; 81,8 [65];
75,53 [120]; 73,61
[117]; 81,50 [80];
74,81 [61]; 72,42 [27];
80,3 [34]
3A 75,7(−4,4) 5C 70,3 (−9,8)
3B 78,6(−1,5) 5D 74,6 (−5,5)
5A 73,1(−7,0) 7A 79,4 (−0,7)
Quercetin 4’−OH 1A 78,4(+0,9) 5B 70,8(−6,7) 77,5a; 78,7 [65];
72,90 [120]; 70,98
[117]; 76,72 [80];
72,18 [61]; 70,03 [27];
77,6 [34]
3A 75,0(−2,5) 5C 70,5(−7,0)
3B 73,4(−4,1) 5D 73,4 (−4,1)
5A 72,1(−5,4) 7A 77,2(−0,3)
Naringenin 4’−OH 1A 89,0(+1,1) 5B 85,6(2,3)
87,9a; 92,73 [44]
3A 85,2(2,7) 5C 80,7(7,2)
3B 86,1(1,8) 5D 81,8(6,1)
5A 84,8(3,1) 7A 90,1(+2,2)
a Giá trị BDE tính ở mức lý thuyết B3LYP/6-311++G(2df,2p)//PM6.
Ghi chú: Các giá trị trong dấu ngoặc là sự khác nhau giữa giá trị BDE(OH) tính bằng phương pháp
ONIOM và phương pháp B3LYP/6-311++G(2df,2p)//PM6.
3.1.4. Nhận xét
Qua kết quả tính toán ở trên, chúng tôi có thể kết luận rằng sử dụng
phương pháp ONIOM với mô hình 1A là sự lựa chọn tốt nhất cho tính
7
BDE(O−H) của các dẫn xuất phenol và các hợp chất flavonoid có độ
chính xác cao, thời gian tính toán nhanh và tiết kiệm được tài nguyên
máy tính. Do đó, chúng tôi sẽ sử dụng phương pháp này để tính
BDE(O−H) của các hợp chất polyphenol có nguồn gốc từ cây sa kê, vỏ
măng cụt và hợp chất flavonoid trong các phần nghiên cứu tiếp theo.
3.2. KHẢO SÁT PHƯƠNG PHÁP TÍNH NĂNG LƯỢNG ION HÓA
3.2.1. Giới thiệu
3.2.2. Đánh giá tính chính xác của phương pháp tính IE ở mức lý
thuyết PM6
Các giá trị IE tính toán trong Bảng 3.5 chỉ ra rằng phương pháp
PM6 có thể dự đoán tốt giá trị IE adiabatic với độ lệch trung bình 0,091
eV so với giá trị thực nghiệm (trừ trường hợp của BHT và 2,4,6-
trimethyl phenol thì không có sẵn giá trị IE adiabatic thực nghiệm).
Bảng 3.5. Giá trị năng lượng ion hóa (eV) tính bằng phương pháp PM6 của
các dẫn xuất phenol và giá trị thực nghiệm
Đối với giá trị IE
vertical, tuy có vài
hợp chất không có sẵn
giá trị thực nghiệm,
nhưng kết quả Bảng
3.5 cho thấy độ lệch
giữa giá trị tính toán
và thực nghiệm lớn
nhất chỉ bằng 0,19 eV.
Điều này cho thấy giá
trị IE tính ở mức lý
thuyết PM6 cho kết
quả gần với giá trị
thực nghiệm.
3.2.3. Nhận xét
Từ kết quả Bảng 3.5 chúng tôi có thể kết luận rằng phương pháp
PM6 là phương pháp thích hợp để tính năng lượng ion hóa. Ưu điểm
của phương pháp này là thời gian tính toán nhanh, phù hợp cho nghiên
cứu các hợp chất có số lượng nguyên tử rất lớn như các dẫn xuất của
fullerene đồng thời vẫn đảm bảo độ chính xác cao. Vì vậy, chúng tôi
áp dụng phương pháp PM6 cho nghiên cứu năng lượng ion hóa của
các hợp chất phenolic ở các phần tiếp theo.
Hợp chất
IE
IEb
PM6 Thực nghiệma
Phenol 8,38(8,61) 8,490,02(8,70) 0,11(0,09)
1,4-Benzenediol 8,00(8,28) 7,940,01(8,44) -0,06(0,16)
1,3-Benzenediol 8,29(8,56) 8,20 (8,63) -0,09(0,07)
1,2-Benzenediol 8,10(8,44) 8,15(8,56) 0,05(0,12)
BHT 7,39(7,74) N/A(7,80) N/A(0,06)
2-Methyl phenol 8,17(8,46) 8,14(8,460,06) -0,03(0,00)
2-Nitro phenol 9,02(9,43) 9,1(9,29) 0,08(-0,14)
2,4-Dimethyl phenol 7,84(8,17) 8,0(8,18) 0,16(0,01)
2,4,6-Trimethyl phenol 7,64(7,98) N/A(8,0) N/A(0,02)
2,6-Diclo phenol 8,60(8,84) 8,650,02(N/A) 0,06(N/A)
2,6-Dimethyl phenol 7,95(8,25) 8,050.02(8,26) 0,1(0,01)
3 Methyl phenol 8,26(8,57) 8,290,02(N/A) 0,03(N/A)
3,4-Dimethyl phenol 7,93(8,24) 8,09(N/A) 0,16(N/A)
4-Nitro phenol 9,26(9,57) 9,1(9,38) -0,16(-0,19)
Ghi chú: Giá trị trong dấu ngoặc là giá trị IE vertical.
a Giá trị thực nghiệm được tham khảo từ NIST Chemistry web book, số
69,
b IE = IEthực nghiệm – IEPM6.
8
3.3. KHẢ NĂNG CHỐNG OXY HÓA CỦA CÁC HỢP CHẤT
POLYPHENOL CÓ NGUỒN GỐC TỪ CÂY SA KÊ
(ARTOCARPUS ALTILIS)
3.3.1. Lựa chọn một số hợp chất polyphenol có chứa trong cây sa kê
Cấu trúc của 12 hợp chất có nguồn gốc từ cây sa kê được trình bày
ở Hình 3.6.
3.3.2.Cơ chế chuyển nguyên tử
hydro (HAT) - Năng lượng phân
ly liên kết (BDE)
3.3.2.1. Xác định vị trí liên kết
O-H dễ phân ly
Trong hợp chất S12 thì OH ở
vị trí số 2 có giá trị BDE(O−H)
thấp nhất là 65,0 kcal/mol. Giá trị
BDE(O−H) ở vị trí số 3 của vòng
B trong hợp chất S3 và S9 có giá
trị thấp nhất lần lượt là 68,9
kcal/mol và 68,4 kcal/mol. Còn
đối với các hợp chất S1, S2, S4, S5,
S6, S7 và S8 thì giá trị BDE(O−H)
ở vị trí số 4 thấp hơn các vị trí còn lại, giá trị BDE lần luợt theo thứ tự
là: 70,7; 71,2; 71,8; 70,6; 67,7; 66,7 và 70,4 kcal/mol. Tương tự đối
với hợp chất S10 và S11, giá trị BDE(O−H) thấp nhất ở vị trí số 8 lần
lượt là 66,8 và 69,2 kcal/mol.
3.3.2.2.BDE(O-H) của 12 hợp chất polyphenol có nguồn gốc từ cây
sa kê và ảnh hưởng của dung môi
Dựa vào kết quả BDE(O−H) trong Bảng 3.7 cho thấy khả năng
cho nguyên tử hydro của các hợp chất polyphenol theo thứ tự sau: S12
> S9 ≈ S7 > S10 ≈ S6 > S3 > S11 > S1 > S8 > S5 > S2 > S4. Hơn nữa,
trong số các nhóm hydroxyl polyphenol ở các vị trí khác nhau thì nhóm
hydroxyl ở vị trí số 2 trong hợp chất S12 có giá trị BDE thấp nhất với
giá trị lần lượt là 77,3; 79,0 và 78,3 kcal/mol tương ứng với pha khí,
dung môi methanol và nước.
