Nghiên cứu công nghệ sản xuất insulin tái tổ hợp
NGHIÊN CỨU CÔNG NGHỆ SẢN XUẤT INSULIN TÁI TỔ HỢP
HOÀNG VĂN QUỐC CHƯƠNG
Trang nhan đề
Lời cảm ơn
Mục lục
Một số từ viết tắt
Đặt vấn đề
Chương 1:
Tổng quan
Chương 2:
Vật liệu, phương pháp
Chương 3:
Kết quả- biện luận
Kết luận & kiến nghị
Danh mục các công trình
Tài liệu tham khảo
Phụ lục
?ĐẶT VẤN ĐỀ
“Thế kỷ 21 là thế kỷ của các bệnh Nội tiết và các Rối loạn chuyển hóa
mà điển hình là bệnh đái tháo đường (Bệnh tiểu đường)”. Nhận xét này của
nhóm chuyên gia về dự báo tình hình bệnh tật của Tổ chức Y tế thế giới đã đang
trở thành hiện thực với những con số cụ thể. Theo Tổ chức Y tế thế giới (WHO,
2008) [77], hiện nay trên toàn thế giới có khoảng 180 triệu người mắc bệnh tiểu
đường và ước tính con số này sẽ tăng gấp đôi vào năm 2030, chiếm khoảng 5%
dân số thế giới. Đáng lo ngại hơn là các biến chứng của bệnh, cứ 10 giây có một
người tử vong do nguyên nhân đái tháo đường, cứ 30 giây lại có một người đái
tháo đường bị cắt cụt chi và cứ mỗi ngày có 5000 người mất khả năng nhìn do
biến chứng mắt của bệnh. Mỗi năm có hơn 3,2 triệu người chết vì các bệnh liên
quan tới đái tháo đường tương đương với số người tử vong vì bệnh HIV/AIDS [1].
Bệnh tiểu đường (BTĐ) đang trở thành gánh nặng cho mỗi nền kinh tế xã
hội, mặc dù mỗi năm hàng nghìn tỷ đôla Mỹ được chi phí cho điều trị bệnh,
nhưng chưa bao giờ và sẽ không bao giờ những chi phí khổng lồ về kinh tế có
thể lấp đầy được những tổn thất, nhất là những mất mát về tinh thần do bệnh tật
gây ra. Thực tế đáng lo ngại hơn là tình trạng bệnh xuất hiện ngày càng nhiều từ
lớp trẻ [1].
Ở Việt Nam, tỷ lệ người mắc BTĐ ngày càng cao và ở các thành phố lớn
tỷ lệ này đã tăng gấp đôi từ 2% lên 4% trong 10 năm giai đoạn 1990-2000. Số
người mắc BTĐ hiện nay khoảng 4,5 triệu người, chiếm 5,7% dân số, trở thành
nước có tốc độ phát triển BTĐ nhanh nhất thế giới [1].
Nguyên nhân của BTĐ là do thiếu insulin hoặc do cơ thể người bệnh
kháng insulin. Insulin là một polypeptide hormone được sinh ra nhờ các tế bào ß
của tuyến tụy động vật, có vai trò điều hoà lượng đường trong máu. Phương
Luận án Tiến sĩ Đặt vấn đề
-2-
pháp điều trị BTĐ phổ biến hiện nay là tiêm insulin định kỳ cho người bệnh. Do
số lượng người mắc BTĐ ngày càng cao nên nhu cầu sử dụng insulin càng lớn. Ở
châu Âu, lượng insulin đã tăng lên 3 lần trong vòng 12 năm từ 1995-2007. Theo
ước tính, nhu cầu insulin trên thế giới tăng từ khoảng 5.000kg trong nam 2007
lên khoảng 16.000kg vào năm 2010, với thị trường dự tính khoảng 11,8 tỷ Mỹ
kim [41].