Bảng 3.7 cho thấy rằng các giá trị BDE của mỗi nhóm O−H của
tất cả các hợp chất polyphenol nhỏ hơn giá trị BDE(O−H) của phenol
khi được tính cùng mức lý thuyết. Điều này chứng tỏ hầu hết các hợp
chất polyphenol có khả năng cho nguyên tử hydro mạnh hơn so với
Hình 3.6. Cấu trúc của 12 hợp chất
nghiên cứu có nguồn gốc từ cây sa kê
OH
HO
O
OH
OH
OH
HO
O
OH
OH
OH
HO
O
OH
OH
O
OH
OH
OH
OHO
HO
OH
OHO
HO
O
OOH
HO
OH
A
B
C
1'
2'
4' 1
3
4
1''
S1
A 1'
2'
4'
B
1
3
4
S3
O
OOH
HO
OH
A
B
C
1'
2'
4' 1
3
4
3''
S2
H
H
O
OOH
HO
OH
A
B
C
1'
2'
4' 1
3
4
1''
3''
S4
HO
2'' O
OOH
HO
OH
A
B
C
1'
2'
4' 1
3
4
1''
3''
S5O
A
B
1'
2'
4' 1
3
4
S6
O
OOH
HO
OH
A
B
C
1'
2'
4' 1
3
4
1''
3''
S8
A
B
1'
2'
4' 1
3
4
HO
5''
6''
7''
A
BA'
B'
S7 S9
4
1'
1'
2'
2'
4'
4'
1
1
3
3
4
O
O
HO
O
OCH3
OH
O
O
HO
O
OH
OHO
O
OH
OH
A
B
A
B
1
2
3
4
5
6
8
1
2
3
4
5
6
1
2
3
4
5
6
81
2
3
4
5
6
1
2
4
1
2
3
4
5
6
A
B 3
S10 S11
S12
9
phenol. Kết quả ở Bảng 3.7 cũng cho thấy BDE(O−H) ở vị trí số 2 của
hợp chất S12 (77,3 kcal/mol trong pha khí) tương tự với giá trị
BDE(O−H) của ubiquinol-10 (78,5 kcal/mol).
Bảng 3.7. BDE(O–H) của 12 hợp chất polyphenol có nguồn gốc từ cây sa kê
tính bằng phương pháp ONIOM(ROB3LYP/6-311++G(2df,2p):PM6)
3.3.3. Cơ chế chuyển electron
chuyển proton (SET-PT)
3.3.3.1. Năng lượng ion hóa (IE)
Giá trị IE vertical và IE adiabatic
của 12 hợp chất polyphenol có nguồn
gốc từ cây sa kê được trình bày ở
Bảng 3.8. Trong đó, hợp chất S10 có
giá trị IE nhỏ nhất, điều này chứng tỏ
hợp chất S10 dễ cho electron hơn các
hợp chất khác. Vì vậy, hợp chất S10
được xem là chất chống oxy hóa tiềm
năng theo cơ chế chuyển electron.
Bảng 3.8. Giá trị năng lượng ion hóa (eV) tính bằng phương pháp PM6 của
12 hợp chất nghiên cứu
3.3.3.2. Năng lượng phân ly proton (PDE)
Các giá trị năng lượng phân ly proton của
các ion dương gốc tự do hình thành trong bước
thứ 2 của cơ chế SET−PT được tổng hợp trong
Bảng 3.9. Mỗi ion dương gốc tự do có thể có
nhiều vị trí tách proton. Dữ liệu trong Bảng 3.9
cho thấy các giá trị PDE trong pha khí tăng theo
thứ thự sau: S6 < S12 < S7 < S8 < S5 < S3 < S11
< S1 < S9 < S4 < S2 < S10.
Tuy nhiên, trong cơ chế SET−PT vị trí có
khả năng chống oxy hóa mạnh được xác định dựa vào tổng enthalpy
tối thiểu liên quan đến cơ chế dập tắt gốc tự do cụ thể. Tổng năng lượng
này gồm IE adiabatic (ở Bảng 3.8) cộng với PDE (ở Bảng 3.9), kết quả
được trình bày trong Bảng 3.9. Kết quả thu được cho thấy tổng năng
lượng tối thiểu của cơ chế HAT và SET−PT liên quan đến nhóm O-H
của 12 hợp chất nghiên cứu là như nhau và khả năng dập tắt gốc tự do
xảy ra ở cùng một vị trí. Thứ tự tổng năng lượng tối thiểu trong pha
khí gồm năng lượng ion hóa và năng lượng phân ly proton là: S12 <
Hợp
chất
Vị trí O−H
BDE(O–H)
(kcal/mol)
Pha
khí
Metha
nol
Nước
S1 4−OH (vòng B) 83,2 83,5 82,8
S2 4−OH (vòng B) 84,5 83,2 83,1
S3 3−OH (vòng B) 80,8 82,4 82,2
S4 4−OH (vòng B) 85,1 83,7 83,1
S5 4−OH (vòng B) 83,9 83,8 83,1
S6 4−OH (vòng B) 80,3 83,9 83,1
S7 4−OH (vòng B) 79,3 82,9 82,1
S8 4−OH (vòng B) 83,7 82,8 81,4
S9 3−OH (vòng B) 79,3 81,3 80,5
S10 8−OH (vòng B) 80,3 82,7 81,6
S11 8−OH (vòng B) 82,5 83,9 83,2
S12 2−OH (vòng B) 77,3 79,0 78,3
Hợp
chất
IE
adiabatic
IE
vertical
S1 7,30 7,87
S2 7,36 7,77
S3 7,45 8,03
S4 7,41 8,06
S5 7,50 7,98
S6 7,87 8,20
S7 7,44 7,80
S8 7,57 7,98
S9 7,28 7,83
S10 7,04 7,56
S11 7,42 7,85
S12 7,66 8,08
10
S10 ≈ S7 < S6 < S9 < S3 < S11 < S1 < S8 < S5 < S2 < S4.
Vì vậy, có thể rút ra kết luận rằng sự hình thành gốc tự do phenoxy
từ ion dương gốc tự do polyphenol và phân tử polyphenol trung hòa là
tương đương và xảy ra ở cùng vị trí. Điều đó cho thấy cơ chế HAT có
ảnh hưởng rất lớn lên quá trình dập tắt sự oxy hóa. Do đó, BDE là một
thông số quan trọng để đánh giá khả năng chống oxy hóa.
Bảng 3.9. Năng lượng phản ứng của 12 hợp chất có nguồn gốc từ cây sa kê
tính bằng phương pháp PM6 (kcal/mol)
3.3.4. Nhận xét
Trong phần nghiên cứu
này, chúng tôi đã sử dụng
phương pháp ONIOM
(ROB3LYP /6-311++G
(2df,2p):PM6) với mô hình
1A để xác định BDE(O−H)
của các hợp chất
polyphenol có nguồn gốc
từ cây sa kê. Trong đó,
BDE(O−H) của các hợp
chất S3, S6, S7, S9, S10 và
S12 lần lượt là: 80,8; 80,3;
79,3; 79,3; 80,3 và 77,3
kcal/mol, chúng được xem
như là những chất chống
oxy hóa tiềm năng. Năng
lượng ion hóa adiabatic của
các hợp chất polyphenol
được xác định bằng
phương pháp PM6. Sự hình
thành gốc tự do phenoxy từ
ion dương gốc tự do
phenolic và phân tử trung
hòa tương ứng ưu tiên xảy
ra ở cùng một vị trí. Dựa
trên kết quả thu được có thể
kết luận rằng giá trị BDE
được xem như là một thông
Hợp
chất
Vị trí
O−Ha
BDE IEb PDE
IE +
PDE
S1
2’ (vòng A) 83,8 168,8 190,9 359,7
4’ (vòng A) 82,7 172,0 340,8
4 (vòng B) 70,7 159,3 328,1
S2
2’ (vòng A) 83,4 169,7 171,8 341,5
4’ (vòng A) 82,8 171,2 340,9
4 (vòng B) 71,2 159,7 329,4
S3
2’ (vòng A) 83,8 171,1 170,7 341,8
4’ (vòng A) 82,8 158,5 329,6
3 (vòng B) 68,9 156,0 327,1
4 (vòng B) 83,8 169,7 340,8
S4
2’ (vòng A) 101,9 170,9 189,1 360,0
4’ (vòng A) 83,1 170,2 341,1
4 (vòng B) 71,8 158,9 329,8
2’’ (vòng C) 100,2 187,3 358,2
S5
2’ (vòng A) 84,3 173,0 169,5 342,5
4’ (vòng A) 82,3 167,4 340,4
4 (vòng B) 70,6 155,9 328,9
S6
4’ (vòng A) 80,2 181,5 156,7 338,2
3 (vòng B) 71,9 148,4 329,9
4 (vòng B) 67,7 144,2 325,7
S7
2’ (vòng A) 85,1 171,3 171,8 343,1
4’ (vòng A) 81,6 168,3 339,6
3 (vòng B) 70,9 157,8 329,1
4 (vòng B) 66,7 153,6 324,9
2’(vòng A’) 81,2 167,9 339,2
4’ (vòng A’) 81,9 168,7 340,0
3 (vòng B’) 68,9 155,8 327,1
4 (vòng B’) 71,8 158,7 330,0
S8
2’ (vòng A) 83,2 174,6 166,6 341,2
4’ (vòng A) 82,6 166,1 340,7
4 (vòng B) 70,4 153,9 328,5
7’’ 100,6 184,1 358,7
S9
2’ (vòng A) 83,8 167,9 174,0 341,9
4’ (vòng A) 82,7 172,8 340,7
3 (vòng B) 68,4 158,7 326,6
4 (vòng B) 70,5 160,7 328,6
6’’ 99,9 190,2 358,1
S10
6’ (vòngA) 79,3 162,3 174,9 337,2
8 (vòng B) 66,8 162,6 324,9
S11
6’ (vòngA) 79,9 171,1 167,0 338,1
8 (vòng B) 69,2 156,3 327,4
11
số hóa lý chính trong việc
xác định khả năng dập tắt
gốc tự do của các hợp chất
polyphenol.
3.4. KHẢ NĂNG CHỐNG OXY HÓA CỦA CÁC HỢP CHẤT
POLYPHENOL CÓ NGUỒN GỐC TỪ VỎ MĂNG CỤT
(GARCINIA MANGOSTANA)
3.4.1. Các hợp chất polyphenol có chứa trong vỏ măng cụt
Các hợp chất xanthone từ M1 đến
M14 có nguồn gốc từ vỏ măng cụt chỉ
ra trong Hình 3.7
3.4.2. Cơ chế chuyển nguyên tử
hydro (HAT) - Năng lượng phân ly
liên kết (BDE)
Dựa vào các giá trị BDE trình bày
ở Bảng 3.11, chúng ta nhận thấy khả
năng cho nguyên tử hydro của các
hợp chất xanthone trong pha khí được
sắp xếp theo trật tự sau: M11 > M10
> M7 > M1 > M9 ≈ Norathyriol >
M8 > M13 > M6 >M14 > M2 > M3 > M4 > M12 > M5. Trong tất cả
các hợp chất nghiên cứu thì BDE thấp nhất được tìm thấy ở nhóm OH
của vòng A (trừ hợp chất M5 và Norathyriol). Kinghorn và cộng sự đã
nghiên cứu thực nghiệm về khả năng dập tắt gốc tự do của 13 hợp chất
(M1 và M3 − M14) dựa vào giá trị IC50 của ONOO−, kết quả được trình
bày trong Bảng 3.11. Năm trong số 13 hợp chất xanthone là M1, M8,
M10, M11 và M13 được chứng minh là chất có tiềm năng chống oxy
hóa trong cả 2 phương pháp thử nghiệm. Đáng chú ý nhất là hợp chất
M10 và M11, chúng có giá trị BDE(O−H) ở vị trí số 6 thấp hơn so với
các vị trí khác, với giá trị lần lượt là 82,3 và 82,8 kcal/mol. Điều này chỉ
ra rằng sự chuyển nguyên tử hydro từ 6−OH của hợp chất M10 và M11
cho gốc tự do là dễ dàng hơn so với nhóm OH của các hợp chất khác.
Vì vậy, nhóm OH ở vị trí số 6 của hợp chất M10 và M11 đóng vai trò
quan trọng trong cơ chế chống oxy hóa HAT và điều này cũng được
khẳng định bởi nghiên cứu thực nghiệm trước đó.
Quan sát các kết quả trong Bảng 3.11 cho thấy sự ảnh hưởng của
dung môi nước lên giá trị BDE là rất ít. Độ lệch lớn nhất giữa giá trị
S12
6’ (vòngA) 79,9 177,3 160,5 337,8
2 (vòng B) 65,0 145,7 323,0
3 (vòng B) 71,2 151,8 329,1
a Cách đánh số được mô tả ở Hình 3.6
b Giá trị IE adiabatic.
Hình 3.7. Cấu trúc của các hợp
chất có nguồn gốc từ vỏ măng cụt
và hợp chất liên quan
O OCH3
OH
O
OH
OH
O OH
OHO
O OR
OHO
OH
O
H3C CH2
H3CO
HO
M3 R = CH3
M4 R = H
O
OH
O
H3CO O
O
O OH
OH
O
H3CO
HO
OH
O OH
OH
O
HO
HO
O OH
OHO
OH O OH
O
H3CO
HO O OH
OH
O
RO
HO
OH
O
M10 R = CH3
M11 R = H
O OH
OH
O
OH
R
O OH
OH
O
HO
O
M12 R = H
M13 R = OH
A C B
A C B
A C B
A C B A C B
A C B
A C BA C B
A C B
A C B
A C B
8 1
3
45
1
3
6
7
1
3
5
1 1
36
3"
1" 7
6
1
3
1
36
7
36
3
18
5
1
3
5
8
7
6
1
3
O OH
OH
OOH
Norathyriol
A C B 3
8
5
HO
1
2
6
M1 M2
M7
M6M5
M8 M9
M14
12
BDE trong pha khí và dung môi nước là 5,9 kcal/mol. Trật tự của giá
trị BDE trong dung môi nước khác so với trong pha khí: M1 < M8 <
M13 < M10 < M9 < M11 < M14 < Norathyriol < M3 < M6 < M4 <
M7 < M2 < M12 < M5.
Bảng 3.11. Giá trị BDE(OH) của 14 hợp chất xanthone có nguồn gốc tử
vỏ măng cụt tính bằng phương pháp ONIOM(ROB3LYP/6-
311++G(2df,2p):PM6)
3.4.3.Cơ chế chuyển
electron chuyển
proton (SET-PT)
3.4.3.1. Năng lượng
ion hóa (IE)
Từ dữ liệu tính
được trong Bảng 3.12 ta
có thể kết luận thứ tự
của các giá trị IE trong
pha khí như sau: M14 <
M5 < M11 < M1 < M3
< M7 < M8 < M10 <
M4 < M13 < M9
<Norathyriol < M12 <
M6 < M2, còn trong
dung môi nước thì có xu
hướng hơi khác: M1 <
M8 < M14 < M13 < M11 < M7 < M5 < M3 < M4 < M9 <Norathyriol
< M12 < M2 < M6 < M10. Với sự tăng độ phân cực của dung môi thì
làm cho giá trị IE của các hợp chất nghiên cứu giảm một cách đáng kể.
Điều này chỉ ra rằng các ion dương gốc tự do mang điện tích khá nhạy
với độ phân cực của dung môi. Sự hình thành các ion dương gốc tự do
trong dung dịch nước bền hơn và chiếm ưu thế còn sự hình thành phân
tử trung hòa không được ưu tiên. Như vậy, dung môi nước làm tăng
khả năng cho electron nhưng làm giảm khả năng nhận electron của các
hợp chất nghiên cứu.
3.4.3.2. Năng lượng phân ly proton (PDE)
Năng lượng phân ly proton (PDE) tính toán được trình bày trong
Bảng 3.13. Trong hợp chất M5 thì vị trí số 1 của vòng B có giá trị PDE
thấp nhất khoảng 253,15 kcal/mol. Tương tự, đối với hợp chất
Hợp
chất
Vị trí O-H
BDE (O-H)
kcal/mol
BDEa
IC50 (µM)b
Pha
khí
Nước
Authenic
ONOO-
SIN-1-
derived
ONOO-
M1 5 (vòng A) 84,1 84,3 0,2 4,6 10,0
M2 6 (vòng A) 86,3 86,7 0,4 N/A N/A
M3 5 (vòng A) 86,4 86,1 -0,3 >30 3,2
M4 5 (vòng A) 86,6 86,3 -0,3 >30 11,9
M5 1 (vòng B) 99,1 93,2 -5,9 15,9 >30
M6 6 (vòng A) 85,7 86,2 0,5 26,4 15,1
M7 6 (vòng A) 83,8 86,4 2,6 14,1 >30
M8 5 (vòng A) 84,3 84,4 0,1 9,1 9,3
M9 6 (vòng A) 84,2 85,9 1,7 19,2 24,1
M10 6 (vòng A) 82,8 85,7 2,9 12,2 <0,49
M11 6 (vòng A) 82,3 85,9 3,6 8,0 3,1
M12 5 (vòng A) 87,2 87,4 0,2 >30 >30
M13 5 (vòng A) 85,2 85,6 0,4 2,2 9,7
M14 6 (vòng A) 86,1 85,9 -0,2 >30 >30
Norathy
riol
2 (vòng B) 84,2
86,0
(86,6c)
1,8
(2,4)
N/A
a BDE = BDEnước - BDEkhí.
b Tham khảo tài liệu [49].
c Tham khảo tài liệu [43].