Năm 1978, lần đầu tiên các nhà khoa học của công ty công nghệ sinh học
Genetech đã dòng hóa thành công gen mã hóa cho insulin người vào vector biểu
hiện trong E. coli và đã cho phép công ty Eli Lilly sử dụng kỹ thuật này để sản
xuất insulin người tái tổ hợp với tên thương mại là Humulin. Năm 1982, Humulin
đã được FDA (Food & Drug Administration - Cơ quan Quản lý thuốc và thực
phẩm Hoa Kỳ) cho phép lưu hành. Hiện nay có nhiều công ty dược phẩm trên
thế giới sản xuất insulin tái tổ hợp như: Eli Lilly, Novo disk, Sanofi Aventis với
nhiều loại sản phẩm insulin khác nhau. Công nghệ sản xuất insulin hiện nay
thường được tiếp cận theo hai phương pháp: phương pháp một chuỗi polypeptide
và phương pháp hai chuỗi polypeptide. Công nghệ sản xuất insulin tái tổ hợp
bằng phương pháp một chuỗi polypeptide bao gồm ba bước cơ bản. Đầu tiên là
bước tạo dòng chủng chủ (thường là E. coli) có khả năng mang gen ngoại tổng
hợp các chất tiền thân của insulin (proinsulin). Đây là khâu then chốt quyết định
sự thành công của công nghệ do cần phải biến đổi các codon thích hợp để tăng
cường hiệu quả biểu hiện. Tiếp theo là bước lên men, cảm ứng biểu hiện, thu
nhận proinsulin và xử lý để thu nhận insulin. Protein được biểu hiện dưới dạng
thể vùi nằm trong tế bào chất, do vậy cần phải biến tính để làm tan, sau đó tiến
hành tái gấp cuộn để có proinsulin có cấu hình tự nhiên. Proinsulin tái gấp cuộn
được xử lý bằng protease cắt loại đoạn nối nội phân tử (đoạn peptide C) để thu
insulin có hoạt tính. Đối với phương pháp sản xuất theo 2 mạch polypeptide,
Luận án Tiến sĩ Đặt vấn đề
-3-
trước hết phải tạo dòng các chủng chủ riêng rẽ mang các gen mã hóa cho 2
chuỗi polypeptide khác nhau (chuỗi A, chuỗi B). Sau đó tinh chế thu nhận các
chuỗi polypeptide A và B và thực hiện phản ứng tạo cầu nối disulfide để thu
nhận insulin có hoạt tính.
Ở Việt Nam, nhu cầu sử dụng insulin rất cao, tuy nhiên toàn bộ nguồn
insulin sử dụng cho bệnh nhân mắc BTĐ đều phải nhập ngoại nên vừa gây tốn
kém ngoại tệ vừa không chủ động được nguồn thuốc để đáp ứng chữa trị kịp thời
cho bệnh nhân. Để đảm bảo cho điều trị toàn bộ bệnh nhân mắc BTĐ hàng ngày
với liều dùng 0,5-1,0 U/kg trọng lượng cơ thể trong một ngày [78], thì Việt Nam
cần phải nhập ngoại khoảng từ 120-240 triệu U/ năm, tương đương 420-840 kg
insulin/ năm (100U =3,5 mg). Năm 2001, giấy phép độc quyền sản xuất insulin
tái tổ hợp chính thức hết hiệu lực, mở ra cơ hội lớn cho các nước đang phát triển
trong đó có Việt Nam, có thể tiếp cận được công nghệ hiện đại để phát triển qui
trình sản xuất insulin người tái tổ hợp trong nước, mang lại triển vọng góp phần
giải quyết khó khăn trên.
Mặc dù bản quyền sản xuất insulin bằng công nghệ DNA tái tổ hợp đã
hết hạn tuy nhiên các công ty dược phẩm vẫn tiếp tục giữ những bí quyết công
nghệ có tính thế mạnh của công ty nên rất khó tiếp cận để có được qui trình
công nghệ đầy đủ nhằm sản xuất insulin. Do vậy, cần phải nghiên cứu xây dựng
qui trình công nghệ riêng dựa trên những thông tin đã công bố và trình độ công
nghệ sẵn có để tiến đến việc sản xuất insulin trong nước đáp ứng được yêu cầu
đặt ra.
Năm 2007, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học quốc gia Thành
phố Hồ Chí Minh được giao nhiệm vụ thực hiện đề tài cấp nhà nước “Nghiên
cứu công nghệ sản xuất insulin tái tổ hợp điều trị bệnh đái tháo đường”, mã số
Luận án Tiến sĩ Đặt vấn đề
-4-
KC.04.09/06-10. Nội dung nghiên cứu của luận án là thực hiện một phần trong
nội dung của đề tài cấp nhà nước này.
Về mặt khoa học, mục tiêu của luận án nhằm bước đầu nghiên cứu qui
trình tổng hợp insulin người tái tổ hợp theo phương pháp một chuỗi polypeptide
trong E. coli bao gồm tạo dòng E. coli tái tổ hợp biểu hiện mini-proinsulin, lên
men, tái gấp cuộn mini-proinsulin và xử lý để tạo insulin có hoạt tính. Ý nghĩa
thực tiễn của đề tài là ứng dụng công nghệ gen, công nghệ lên men và công
nghệ protein để tạo ra chế phẩm insulin có hoạt tính dùng làm thuốc trị bệnh
tiểu đường.