13
Norathyriol thì PDE ở vị trí số 2 của vòng B có giá trị thấp nhất 212,43
kcal/mol. Giá trị PDE thấp nhất tìm thấy ở vị trí số 5 của vòng A cho
các hợp chất M1, M3, M4, M8, M12 và M13 với các giá trị lần lượt
là 225,54; 230,42; 229,26; 225,06; 226,87 và 222,38 kcal/mol. Các
giá trị PDE thu được ở vị trí số 6 của vòng A đối với các hợp chất M2,
M6, M7, M9, M10, M11 và M14 có giá trị thấp hơn các vị trí còn lại
với giá trị lần lượt là: 237,29; 228,09; 233,59; 231,89; 233,33; 227,47
và 242,45 kcal/mol. Hầu hết các hợp chất nghiên cứu (trừ hợp chất M5
và Norathyriol) có giá trị PDE thấp nhất được tìm thấy ở vị trí 5 và 6
của vòng A, điều này phù hợp với các kết quả BDE tính được. Các giá
trị PDE trong dung môi nước thấp hơn một cách đáng kể so với trong
pha khí do năng lượng solvat hóa của proton trong nước cao. Điều này
chỉ ra rằng khả năng phân ly proton trong dung môi nước được ưu tiên
hơn trong pha khí.
Bảng 3.12. Năng lượng ion hóa của 14 hợp chất xanhthone có nguồn gốc từ
vỏ măng cụt tính bằng phương pháp PM6
3.4.4. Cơ chế chuyển proton
chuyển electron (SPLET)
3.4.4.1. Ái lực proton (PA)
Dữ liệu trong Bảng 3.13
cho thấy dung môi nước ảnh
hưởng đáng kể đến các giá trị
PA vì năng lượng solvat hóa
của proton trong nước cao. Sự
khác nhau giữa năng lượng PA
trong pha khí và dung môi nước
nằm trong khoảng từ -295,75
đến -378,23 kcal/mol. Điều này
có nghĩa là quá trình tách
proton xảy ra trong dung môi
nước sẽ được ưu tiên hơn.
Trong pha khí thì các giá trị PA
cao hơn so với các giá trị BDE
và IE. Tuy nhiên, trong dung
môi nước thì giá trị PA thấp
hơn rất nhiều so với các giá trị
BDE và IE tương ứng. Như
Hợp chất
IE (kcal/mol) IEa
(kcal/mol) Pha khí Nước
M1
189,79
(172,73)
124,70
(117,72)
−
M2
209,16
(178,72)
136,32
(126,33)
−
M3
190,48
(174,80)
129,66
(121,68)
135,53
M4
193,25
(176,65)
130,59
(122,56)
134,95
M5
187,95
(168,35)
127,79
(116,70)
130,82
M6
206,86
(180,57)
136,43
(126,55)
139,05
M7
190,48
(173,42)
127,57
(120,12)
135,02
M8
191,41
(174,34)
125,08
(118,24)
130,23
M9
198,56
(177,11)
132,23
(118,48)
137,27
M10
191,64
(173,65)
136,46
(121,42)
139,26
M11
188,41
(178,95)
127,55
(120,62)
136,68
M12
203,40
(181,95)
135,54
(126,75)
138,02
M13
193,71
(178,95)
125,86
(118,97)
130,64
M14
187,26
(172,73)
125,80
(117,22)
132,64
14
vậy, các kết quả thu được cho
thấy trong dung môi nước thì
cơ chế SPLET được ưu tiên hơn
theo quan điểm nhiệt động.
Bảng 3.13. Các giá trị PA, ETE và PDE của 14 hợp chất xanhthone có nguồn
gốc từ vỏ măng cụt tính ở mức lý thuyết B3LYP/6-31+G(d,p)//PM6
Hợp chất
PA (kcal/mol)
PAa
ETE (kcal/mol)
ETEb
PDE (kcal/mol)
PDEc Pha
khí
Nước
Pha
khí
Nước Pha khí Nước
M1
5 (vòng A) 336,75 33,47 -303,28 56,49 69,74 13,25 225,54 -6,25 -231,79
8 (vòng A) 347,64 40,67 -306,97 58,45 73,12 14,67 238,39 4,33 -234,06
1 (vòng B) 340,68 35,84 -304,84 67,35 78,94 11,59 240,33 5,32 -235,01
M2
6 (vòng A) 324,08 22,28 −301,80 75,86 99,04 23,18 237,29 5,82 -231,47
1 (vòng B) 343,91 37,05 -306,86 67,14 81,43 14,29 248,4 2,97 -245,43
3 (vòng B) 328,70 27,52 -301,18 79,58 91,77 12,19 245,64 3,79 -241,85
M3
5 (vòng A) 330,96 31,02 -299,94 67,96 77,44 9,48 230,42 -3,00 -233,42
1 (vòng B) 341,68 37,61 -304,07 67,44 77,71 10,27 240,61 3,87 -236,74
M4
5 (vòng A) 336,22 30,97 -305,25 63,17 77,69 14,52 229,26 -3,65 -232,91
1 (vòng B) 345,61 36,78 -308,83 65,12 80,09 14,97 240,59 4,56 -236,03
3 (vòng B) 327,43 26,28 -301,15 77,01 98,39 21,38 234,30 12,36 -221,94
M5
1 (vòng B) 348,47 37,49 -310,98 60,60 77,59 16,99 253,15 13,00 -240,15
M6
6 (vòng A) 324,38 23,98 -300,40 74,79 87,03 12,24 228,09 -4,28 -232,37
1 (vòng B) 343,26 35,57 -307,69 67,52 82,75 15,23 239,70 3,03 -236,67
3 (vòng B) 328,37 26,96 -301,41 79,63 92,45 12,82 236,91 4,12 -232,79
3’’ 376,17 57,40 -318,77 43,47 119,12 75,65 248,56 61,22 -187,34
M7
6 (vòng A) 323,55 23,54 -300,01 71,24 84,12 12,88 233,59 -0,93 -234,52
7 (vòng A) 342,26 34,78 -307,48 54,61 71,74 17,13 235,67 -2,09 -237,76
1 (vòng B) 349,16 38,86 -310,3 62,86 79,55 16,69 250,83 9,82 -241,01
3 (vòng B) 331,96 27,85 -304,11 74,56 90,09 15,53 245,32 9,30 -236,02
M8
5 (vòng A) 338,49 33,06 -305,43 55,09 69,95 14,86 225,06 -47,38 -272,44
8 (vòng A) 347,10 40,44 -306,66 59,01 72,99 13,98 237,60 -36,97 -274,57
1 (vòng B) 341,18 34,88 -306,30 69,08 82,11 13,03 241,74 -33,41 -275,15
3 (vòng B) 327,96 29,38 -298,58 80,43 92,69 12,26 239,86 -28,33 -268,19
M9
6 (vòng A) 335,96 27,85 -308,11 63,99 83,15 19,16 231,89 -41,44 -273,33
3 (vòng B) 331,88 28,20 -303,68 70,92 88,90 17,98 234,74 -35,34 -270,08
M10
6 (vòng A) 325,98 23,61 -302,37 70,78 85,96 15,18 232,09 0,96 -231,13
1 (vòng B) 347,55 36,91 -310,64 64,57 80,64 16,07 247,44 8,94 -238,5
3 (vòng B) 330,64 26,66 -303,98 76,02 90,13 14,11 241,99 8,18 -233,81
M11 ,
6 (vòng A) 320,79 17,20 -303,59 73,75 87,93 14,18 227,47 -41,69 -269,16
7 (vòng A) 339,34 29,45 -309,89 56,54 72,78 16,24 228,82 -44,59 -273,41
Norathyriol
201,32
(192,10)
132,49
(125,00)
−
Ghi chú: Giá trị trong dấu ngoặc là giá trị IE adiabatic.
a Giá trị IE vertical tính trong dung môi nước tham
khảo tài liệu [76].
15
Hợp chất
PA (kcal/mol)
PAa
ETE (kcal/mol)
ETEb
PDE (kcal/mol)
PDEc Pha
khí
Nước
Pha
khí
Nước Pha khí Nước
3 (vòng B) 331,34 24,13 -307,21 75,46 90,23 14,77 239,74 -32,46 -272,20
1 (vòng B) 348,40 34,66 -313,74 63,62 80,06 16,44 244,96 -32,10 -277,06
M12
5 (vòng A) 337,60 29,20 -308,40 61,80 80,45 18,65 226,87 -43,88 -270,75
1 (vòng B) 344,59 35,41 -309,18 67,97 83,07 15,10 240,02 -35,04 -275,06
3 (vòng B) 327,01 25,40 -301,61 79,44 92,77 13,33 233,92 -35,35 -269,27
M13
5 (vòng A) 340,23 31,07 -309,16 53,48 72,66 19,18 222,38 -49,14 -271,52
8 (vòng A) 323,94 24,56 -299,38 82,38 93,35 10,97 235,00 -34,95 -269,95
3 (vòng B) 346,21 36,32 -309,89 60,50 76,62 16,12 235,40 -39,93 -275,33
1 (vòng B) 340,04 33,48 -306,56 76,14 93,97 17,83 244,86 -25,41 -270,27
M14
6 (vòng A) 334,33 28,83 -305,50 66,96 81,34 14,38 242,45 -30,01 -272,46
1 (vòng B) 345,98 38,17 -307,81 65,52 80,12 14,60 252,67 -21,89 -274,56
3 (vòng B) 331,87 28,00 -303,87 75,26 94,35 19,09 248,30 -17,82 -266,12
Norathyriol
2 (vòng B) 327,56 25,49 -302,07 65,08 79,88 14,80 212,43 -10,46 -222,89
3 (vòng B) 331,15 25,63 -305,52 71,99 87,08 15,09 222,93 -3,12 -226,05
6 (vòng A) 403,04 25,69 -377,35 0,75 90,85 90,10 223,59 0,71 -222,88
8 (vòng A) 413,97 35,74 -378,23 0,75 84,84 84,09 234,52 4,74 -229,78
a PA = PAnước - PAkhí.
bETE = ETEnước - ETEkhí.
cPDE = PDEnước - PDEkhí.