Luận án tập trung nghiên cứu cụ thể các vấn đề sau:
- Tạo chủng E. coli tái tổ hợp có mang vector biểu hiện mini-proinsulin tái
tổ hợp của người.
- Xây dựng qui trình lên men nuôi cấy chủng E. coli tái tổ hợp biểu hiện
mini-proinsulin.
- Thiết lập qui trình thu nhận và tinh sạch mini-proinsulin từ tế bào chủng
E. coli.
- Xây dựng qui trình tái gấp cuộn mini-proinsulin và xử lý thu nhận insulin
có hoạt tính.
- Thử nghiệm hoạt tính insulin tái tổ hợp trên chuột.
10 trang |
Chia sẻ: lvcdongnoi | Lượt xem: 5367 | Lượt tải: 1
Bạn đang xem nội dung tài liệu Nghiên cứu công nghệ sản xuất insulin tái tổ hợp, để tải tài liệu về máy bạn click vào nút DOWNLOAD ở trên
-132-
Luaän aùn Tieán só Phuï luïc
PHUÏ LUÏC
5.1. PHUÏ LUÏC 1: Xaùc ñònh trình töï amino acid cuûa 6His-MPI
baèng phöông phaùp MS/MS
5.1.1. Phöông phaùp
5.1.1.1. Thuûy phaân protein trong gel baèng enzyme trypsin
Protein sau khi ñöôïc phaân taùch qua SDS-PAGE ñöôïc caét nhoû (kích thöôùc
xaáp xæ 1mm3) vaø tieán haønh thuûy phaân protein trong gel theo caùc phöông phaùp ñaõ
ñöôïc moâ taû (Cohen SL vaø Chait BT, 1997; Shevchenko A et al, 2000; Stensballe
A vaø Jensen ON, 2001). Caùc protein sau thuûy phaân ñöôïc chieát ruùt ra khoûi gel
baèng dung dòch chieát (60% acetonitrile, 1% TFA). Dòch chieát coù chöùa caùc peptide
ñöôïc laøm khoâ baèng heä maùy SPD1010 SpeedVacñ System (ThermoSavant, USA).
5.1.1.2. Phaân taùch thaønh phaàn protein baèng saéc kyù loûng moät chieàu
Hoãn hôïp peptide sau khi ñöôïc thuûy phaân ñöôïc phaân tích qua heä thoáng saéc
kyù loûng moät chieàu thoâng qua coät ngöôïc pha (reverse phase, RP-C18). Maãu ñöôïc
ñöa vaøo vôùi theå tích 20μl vaø ñöôïc ñaåy leân coät vôùi toác ñoä doøng 30μl/ phuùt baèng
0,1% formic acid. Caùc peptide baùm treân coät RP-C18 (75μm id.x15cm) ñöôïc thoâi
ra baèng pha linh ñoäng A (0,1% formic acid) vaø B (85% acetonitrile vaø 0,1%
formic acid) vôùi toác ñoä doøng 200nl/phuùt, theo gradient noàng ñoä tuyeán tính töø 5
ñeán 100% pha linh ñoäng B trong 90 phuùt. Coät ngöôïc pha C18 ñöôïc gaén vaøo ñaàu
ñöa maãu Silica Tip keát noái vôùi maùy khoái phoå QSTA®XL baèng nguoàn ESI.
5.1.1.3. Ghi phoå LC-ESI-MS/MS
Maùy khoái phoå QSTA®XL ñöôïc vaän haønh ôû cheá ñoä IDA (Information
Dependent Acquisition) ñeå thöïc hieän vieäc chuyeån töø queùt phoå TOF MS ñôn ñoái
vôùi caùc ion naèm trong daûi khoái (TOF mass) töø 400 ñeán 1200 sang khoái phoå lieân
-133-
Luaän aùn Tieán só Phuï luïc
tieáp treân 3 ion phaân töû coù maät ñoä cao nhaát vaø lôùn hôn 15 ñöôïc xaùc ñònh töï ñoäng
nhôø phaàn meàm BioAnalyst QS v1.8 (AppliedBiosystems). Sai soá veà khoái (mass
tolerance) ñöôïc ñaët ôû möùc 100ppm, thôøi gian khoâng thöïc hieän laïi MS/MS ñoái vôùi
moät maûnh laø 90 giaây. Hieäu ñieän theá ñöôïc ñaët ñeå ion hoùa maãu laø 2200V.