3.4.4.2. Năng lượng chuyển electron
Trong pha khí và dung môi nước thì các giá trị ETE luôn luôn thấp
hơn các giá trị của IE. Điều này chỉ ra rằng quá trình chuyển một
electron từ dạng ion âm thì sẽ được ưu tiên hơn so với dạng phân tử
trung hòa, điều này cũng phù hợp với các kết quả nghiên cứu khác.
Các giá trị ETE trong Bảng 3.13 cho thấy sự ảnh hưởng của dung môi
nước đã gây ra sự tăng đáng kể trong các giá trị ETE của các ion âm
phenolat, điều đó có nghĩa là dung môi nước không thuận lợi cho quá
trình chuyển electron. Độ lệch trung bình giữa các giá trị ETE trong
pha khí và dung môi nước xấp xỉ 19,07 kcal/mol.
3.4.5. Nhận xét
Khả năng chống oxy hóa của 14 hợp chất xanhthone có nguồn gốc
từ vỏ măng cụt được nghiên cứu trong cả pha khí và dung môi nước
thông qua ba cơ chế HAT, SET−PT và SPLET. Chúng tôi đã tính toán
các thông số BDE, IE, PA, ETE và PDE tương ứng với từng cơ chế
dập tắt gốc tự do. Dựa trên kết quả thu được trong pha khí và dung môi
nước có thể rút ra một vài kết luận sau:
- Trong số 3 cơ chế, xét theo quan điểm nhiệt động học thì cơ chế
HAT được ưu tiên trong pha khí còn cơ chế SPLET ưu tiên xảy ra
16
trong dung môi nước.
- Sự khác nhau đáng kể giữa các giá trị enthalpy trong pha khí và
dung môi nước đặc trưng cho những phản ứng liên quan đến phần tử
mang điện tích.
- Trong số các hợp chất xanhthone nghiên cứu thì hợp chất M10
và M11 có khả năng chống oxy hóa cao nhất.
3.5. KHẢ NĂNG DẬP TẮT GỐC TỰ DO CỦA MỘT SỐ HỢP
CHẤT POLYPHENOL
3.5.1. Giới thiệu
Trong phần này, chúng tôi tiến hành nghiên cứu một cách hệ thống
để làm sáng tỏ hơn đặc tính chống oxy hóa của một số hợp chất
polyphenol thường được sử dụng (Hình 3.8).
3.5.2. Năng lượng phân ly liên kết
và năng lượng ion hóa của một số
hợp chất polyphenol
Bảng 3.14 trình bày kết quả
BDE của một số hợp chất
polyphenol tính trong pha khí sử
dụng phương pháp ONIOM với mô
hình 1A. Dữ liệu trong Bảng 3.14
cho thấy giá trị BDE biến thiên
trong khoảng 77,3 đến 83,7
kcal/mol. Độ lệch trung bình của giá
trị BDE giữa phương pháp ONIOM
và thực nghiệm là khoảng 1,5
kcal/mol. Điều này khẳng định lại
một lần nữa về tính chính xác của phương pháp ONIOM(ROB3LYP/ 6-
311++G(2df,2p):PM6) trong tính toán BDE. Đáng chú ý nhất là hợp
chất altilisin J và quecertin có giá trị BDE(OH) thấp hơn so với các
hợp chất khác với giá trị lần lượt là 77,3 và 78,4 kcal/mol. Nguyên nhân
gây ra sự giảm BDE là do ảnh hưởng liên kết hydro nội phân tử của 2
nhóm hydroxyl ở vị trí ortho. Điều này chứng tỏ sự chuyển nguyên tử
hydro từ nhóm OH của hợp chất altilisin J và quecertin cho gốc tự do là
dễ dàng hơn so với nhóm OH của các hợp chất khác. Vì vậy, nhóm OH
ở vị trí số 2 (vòng B) của hợp chất altilisin J và OH ở vị trí số 4 (vòng
B) của hợp chất quecertin đóng vai trò quan trọng trong cơ chế chống
oxy hóa HAT.
OH
OH
OOH
OH
O
OH
O
O O
O
O O
H
HO
HO
HO
B
B
B
A
O OH
OHO
H3CO
HO
A C B
1
36
7
OHO
O
OH
OH
1
2
4
1
2
3
4
5
6
A
B 3
Altilisin J
Flavanone
Flavone
Chalcone
Mangostin
O
OOH
HO
OH
OH
Quercetin
OH
B
3 4
3 4
3 4
3
4
1
1
1
1
2
2
2
2
Hình 3.8. Một số hợp chất chống
oxy hóa polyphenol
17
Từ kết quả trong Bảng 3.14 cho thấy giá trị IE của các hợp chất
polyphenol sắp xếp theo trật tự sau: Flavanone < chalcone < altilisin J
< flavone < quecertin < -mangostin. So sánh hai dãy giá trị BDE và
IE, chúng ta thấy trật tự sắp xếp của các polyphenol không cùng xu
hướng. Sự không đồng nhất này được giải thích là do giá trị BDE bị
ảnh hưởng bởi các hiệu ứng cục bộ do nhóm thế gây ra trong khi đó
giá trị IE thì bị ảnh hưởng bởi cấu trúc của toàn phân tử. Hay nói cách
khác, đối với cơ chế chuyển electron, yếu tố quyết định đến giá trị IE
là sự không định vị và liên hợp của electron hơn là sự có mặt của các
nhóm thế trong phân tử.
Bảng 3.14. Giá trị BDE(O−H) và IE trong pha khí của một số hợp chất
polyphenol
Hợp chất Vị trí O−H
BDE(O−H) kcal/mol
∆BDEc
IEd vertical,
eV
ONIOMa
(Mô hình 1A)
Thực
nghiệmb
-Mangostin 6 (vòng A) 82,8 - - 8,31
Altilisin J 2 (vòng B) 77,3 - - 8,08
Quecertin 4 (vòng B) 78,4 77,6e 0,8 8,22
Chalcone 4 (vòng B) 82,5 81,0 1,5 8,02
Flavone 4 (vòng B) 82,6 80,6 1,0 8,19
Flavanone 4 (vòng A) 83,7 80,9 2,8 8,00
a Tính ở mức lý thuyết ONIOM(ROB3LYP/6-311++G(2df,2p):PM6).
b Tham khảo tài liệu [24].
c ∆BDE = BDE (ONIOM) - BDE (thực nghiệm).
d Tính bằng phương pháp PM6.
e Tham khảo tài liệu [34].
3.5.3. Phản ứng dập tắt gốc tự do peroxyl (CH3OO•) của một số
hợp chất polyphenol
Quan sát ở Hình 3.10 ta thấy khuynh hướng phản ứng của các
polyphenol với gốc tự do CH3OO• là khá giống nhau. Các trạng thái
trung gian Int‒1 tạo thành bền hơn so với chất tham gia phản ứng
khoảng 3,5 − 7,9 kcal/mol. Năng lượng của các trạng thái trung gian
Int‒2 có giá trị thấp hơn năng lượng của các trạng thái Int‒1 tương
ứng khoảng 8,2 − 15,1 kcal/mol. Điều này cho thấy liên kết hydro
ArOHOOCH3 trong trạng thái trung gian Int‒2 bền hơn so với liên
kết hydro ArOHOOCH3 trong trạng thái trung gian Int‒1.
Trạng thái chuyển tiếp (TS) là các điểm yên ngựa trên giản đồ
năng lượng phản ứng (Hình 3.10). Hàng rào năng lượng tương ứng với
các trạng thái chuyển tiếp TS-altilisin J, TS--mangostin, TS-
flavanone, TS-chalcone, TS-flavone và TS-quecertin có giá trị lần
18
lượt là 15,3; 20,4; 18,4; 18,6; 19,7 và 16,1 kcal/mol. Tất cả các phản
ứng giữa polyphenol và gốc tự do CH3OO• đều là phản ứng tỏa nhiệt.
Sản phẩm tạo thành (gốc tự do phenoxyl) có năng lượng tương đối
thấp hơn so với chất phản ứng khoảng 9,6 – 17,5 kcal/mol. Điều này
chứng tỏ gốc tự do phenoxyl được tạo thành bền hơn và ít có khả năng
phản ứng hơn gốc tự do CH3OO•.
Từ việc so sánh các giá trị trong Bảng 3.14 và Hình 3.10, chúng
tôi có thể kết luận rằng chất chống oxy hóa có giá trị BDE (tại liên kết
cần nghiên cứu) càng thấp thì phản ứng tách hydro sẽ có hàng rào năng
lượng càng nhỏ và tỏa nhiệt mạnh.
3.5.4. Nhận xét
Trong nghiên cứu này, khả năng
chống oxy hóa của các hợp chất
polyphenol tự nhiên đã được nghiên
cứu bằng các phương pháp hóa tính
toán thông qua hai cơ chế HAT và
SET-PT. Kết quả nghiên cứu cho
thấy cấu trúc ortho-dihyroxyl có vai
trò rất quan trọng trong cơ chế HAT,
là nguyên nhân làm tăng khả năng
chống oxy hóa của nhóm hydroxyl
trong các hợp chất polyphenol.
Ngoài ra, giản đồ năng lượng phản
ứng giữa CH3OO• và các hợp chất
polyphenol cũng được thiết lập. Các phản ứng dập tắt gốc tự do của
polyphenol đều là phản ứng tỏa nhiệt và thuận lợi về mặt nhiệt động.
Hơn nữa, chúng tôi cũng chỉ ra được mối quan hệ tuyến tính rất tốt giữa
BDE và hàng rào năng lượng.
3.6. CHỨC NĂNG HÓA FULLERENE BẰNG CÁC DẪN XUẤT
MALONATE
3.6.1. Giới thiệu
Dựa trên quá trình tổng hợp được mô tả trong nghiên cứu của Enes,
sơ đồ của quá trình tổng hợp các dẫn xuất fullerene - flavonoid được
trình bày trong Hình 3.13.
3.6.2. Cơ chế phản ứng Bingel - Hirsch
Bởi vì trong phân tử C60 có 2 loại liên kết C−C bao gồm: liên kết
(6,6) và liên kết (5,6) (Hình 3.13) nên sản phẩm tạo thành sẽ có hai đồng
Hình 3.10. Giản đồ năng lượng
phản ứng giữa một số hợp chất
polyphenol và gốc tự do
CH3OO•
19
phân tương ứng (6,6)-C60C(COOCH3)2 và (5,6)-C60C(COOCH3)2. Các
đường phản ứng cho sự hình thành các sản phẩm đồng phân của
C60C(COOCH3)2 được minh họa ở Hình 3.14. Mỗi sản phẩm đồng phân
hình thành sẽ đi qua 2 trạng thái chuyển tiếp (TS). Chẳng hạn, phản ứng
đóng vòng qua trạng thái chuyển tiếp TS(6,6)-1 hoặc TS(6,6)-2 sẽ tạo thành
sản phẩm (6,6)-C60C(COOCH3)2. Còn sản phẩm (5,6)-C60C(COOCH3)2
hình thành khi phản ứng đóng vòng qua trạng thái chuyển tiếp TS(5,6)-1
hoặc TS(5,6)-2 (Hình 3.14).
So sánh hàng rào năng lượng
của các đường phản ứng này thì sự
hình thành sản phẩm (6,6)-
C60C(COOCH3)2 qua trạng thái
chuyển tiếp TS(6,6)-1 là thuận lợi
nhất, có giá trị hàng rào năng lượng
tướng ứng là 17,6 kcal/mol. Ba con
đường phản ứng còn lại (đi qua các
trạng thái chuyển tiếp TS(6,6)-2,
TS(5,6)-1 và TS(5,6)-2) thì không ưu
tiên vì có hàng rào năng lượng cao
hơn tương ứng với các giá trị 43,2;
34,4 và 49,0 kcal/mol. Điều này gây
khó khăn cho các tiểu phân khi phản
ứng vì chúng cần cung cấp một năng
lượng tương đương để có thể xảy ra va chạm có hiệu quả để hình thành
sản phẩm. Năng lượng tương đối của trạng thái trung gian thấp hơn năng
lượng các chất phản ứng khoảng 24,0
kcal/mol. Kết quả này cho thấy trạng
thái trung gian tạo thành bền hơn so
với các phản ứng ban đầu.
Từ kết quả giản đồ năng lượng
phản ứng giữa ion âm dimethyl
bromomalonate với fullerene, chúng
tôi có thể kết luận rằng phản ứng chức
năng hóa fullerene ưu tiên xảy ra ở vị
trí liên kết (6,6) và con đường phản
ứng đi qua trạng thái chuyển tiếp
TS(6,6)-1 là thuận lợi về mặt nhiệt động.
Hình 3.13. Phản ứng Bingel -
Hirsch giữa các dẫn xuất của
malonate và fullerene
Hình 3.14. Giản đồ năng lượng
của phản ứng giữa ion âm dimethyl
bromomalonate và fullerene
[6,6]
[5
,6
]
C
C
Br
O
RO
O
OMe
Br
RO OMe
O O
C
C
O
RO
O
OMe
-Br
R = Methyl (Me) :
R = Flavone :
R = Chalcone :
OH
OH
OOH
OH
R = Flavanone :
O
H2C
OH
O
O
H2C
O
O
O
H2C
O
H
-CH3
20
3.6.3. Phản ứng đóng vòng giữa fullerene và dẫn xuất flavonoid
malonate có nguồn gốc từ chalcone, flavone và flavanone
Quan sát ở Hình 3.17 cho thấy
rằng khuynh hướng phản ứng của các
flavonoid malonate với fullerene là
khá giống nhau. Đầu tiên, tạo thành
các trạng thái trung gian Int-
chalcone, Int-flavone và Int-
flavanone có năng lượng thấp hơn so
với các chất phản ứng tương ứng là
−16,0; −12,3 và −13,7 kcal/mol. Điều
này chứng tỏ rằng trạng thái trung
gian tạo thành bền hơn so với chất
tham gian phản ứng. Hàng rào năng
lượng tương ứng với các trạng thái
chuyển tiếp TS-chalcone, TS-
flavone và TS-flavanone có giá trị lần lượt là 16,8; 11,4 và 16,3
kcal/mol. Năng lượng tương đối của các phức chất sản phẩm PC-
chalcone, PC-flavone và PC-flavanone so với chất phản ứng có giá trị
lần lượt là: −18,3; −15,8 và −14,3 kcal/mol. Các sản phẩm P-chalcone,
P-flavone và P-flavanone hình thành sau khi ion âm brom thoát ra mà
không qua trạng thái chuyển tiếp nào, có giá trị năng lượng tương đối
cao hơn so với chất phản ứng tương ứng là: 8,4; 5,3 và 7,0 kcal/mol.
Từ các kết quả nghiên cứu ở trên, chúng tôi có thể kết luận rằng
nghiên cứu lý thuyết về quá trình hình thành sản phẩm fullerene-
flavonoid ở vị trí liên kết (6,6) là phù hợp với kết quả thực nghiệm.
3.6.4. Nhận xét
Cơ chế của phản ứng Bingel - Hirsch giữa ion âm dimethyl
bromomalonate và fullerene được nghiên cứu chi tiết bằng phương pháp
bán thực nghiệm PM6 kết hợp với phương pháp DFT. Kết quả cho thấy
rằng con đường phản ứng đi qua trạng thái chuyển tiếp TS(6,6)-1 để hình
thành sản phẩm (6,6)-C60C(COOCH3)2 là chiếm ưu thế nhất theo quan
điểm của nhiệt động học. Ngoài ra, giản đồ năng lượng của phản ứng
đóng vòng xảy ra ở liên kết (6,6) giữa các dẫn xuất malonate có nguồn
gốc từ chalcone, flavone và flavanone với fullerene cũng được thiết lập.
Kết quả nghiên cứu lý thuyết về quá trình hình thành sản phẩm fullerene-
flavonoid ở liên kết (6,6) là phù hợp với kết quả thực nghiệm.
Hình 3.17. Giản đồ năng lượng
của phản ứng flavonoid
malonate với fullerene
21
3.7. KHẢ NĂNG CHỐNG OXY HÓA CỦA CÁC DẪN CHẤT
LAI HÓA FULLERENE VÀ CHALCONE, FLAVONE,
FLAVANONE
3.7.1. Giới thiệu
3.7.2. Khả năng chống oxy hóa của các dẫn chất lai hóa fullerene
và chalcone, flavone, flavanone
Bảng 3.18. Giá trị BDE(O−H) và IE của dẫn xuất C60-chalcone, C60-
flavone và C60-flavanone
Kết quả Bảng
3.18 cho thấy rằng
fullerene có ảnh
hưởng rất lớn đến
BDE(O−H) của các
hợp chất flavonoid.