5.1.1.4. Phaân tích phoå khoái peptide baèng phaàn meàm Mascot
Phoå khoái MS/MS ñöôïc phaân tích baèng phaàn meàm Mascot v1.8, ñaây laø
phaàn meàm coù khaû naêng phaân tích döõ lieäu phoå MS/MS ñeå nhaän daïng protein döïa
treân thuaät toaùn Mowse (Perkins DN et al., 1999) ñöôïc phaùt trieån bôûi
MatrixScience (London, UK). Cô sôû döõ lieäu ñöôïc duøng ñeå tìm kieám trong Mascot
laø NCBInr, moät cô sôû döõ lieäu caùc protein khoâng ñoàng nhaát vaø toaøn dieän vôùi
khoaûng treân 1,7 trieäu trình töï khaùc nhau ñöôïc caøi ñaët treân moät maùy tính HP
Proliant Server.
5.1.2. Keát quaû
Saéc kyù ñoà keát quaû phaân taùch thaønh phaàn protein qua heä thoáng saéc kyù loûng
moät chieàu ñöôïc ghi nhaän treân Hình 5.1.
+ Phoå treân cuøng laø phoå ion toång soá hoãn hôïp peptide sau thuyû phaân. Keát
quaû cho thaáy löôïng peptide thu ñöôïc khaù cao (> e5), ñaûm baûo löôïng peptide cho
phaân tích MS/MS.
+ Phoå thöù hai laø phoå queùt TOF MS cuûa hoãn hôïp peptide
+ Phoå thöù ba vaø boán laø phoå MS/MS cuûa hai ion coù m/z töông öùng 549,2 vaø
417,2.
Ñaây laø keát quaû phaân tích vaø tìm kieám protein töø nhöõng peptide ñöôïc phaân
tích MS/MS. Keát quaû tìm kieám chæ ra insulin vôùi soá ñaêng kyù gi:266373 [76] vaø
maûnh peptide ñöôïc tìm thaáy baèng thöïc nghieäm laø FFYTPKTR. Phoå MS/MS cuûa
peptide coù trình töï FFYTPKTR ñöôïc xaùc ñònh baèng thöïc nghieäm.
-134-
Luaän aùn Tieán só Phuï luïc
Hình 5.1. Keát quaû phaân tích vaø nhaän daïng MPI.
-135-
Luaän aùn Tieán só Phuï luïc
Taøi lieäu tham khaûo:
7. Perkins DN, Pappin DJ, Creasy DM, Cottrell JS (1999), Probabilitybased
protein identification by searching sequence databases using mass
spectrometry data. Electrophoresis, 20, pp. 355-356.
8. Cohen S L, Chait BT (1997), Mass spectrometry of whole proteins eluted
from sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis gels.
Analytical Biochemistry, 247, pp. 257-267.
9. Stensballe A, Jensen ON (2001), Simplified sample preparation for mass
spectrometry: in-gel digestion on the maldi probe. Proteomics, 1, pp. 955-66.
5.2. PHUÏ LUÏC 2: Hình aûnh caùc thieát bò chính trong nghieân cöùu
5.2.1. Heä thoáng leân men
Hình 5.2. Heä thoáng leân men mini-jar 5L.
-136-
Luaän aùn Tieán só Phuï luïc
Hình 5.3. Heä thoáng leân men pilot.
5.2.2. Maùy phaù teá baøo microfluidizer
Hình 5.4. Maùy phaù teá baøo Microfluidizer M-110EH-30.
-137-
Luaän aùn Tieán só Phuï luïc
5.2.3. Maùy tinh cheá protein FPLC
(A) (B)
Hình 5.5. Heä thoáng FPLC duøng ñeå tinh cheá protein.
(A) qui moâ phoøng thí nghieäm; (B) qui moâ pilot.
5.2.4. Maùy phaân tích protein RP-HPLC
Hình 5.6. Heä thoáng saéc kyù ngöôïc pha RP-HPLC.
-138-
Luaän aùn Tieán só Phuï luïc
5.2.5. Maùy loïc protein daïng tieáp tuyeán
(A) (B)
Hình 5.7. Heä thoáng loïc tieáp tuyeán protein.
(A) qui moâ phoøng thí nghieäm; (B) qui moâ pilot.
5.2.6. Ly taâm sinh khoái
Hình 5.8. Maùy ly taâm cao toác thu sinh khoái teá baøo qui moâ pilot.
-139-
Luaän aùn Tieán só Phuï luïc
5.2.7. Maùy ño ñöôøng huyeát
Hình 5.9. Maùy ño ñöôøng huyeát Accu-check Active.
5.3. PHUÏ LUÏC 3: Kyù hieäu caùc amino acid theo kyù töï
Baûng 5.1. Baûng kyù hieäu theo kyù töï cuûa amino acid
Amino acid Kyù hieäu Amino acid Kyù hieäu
Isoleucine I Serine S
Leucine L Tyrosine Y
Valine V Tryptophan W
Phenylalanine F Glutamine Q
Methionine M Asparagine N
Cysteine C Histidine H
Alanine A Glutamic acid E
Glycine G Aspartic acid D
Proline P Lysine K
Threonine T Arginine R
(Nguoàn:
-140-
Luaän aùn Tieán só Phuï luïc
5.4. PHUÏ LUÏC 4: Baûng maõ codon öa duøng trong E. coli
Baûng 5.2. Baûng maõ codon öa duøng trong E. coli
Class Class Amino
Acid Codon
I II III
Amino
Acid Codon
I II III
ttt 55.09 29.08 67.14 ctt 9.70 5.56 19.00
Phe
ttc 44.91 70.92 32.86 ctc 10.40 8.03 9.04
tta 10.99 3.44 20.09 cta 3.09 0.83 6.81
Leu
ttg 13.02 5.47 15.05
Leu
ctg 52.79 76.67 29.99
tct 13.26 32.41 19.63 cct 13.71 11.23 28.30
tcc 15.02 26.56 11.34 ccc 11.19 1.63 16.26
tca 10.83 4.79 22.09 cca 18.63 15.25 31.50
Ser
tcg 16.88 7.39 10.60
Pro
ccg 56.47 71.89 23.94
tat 54.42 35.23 69.60 cat 56.80 29.77 61.69
Tyr
tac 45.58 64.77 30.40
His
cac 43.20 70.23 38.31
taa caa 33.40 18.65 37.06
TER
tag
Gln
cag 66.60 81.35 62.94
tgt 40.90 38.85 55.71 cgt 38.99 64.25 26.05
Cys
tgc 59.10 61.15 44.29 cgc 42.23 32.97 21.94
TER tga cga 5.52 1.07 12.80
Trp tgg 100.00 100.00 100.00
Arg
cgg 8.97 0.80 13.62
att 51.20 33.49 47.57 gtt 23.74 39.77 34.33
atc 44.37 65.94 26.65 gtc 22.48 13.45 18.95Ile
ata 4.43 0.57 25.78 gta 14.86 19.97 21.78
Met atg 100.00 100.00 100.00
Val
gtg 38.92 26.81 24.94
-141-
Luaän aùn Tieán só Phuï luïc
act 14.85 29.08 26.83 gct 14.52 27.54 22.86
acc 46.83 53.60 24.45 gcc 27.62 16.14 23.67
aca 10.52 4.67 27.93 gca 19.63 24.01 31.27
Thr
acg 27.81 12.65 20.80
Ala
gcg 38.23 32.30 22.19
aat 40.87 17.25 64.06 gat 62.83 46.05 70.47
Asn
aac 59.13 82.75 35.94
Asp
gac 37.17 53.95 29.53
aaa 75.44 78.55 72.21 gaa 68.33 75.35 66.25
Lys
aag 24.56 21.45 27.79
Glu
gag 31.67 24.65 33.75
agt 13.96 4.52 18.73 ggt 32.91 50.84 31.79
Ser
agc 30.04 24.33 17.61 ggc 43.17 42.83 24.51
aga 1.75 0.62 15.63 gga 9.19 1.97 24.75
Arg
agg 1.54 0.29 9.96
Gly
ggg 14.74 4.36 18.95
(Nguoàn: Heùnaut and Danchin, 1996 [29])
5.5. PHUÏ LUÏC 5: Keát quaû theo doõi haøm löôïng ñöôøng trong
maùu chuoät sau khi tieâm insulin
Baûng 5.3. Keát quaû theo doõi haøm löôïng ñöôøng trong maùu chuoät sau khi tieâm insulin
Haøm löôïng ñöôøng (mg/dl) sau
khi tieâm
Maãu chuoät Troïng
löôïng
chuoät (g)
Noàng
ñoä maãu
(IU/ml) 0 phuùt 30 phuùt 60 phuùt
1. Insulin chuaån (chöùng döông) 25,08 0,02508 231 37 59
2. Dung dòch PBS (chöùng aâm) 20,45 - 155 115 93
3. Maãu Insulin taùi toå hôïp A 18,35 0,01835 331 238 240
4. Maãu insulin taùi toå hôïp B 26,76 0,02676 231 175 188