Điều này có thể giải
thích là do tương tác
của phân tử fullerene
lên liên kết O−H. Giá trị BDE(O−H) của dẫn xuất C60-chalcone, C60-
flavone và C60-flavanone lần lượt là: 66,5; 70,3 và 68,5 kcal/mol. So
sánh với dữ liệu BDE của chalcone, flavone và flavanone, ta thấy BDE
của dẫn xuất fullerene giảm rất đáng kể với mức giảm trung bình
khoảng 14,5 kcal/mol.
Giá trị IE (Bảng 3.18) của các dẫn xuất fullerene -flavonoid cao
hơn các flavonoid (chalcone, flavone và flavanone) khoảng 0,87 eV.
Do đó, các dẫn xuất fullerene rất khó cho electron, hiện tượng này xảy
ra là vì phân tử fullerene có ái lực electron rất cao.
3.7.3. Nhận xét
Trong phần nghiên cứu này, các giá trị BDE(O−H) của các dẫn
xuất fullerene - flavonoid được tính bằng phương pháp ONIOM 1A
dao động trong khoảng 66,5 − 70,3 kcal/mol. Điều này cho thấy rằng
đây là những hợp chất này có khả năng chống oxy hóa mạnh theo cơ
chế HAT. Ngược lại với xu hướng của BDE, các giá trị IE của dẫn
xuất fullerene - flavonoid cao hơn so với các flavonoid. Vì vậy, trong
cơ chế chuyển electron (SET) các hợp chất fullerene - flavonoid không
được ưu tiên, khó cho electron hơn so với các hợp chất flavonoid.
Nguyên nhân của hiện tượng này có thể được giải thích là do sự ái lực
electron rất cao của phân tử fullerene.
Hợp chấta
BDE(O−H)b
- kcal/mol
IEc vertical - eV
P-chalcone 66,5 (82,5) 8,97 [8,02]d
P-flavone 70,3 (82,6,) 8,96 [8,19] d
P-flavanone (vòng A) 68,5 (83,7) 8,89 [8,00] d
a Cấu trúc các dẫn xuất C60-flavonoid được hiển thị Hình 3.18.
b Tính bằng phương pháp ONIOM((RO)B3LYP/6-
311++G(2df,2p):PM6); Dữ liệu trong dấu ngoặc đơn là giá trị
BDE của chalcone, flavone và flavanone (đơn vị kcal/mol).
c Tính bằng phương pháp PM6.
d Dữ liệu trong dấu ngoặc vuông là giá trị IE của chalcone,
flavone và flavanone.
22
3.8. THIẾT KẾ CÁC HỢP CHẤT CHỐNG OXY HÓA CÓ
NGUỒN GỐC TỪ CÂY SA KÊ VÀ MĂNG CỤT TRÊN NỀN
FULLERENE
3.8.1. Giới thiệu
Trên cơ sở các thông tin thu
được từ nghiên cứu thực nghiệm
và nghiên cứu lý thuyết về phản
ứng chức năng hóa fullerene bằng
các dẫn xuất malonate, chúng tôi
đã thiết kế chất chống oxy hóa
mới có nguồn gốc từ cây sa kê và
măng cụt trên nền fullerene (C60)
bằng phương pháp hóa tính toán.
Sơ đồ của quá trình tổng hợp được
minh họa ở Hình 3.20.
3.8.2. Chức năng hóa fullerene
với hợp chất altilisin J và
mangostin có nguồn gốc từ cây sa
kê và vỏ măng cụt
Tiếp nối các kết quả nghiên cứu
của phần trước, chúng tôi chỉ tập trung nghiên cứu phản ứng đóng vòng
xảy ra ở liên kết (6,6) giữa các dẫn xuất malonate có nguồn gốc từ
altilisin J và mangostin với fullerene. Giản đồ năng lượng của phản
ứng giữa dẫn xuất malonate với fullerene được minh họa ở Hình 3.21.
Quan sát Hình 3.21 cho
thấy khuynh hướng phản ứng
của các dẫn xuất malonate với
fullerene là khá giống nhau.
Đầu tiên, các phản ứng tạo
thành các trạng thái trung
gian Int-1a, Int-2a và Int-3a
có năng lượng thấp hơn so
với các chất phản ứng ban
đầu tương ứng là −14,0;
−10,3 và −18,0 kcal/mol.
Điều này chứng tỏ rằng trạng
thái trung gian tạo thành bền
OH3CO
O O
+C60(CBr4, DBU, rt)
OH3CO
O O
OH3CO
O O
+C60(CBr4, DBU, rt)
OH3CO
O O
+C60(CBr4, DBU, rt)
OH3CO
O O
C60-Altilisin J
OH3CO
O O
OO
OH O
OCH3
OH
C60-Mangosteen-1
OO
O
OH
OH
1
2
4
1
2
3
4
5
6
A
B 3
OO
O
OH
OH
1
2
4
1
2
3
4
5
6
A
B 3
O
OH
O
O
H3CO OH
O
OH
O
O
H3CO OH
OO
OH O
OCH3
OH
C60-Mangosteen-2(1) (2)
(3)
B
B
B
B
1
2
3
1
2
3
1
2 3
1
2 3
Hình 3.20. Phản ứng Bingel -
Hirsch giữa các dẫn xuất của
malonate và fullerene
Hình 3.21. Giản đồ năng lượng của phản ứng
giữa ion âm dimethyl bromomalonate có nguồn
gốc từ cây sa kê và măng cụt với fullerene
23
hơn so với chất tham gian phản ứng. Hàng rào năng lượng tương ứng
với các trạng thái chuyển tiếp TS-1, TS-2 và TS-3 có giá trị lần lượt là
15,1; 11,2 và 15,4 kcal/mol. Năng lượng tương đối của các phức chất
sản phẩm Int-1b, Int-2b và Int-3b so với chất phản ứng ban đầu có giá
trị lần lượt là: −13,2; −8,7 và −19,0 kcal/mol. Các sản phẩm P-1, P-2 và
P-3 được hình thành sau khi ion âm brom thoát ra mà không qua trạng
thái chuyển tiếp nào, có giá trị năng lượng tương đối cao hơn so với chất
phản ứng tương ứng là: 9,5; 8,3 và 7,3 kcal/mol.
3.8.3. Khả năng chống oxy hóa của các dẫn xuất fullerene-altilisin
J và fullerene-mangostin
Dữ liệu trong Bảng 3.20 cho thấy fullerene có ảnh hưởng rất lớn
đến BDE(OH) của mangostin và altilisin J với độ giảm trung bình
13,5 kcal/mol. Điều này có thể giải thích do tương tác của phân tử
fullerene lên liên kết OH. Giá trị BDE(OH) của các hợp chất C60-
mangostin-1, C60-mangostin-2 và C60-altilisin J lần lượt là: 69,3; 67,7
và 65,3 kcal/mol.
Từ kết quả Bảng 3.20 cho thấy giá trị IE và EA của các dẫn xuất
fullerene lớn hơn đáng kể so với mangostin và altilisin J. Do đó, các
dẫn xuất fullerene rất khó cho electron nhưng ngược lại sự nhận
electron thì dễ dàng hơn so với hợp chất ban đầu. Hiện tượng này xảy
ra là vì phân tử fullerene có ái lực electron rất cao.
Kết quả nghiên cứu trên cho thấy các dẫn xuất fullerene đã kết hợp
được cả tính chất của fullerene và hợp chất phenolic nên vừa có khả
năng chống oxy hóa theo cơ chế ngắt mạch oxy hóa vừa là “chiếc lồng
thu nhặt gốc tự do”.
Bảng 3.20. Giá trị BDE(O−H), EA và IE của mangostin, altilisin J,
C60-mangostin-1, C60-mangostin-2 và C60-altilisin J
3.8.4. Nhận xét
Các tính toán lý thuyết
đã được tiến hành để dự
đoán sự hình thành sản
phẩm chống oxy hóa tiềm
năng giữa fullerene và các
dẫn xuất malonate có nguồn
gốc từ cây sa kê và măng cụt thông qua phản ứng Bingel - Hirsch. Giản
đồ năng lượng của phản ứng đóng vòng giữa fullerene và dẫn xuất
malonate ở vị trí liên kết (6,6) cũng được thiết lập. Năng lượng phản
Hợp chất
BDE(O−H)a
kcal/mol
IEb vertical,
eV
EAb vertical,
eV
Mangostin 82,8 8,31 1,47
Altilisin J 77,3 8,08 2,14
C60-mangostin-1 69,3 8,90 3,53
C60-mangostin-2 67,7 8,91 3,56
C60-altilisin J 65,3 8,92 3,61
a Sử dụng mô hình 1A và tính ở mức
ONIOM(ROB3LYP/6-311++G(2df,2p):PM6).
b Tính bằng phương pháp PM6.
24
ứng tương đối giữa fullerene với các dẫn xuất malonat mangostin-1,
mangostin-2 và altilisin J lần lượt là: 9,5; 8,5 và 7,3 kcal/mol. Các dẫn
xuất fullerene mới được đánh giá là có khả năng chống oxy hóa cao
thông qua các thông số đặc trưng như: BDE, IE và EA. Cấu trúc phân
tử fullerene ảnh hưởng rất lớn đến khả năng chống oxy hóa của các
hợp chất fullerene-altilisin J và fullerene-mangostin: làm giảm giá trị
BDE nhưng lại tăng IE và EA.
NHỮNG KẾT LUẬN CHÍNH CỦA LUẬN ÁN
Trong luận án này, chúng tôi đã tiến hành nghiên cứu một cách hệ
thống khả năng chống oxy hóa của các hợp chất polyphenol có nguồn
gốc từ cây sa kê, măng cụt và dẫn xuất fullerene - flavonoid bằng
phương pháp hóa tính toán. Thông qua đó, chúng tôi đã thiết kế các
hợp chất chống oxy hóa có nguồn gốc từ thiên nhiên trên nền fullerene.
Qua quá trình nghiên cứu, chúng tôi rút ra một số kết luận sau:
1. Đã chứng minh được tính chính xác và độ tin cậy của phương
pháp ONIOM(ROB3LYP/6-311++G(2df,2p):PM6) thông qua 7 mô
hình khác nhau. Trong đó, phương pháp ONIOM 1A là sự lựa chọn tốt
nhất dùng để tính BDE(O−H) của các hợp chất phenolic.
2. Từ sự phân tích và so sánh giữa giá trị tính toán và giá trị thực
nghiệm, chúng tôi có thể kết luận rằng phương pháp PM6 được xem
là phương pháp thích hợp để tính năng lượng ion hóa của các hợp chất
là dẫn xuất phenol.
3. Đã nghiên cứu khả năng chống oxy hóa các hợp chất
polyphenol có nguồn gốc từ cây sa kê và măng cụt thông qua 3 cơ chế
HAT, SET-PT và SPLET. Dựa vào giá trị BDE(O−H), hợp chất S12,
M10 và M11 được xem như là một chất chống oxy hóa tiềm năng với
giá trị BDE tính trong pha khí lần lượt là 77,3; 82,3 và 82,8 kcal/mol.
4. Đã nghiên cứu khả năng dập tắt gốc tự do CH3OO• của một số
hợp chất polyphenol bằng phương pháp hóa tính toán. Hàng rào năng
lượng của phản ứng giữa gốc tự do CH3OO• và altilisin J, -
mangostin, flavanone, chalcone, flavone và quecertin có giá trị lần
lượt là 15,3; 20,4; 18,4; 18,6; 19,7 và 16,1 kcal/mol.
5. Đã làm sáng tỏ cơ chế của phản ứng Bingel - Hirsch giữa ion
âm dimethyl bromomalonate và fullerene (C60). Kết quả nghiên cứu
25
cho thấy rằng sản phẩm tạo thành ở liên kết (6,6) là ưu tiên hơn so với
liên kết (5,6), điều này cũng phù hợp với kết quả thực nghiệm [24] và
con đường phản ứng đi qua trạng thái chuyển tiếp TS(6,6)-1 là thuận lợi
về mặt nhiệt động.
6. Đã tính được giá trị BDE(O−H) của dẫn xuất C60-chalcone,
C60-flavone và C60-flavanone lần lượt là 66,5; 70,3 và 68,5 kcal/mol,
thấp hơn rất nhiều so với giá trị BDE(O−H) của các hợp chất flavonoid
với độ giảm trung bình 14,5 kcal/mol. Tuy nhiên, giá trị IE của các dẫn
xuất fullerene này thì cao hơn so với các flavonoid (chalcone, flavone
và flavanone) khoảng 0,87 eV. Vì vậy, các dẫn xuất fullerene -
flavonoid dễ cho nguyên tử hydro nhưng khó cho electron.
7. Đã thiết kế được các hợp chất chống oxy hóa mới từ fullerene
và hợp chất phenolic có nguồn gốc thiên nhiên bằng phản ứng Bingel-
Hirsch. Khả năng chống oxy hóa của các hợp chất này được khảo sát
thông qua các thông số đặc trưng là BDE, IE và EA. Kết quả nghiên cứu
trên cho thấy các dẫn xuất fullerene mới có khả năng chống oxy hóa rất
cao vì đã kết hợp được cả tính chất của fullerene và hợp chất phenolic.
NHỮNG ĐỊNH HƯỚNG NGHIÊN CỨU TIẾP THEO
Những kết quả đạt được trong luận án đã mở ra những định hướng
nghiên cứu triển vọng có thể tiếp cận trong thời gian đến để đề tài này
hoàn chỉnh. Cụ thể:
1. Tiếp tục nghiên cứu về mặt động hóa học khả năng chống oxy
hóa của các hợp chất polyphenol và dẫn xuất fullerene.
2. Tiến hành tổng hợp các dẫn xuất fullerene - polyphenol và thử
hoạt tính sinh học trong in vivo và in vitro.
3. Kết hợp phương pháp lý thuyết với thực nghiệm để đánh giá và
làm rõ hoạt tính và cơ chế chống oxy hóa của các hợp chất có nguồn
gốc thiên nhiên. Trên cơ sở đó có thể thiết kế và tổng hợp các hợp chất
mới có khả năng chống oxy hóa cao.
26
DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN
1. Nguyen Minh Thong, Thi Chinh Ngo, Duy Quang Dao, Tran Duong, Quoc
Tri Tran, Pham Cam Nam (2016), “Functionalization of fullerene via the
Bingel reaction with α-chlorocarbanions: an ONIOM approach”, Journal of
Molecular Modeling, 22, pp.113-121.
2. Nguyen Minh Thong, Duy Quang Dao, Thi Chinh Ngo, Trinh Le Huyen,
Pham Cam Nam (2016), “Antioxidant activities of [60]fullerene derivatives
from chalcone, flavone and flavanone: A ONIOM approach via H-atom and
electron transfer mechanism”, Chemical Physics Letters, 652, pp.56–61.
3. Nguyen Minh Thong, Thi Chinh Ngo, Truc Xuyen Nguyen Phan, Duy Quang
Dao, Truong Van Nam, Phan Thi Tuyet Trinh, Pham Cam Nam (2015) “A
Study of the Substituent Effects on the O−H Bond Dissociation Enthalpies of
Phenol Derivatives Using the ONIOM Method”, American Journal of
Chemistry, 5(4), pp.91-95.
4. Nguyen Minh Thong and Pham Cam Nam (2015) “Theoretical investigation
on antioxidant activity of phenolic compounds extracted from Artocarpus
altilis”, Springer International Publishing, 46, pp. 464-469.
5. Nguyen Minh Thong, Duong Tuan Quang, Ngoc Hoa Thi Bui, Duy Quang
Dao, Pham Cam Nam (2015), “Antioxidant properties of xanthones extracted
from the pericarp of Garcinia mangostana (Mangosteen): A theoretical study”,
Chemical Physics Letters, 625, pp. 30–35.
6. Nguyen Minh Thong, Tran Duong, Linh Thuy Pham, and Pham Cam Nam
(2014), “Theoretical investigation on the bond dissociation enthalpies of
phenolic compounds extracted from Artocarpus altilis using
ONIOM(ROB3LYP/6-311++G(2df,2p): PM6) method”, Chemical Physics
Letters, 613, pp. 139–145.
7. Nguyễn Minh Thông và Phạm Cẩm Nam (2016), “Nghiên cứu phản ứng chức
năng hóa fullerene (C60) với các dẫn xuất flavonoid malonate bằng phương
pháp hóa tính toán”, Tạp chí KHCN - ĐHĐN, Số 5(102), trang 100.
8. Nguyễn Minh Thông, Đào Duy Quang, Ngô Thị Chinh, Trần Dương, Phạm
Cẩm Nam (2016), “Nghiên cứu khả năng dập tắt gốc tự do (ROO•) của các hợp
chất polyphenol tự nhiên bằng phương pháp hóa tính toán”, Tạp chí Khoa học
Đại học Huế, Số 3(117).
9. Nguyễn Minh Thông, Phạm Lê Minh Thông, Đinh Tuấn (2016), “Thiết kế
các hợp chất chống oxy hóa từ một số dẫn xuất malonate của Altilisin J và
Mangostin trên nền Fullerene (C60) bằng phương pháp hóa tính toán”, Tạp chí
Khoa học và Công nghệ (Viện Hàn lâm KH & CN Việt Nam), Số 54.
Các file đính kèm theo tài liệu này:
- tom_tat_luan_an_nghien_cuu_cau_truc_kha_nang_chong_oxy_hoa_c.pdf